【摘要】：骨肉瘤是骨科中最為常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,因其發(fā)展迅速、易轉(zhuǎn)移、預(yù)后不良等特點(diǎn),一直備受臨床醫(yī)生重視。骨肉瘤的致病機(jī)制極其復(fù)雜,涉及多基因間的相互作用,是基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)失衡導(dǎo)致發(fā)生細(xì)胞異常代謝的結(jié)果。通�？梢詮霓D(zhuǎn)錄水平和翻譯水平對(duì)基因的表達(dá)進(jìn)行調(diào)控,其中microRNA、lnc RNA及circRNA三種非編碼RNA在調(diào)控基因的表達(dá)方面起到了極為重要的作用。而且這三種非編碼RNA與mRNA之間也有著廣泛的關(guān)聯(lián)作用和合作調(diào)控關(guān)系,幾種RNA共同組成紛繁的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。通過(guò)整體的分析骨肉瘤組織中發(fā)生異常的分子功能調(diào)控網(wǎng)絡(luò),可以為我們明確骨肉瘤的發(fā)生與發(fā)展的分子機(jī)制提供巨大的幫助。miRNA、lncRNA及circRNA可以通過(guò)與靶基因的相互結(jié)合,發(fā)揮基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用。越來(lái)越多的研究表明miRNA、lncRNA及circ RNA在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展及轉(zhuǎn)移等過(guò)程中發(fā)揮了不可或缺的調(diào)節(jié)作用。系統(tǒng)地分析骨肉瘤組織特異非編碼RNA表達(dá)譜,研究其與mRNA、功能蛋白等功能分子相互作用組成的復(fù)雜分子代謝調(diào)控網(wǎng)絡(luò),深入挖掘骨肉瘤發(fā)生、發(fā)展相關(guān)非編碼RNA分子調(diào)控功能機(jī)制,將不僅僅有助于闡釋骨肉瘤早期癌變發(fā)生的分子機(jī)制,還可以為骨肉瘤的早期預(yù)警、靶向治療藥物設(shè)計(jì)和臨床個(gè)性化治療提供理論基礎(chǔ),將有望帶來(lái)重大的經(jīng)濟(jì)效益和社會(huì)效益。本研究通過(guò)全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)分析骨肉瘤中差異表達(dá)基因和miRNA、lncRNA及circRNA,結(jié)合生物信息學(xué)軟件預(yù)測(cè)與骨肉瘤發(fā)生發(fā)展關(guān)系最為密切的非編碼RNA,構(gòu)建骨肉瘤中非編碼RNA的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),并對(duì)構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)中的非編碼RNA所調(diào)控的靶基因進(jìn)行相關(guān)功能分析。通過(guò)分析3對(duì)骨肉瘤組織及其癌旁正常組織的差異非編碼RNA表達(dá)譜,我們?cè)诠侨饬鼋M織中共篩選到差異表達(dá)的lncRNA 163個(gè),其中67個(gè)上調(diào)表達(dá),96個(gè)下調(diào)表達(dá);差異表達(dá)的circRNA 156個(gè),其中64個(gè)上調(diào)表達(dá),92個(gè)下調(diào)表達(dá);差異表達(dá)的miRNA 205個(gè),其中90個(gè)上調(diào)表達(dá),115個(gè)下調(diào)表達(dá)。并利用DIANA-mirPath version 3.0數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)以及RegRNA 2.0 RNA結(jié)構(gòu)在線分析平臺(tái)等相關(guān)軟件,分別構(gòu)建了以lncRNAs為核心和以circ RNAs為核心的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。利用R語(yǔ)言分別對(duì)lncRNAs及circRNAs分子功能調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行功能注釋分析,發(fā)現(xiàn)lncRNAs以及circ RNAs調(diào)控網(wǎng)絡(luò)對(duì)骨肉瘤發(fā)生發(fā)展過(guò)程中的細(xì)胞增殖、分化、凋亡等諸多生物學(xué)過(guò)程均有調(diào)控作用;且與調(diào)節(jié)肌動(dòng)蛋白細(xì)胞骨架、多肽加工以及腫瘤代謝相關(guān)的多種代謝通路均有密切關(guān)聯(lián)。
【圖文】：

吉林大學(xué)碩士學(xué)位論文表 2.2 總 RNA 樣本質(zhì)量檢驗(yàn)樣本OD260/280* OD260/230*濃度（ng/μl） 總量（ng） 質(zhì)量檢驗(yàn)結(jié)果C1 1.97 2.08 770.25 320.34合格C2 1.94 1.83 306.45 128.52合格C3 2.06 2.27 1562.32 499.84合格N1 1.96 1.85 294.30 81.84合格N2 1.95 1.88 350.26 63.84 合格N3 1.98 1.91 320.56 102.40 合格*For spectrophotometer, the O.D. A260 /A280 ratio should be close to 2.0 for pure RNA(ratios between 1.8 and 2.1 are acceptable). The O.D. A260/A230 ratio should be more than 1.8.

中以 lncRNAs 及 circRNAs 為核心的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析27圖2.2.1 差異表達(dá) lncRNA 火山圖 圖2.2.2 差異表達(dá) TUCP 火山圖圖 2.3.1 1LncRNA 差異表達(dá)聚類結(jié)果 圖 2.3
【學(xué)位授予單位】：吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號(hào)】：R738.1

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本文編號(hào)：2683140