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針對(duì)細(xì)胞圖像處理的異構(gòu)多核處理器研究

發(fā)布時(shí)間:2020-07-18 17:00
【摘要】:隨著細(xì)胞圖像處理在臨床醫(yī)療診斷中的廣泛應(yīng)用,細(xì)胞圖像處理的實(shí)時(shí)性要求越來(lái)越高。由于同構(gòu)多核處理器在處理細(xì)胞圖像時(shí)運(yùn)算速度提升受限,因此研究含有不同加速指令的異構(gòu)多核處理器對(duì)細(xì)胞圖像處理具有重要意義。通過(guò)對(duì)多核處理器及細(xì)胞圖像處理算法的研究,設(shè)計(jì)了一款應(yīng)用于細(xì)胞圖像處理的異構(gòu)多核處理器。該處理器共有八個(gè)內(nèi)核,每個(gè)內(nèi)核均是兩級(jí)流水處理器,第0個(gè)內(nèi)核前設(shè)置輸入緩沖作為細(xì)胞圖像的緩存,八個(gè)內(nèi)核通過(guò)交叉開關(guān)矩陣訪問(wèn)具有四個(gè)存儲(chǔ)塊的共享數(shù)據(jù)存儲(chǔ)池。交叉開關(guān)矩陣對(duì)內(nèi)核地址低的數(shù)據(jù)進(jìn)行優(yōu)先編碼,當(dāng)兩個(gè)內(nèi)核同時(shí)訪問(wèn)同一存儲(chǔ)塊時(shí),地址較低的內(nèi)核優(yōu)先進(jìn)行訪問(wèn)。多核處理器采用了無(wú)鎖結(jié)構(gòu)的生產(chǎn)者-消費(fèi)者并行編程模型,實(shí)現(xiàn)多個(gè)內(nèi)核存儲(chǔ)及讀取數(shù)據(jù)的配合。針對(duì)細(xì)胞圖像處理的算法選用K近鄰平滑濾波、全等級(jí)直方圖灰度拉伸、高斯模糊、USM銳化、最大類間方差法及連通域標(biāo)記等算法,并在不同內(nèi)核中設(shè)計(jì)Absort指令、Inireg指令、Sumreg指令、Sum4指令、Abs指令、Mulsub指令及Mulpow指令對(duì)算法進(jìn)行加速,使得運(yùn)行K近鄰平滑濾波算法的內(nèi)核速度提升了2.66倍,運(yùn)行全等級(jí)直方圖灰度拉伸及高斯模糊算法內(nèi)核的速度提升了1.21倍,運(yùn)行USM銳化算法內(nèi)核的速度提升了1.36倍,運(yùn)行最大類間方差法內(nèi)核的速度提升了1.17倍。異構(gòu)多核處理器在UMC110nm的工藝下完成仿真及綜合,其在各個(gè)內(nèi)核運(yùn)行對(duì)應(yīng)算法時(shí)處理細(xì)胞圖像速度為每秒203.11幀,相比于單核結(jié)構(gòu)速度提升了10.83倍,最高時(shí)鐘頻率為136.98MHz,總面積為19.0mm~2。
【學(xué)位授予單位】:西安理工大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:TP391.41;R318
【圖文】:

架構(gòu)圖,架構(gòu),處理器


圖 1-1 Mr.Wolf 處理器架構(gòu)Fig.1-1 The Mr.Wolf Processor Architecture方發(fā)達(dá)國(guó)家相比,國(guó)內(nèi)對(duì)細(xì)胞圖像自動(dòng)檢測(cè)分析的研究起步較晚。80 展通過(guò)細(xì)胞進(jìn)行診斷的研究,90 年代初期,癌細(xì)胞視覺(jué)檢測(cè)和識(shí)別。經(jīng)過(guò)了二十余年的發(fā)展,我國(guó)細(xì)胞圖像自動(dòng)檢測(cè)技術(shù)也有了一定的 年,張桂梅等人針對(duì)醫(yī)學(xué)圖像灰度不均勻的問(wèn)題提出了新的分割模方法,將其在 CPU 中運(yùn)行,發(fā)現(xiàn)可以分割圖像的效率以及準(zhǔn)確度都2016 年,北京郵電大學(xué)針對(duì)癌細(xì)胞檢測(cè)對(duì) Alex Net 進(jìn)行了改進(jìn),提網(wǎng)絡(luò)更加穩(wěn)定,規(guī)?s小且提升了速度[28]。2018 年,楊金鑫等人針確細(xì)胞的問(wèn)題,提出了一種基于超像素分割的 NLM 去噪算法,以降低像的影響[29]。2018 年,南京理工大學(xué)朱珊珊等人發(fā)現(xiàn) CPU 串行處理里葉變換的需求,處理時(shí)間較長(zhǎng),而光學(xué)相干層析技術(shù)在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)著重要的作用,而活體成像對(duì)實(shí)時(shí)性要求較高,因此考慮將 CUDA 到數(shù)據(jù)處理中,發(fā)現(xiàn) CUDA 這種 CPU+GPU 的混合編程技術(shù)使處理。

框圖,內(nèi)部功能,框圖,內(nèi)核


圖 2-1 LPC5411x 內(nèi)部功能框圖Fig.2-1 The LPC5411x Internal Functional Block Diagram核處理器流處理的方式處理數(shù)據(jù),將不同的算法分配在各個(gè)內(nèi)內(nèi)核的數(shù)據(jù),不同內(nèi)核間僅有細(xì)胞圖像數(shù)據(jù)的傳輸,存儲(chǔ)器中,當(dāng)一個(gè)內(nèi)核處理完數(shù)據(jù)存入共享存儲(chǔ)器多核處理器分為兩類,一類為集中式共享存儲(chǔ)多核ultiprocessors,SMP),另一類為多核架構(gòu)采用ed Memory,DSM),內(nèi)核的數(shù)量決定了兩類存儲(chǔ)器多核處理器均采用 SMP 結(jié)構(gòu),其架構(gòu)如圖 2-2 所示內(nèi)核,通常數(shù)量小于等于 32 個(gè)。對(duì)于內(nèi)核數(shù)量較少個(gè)集中式的存儲(chǔ)器,并且每一個(gè)內(nèi)核對(duì)所有存儲(chǔ)器構(gòu)有時(shí)也被稱為一致性存儲(chǔ)訪問(wèn)多核處理器,所有內(nèi)

最大類間方差,人像,灰度圖,處理效果


(a)灰度圖 (b)最大類間方差法處理效果 (c)Canny 算子處理效果圖 3-4 人像灰度圖經(jīng)最大類間方差法及 Canny 算子處理效果圖Fig.3-4 Portrait Grayscale Image Processed by OTSU and Canny Operator(a)灰度圖 (b)最大類間方差法處理效果 (c)Canny 算子處理效果圖 3-5 細(xì)胞灰度圖經(jīng)最大類間方差法及 Canny 算子處理效果圖Fig.3-5 Cell Grayscale Image Processed by OTSU and Canny Operator圖 3-4(a)是一幅較為復(fù)雜的人像灰度圖,可以從圖 3-4(b)及圖 3-4(c)看出 Cann算子分割出了人像圖的細(xì)節(jié),最大類間方差法對(duì)人像圖的所有細(xì)節(jié)處理的效果都不如Canny 算子,因此對(duì)于這種較為復(fù)雜的圖像最大類間方差法并不占優(yōu)勢(shì)。圖 3-5(a)是一

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本文編號(hào):2761172

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