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神經(jīng)母細(xì)胞瘤中RHOB的作用及Perifosine處理后泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)的研究

發(fā)布時(shí)間:2022-08-13 16:44
  目的:神經(jīng)母細(xì)胞瘤(neuroblastoma,NB)是嬰兒期最常見(jiàn)的惡性實(shí)體腫瘤,目前化療耐藥是高危組神經(jīng)母細(xì)胞瘤患者的治療難點(diǎn)。研究發(fā)現(xiàn)Akt抑制劑Perifosine在體內(nèi)、外實(shí)驗(yàn)中均能誘導(dǎo)神經(jīng)母細(xì)胞瘤細(xì)胞死亡,并能提高神經(jīng)母細(xì)胞瘤細(xì)胞對(duì)化療藥物的敏感性,且在治療復(fù)發(fā)難治性神經(jīng)母細(xì)胞瘤的臨床試驗(yàn)中呈現(xiàn)良好的效果。近年來(lái),多項(xiàng)研究報(bào)道Perifosine除抑制Akt活性外,還能夠通過(guò)其他作用機(jī)制引起細(xì)胞死亡。為了深入探索Perifosine新的作用機(jī)制,課題組前期在一個(gè)神經(jīng)母細(xì)胞瘤細(xì)胞系SK-N-AS(AS)細(xì)胞中進(jìn)行的全蛋白質(zhì)組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)Perifosine處理后RHO相關(guān)GTP結(jié)合蛋白B(Rho-related GTP-binding protein B,RHOB)表達(dá)水平升高。RHOB屬于RHO亞家族,廣泛分布于細(xì)胞內(nèi),調(diào)節(jié)細(xì)胞骨架、細(xì)胞黏附和細(xì)胞凋亡等。而RHOB在神經(jīng)母細(xì)胞瘤中的作用尚無(wú)報(bào)道。本研究第一部分旨在探索RHOB在神經(jīng)母細(xì)胞瘤中對(duì)Perifosine及化療藥物作用的影響。泛素化修飾是一種重要的蛋白翻譯后修飾,泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)是研究蛋白質(zhì)調(diào)控的重要方法,在前期總蛋... 

【文章頁(yè)數(shù)】:123 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略語(yǔ)
第一部分:神經(jīng)母細(xì)胞瘤中RHOB不同表達(dá)水平對(duì)Perifosine或化療藥物作用的影響
    1 前言
    2 材料和方法
        2.1 主要試劑和儀器
            2.1.1 主要試劑
            2.1.2 主要儀器
        2.2 實(shí)驗(yàn)方法
            2.2.1 細(xì)胞培養(yǎng)
            2.2.2 siRNA及質(zhì)粒轉(zhuǎn)染
            2.2.3 藥物處理
            2.2.4 RT-PCR檢測(cè)mRNA水平
            2.2.5 Westernblot檢測(cè)蛋白水平
            2.2.6 Incucyte變焦活細(xì)胞成像系統(tǒng)
            2.2.7 MTS檢測(cè)細(xì)胞增殖
            2.2.8 流式細(xì)胞儀檢測(cè)細(xì)胞周期及細(xì)胞凋亡
            2.2.9 動(dòng)物實(shí)驗(yàn)
            2.2.10 免疫組織化學(xué)染色
            2.2.11 統(tǒng)計(jì)分析
    3 結(jié)果
        3.1 Perifosine處理后神經(jīng)母細(xì)胞瘤細(xì)胞及腫瘤組織中RHOB的表達(dá)水平升高
        3.2 RHOB不同表達(dá)水平與神經(jīng)母細(xì)胞瘤患者臨床病理相關(guān)性分析
            3.2.1 RHOB在神經(jīng)母細(xì)胞起源但分化程度不同的腫瘤中表達(dá)水平的比較
            3.2.2 RHOB基因表達(dá)水平與神經(jīng)母細(xì)胞瘤患者臨床分期相關(guān)性分析
            3.2.3 RHOB基因表達(dá)水平與神經(jīng)母細(xì)胞瘤患者腫瘤組織中MycN基因狀態(tài)的關(guān)系
            3.2.4 RHOB基因表達(dá)水平與神經(jīng)母細(xì)胞瘤患者臨床預(yù)后的關(guān)系
            3.2.5 在節(jié)細(xì)胞神經(jīng)瘤和神經(jīng)母細(xì)胞瘤組織標(biāo)本中,RHOB蛋白表達(dá)水平的比較
        3.3 RHOB不同表達(dá)水平對(duì)AS細(xì)胞增殖及存活的影響
            3.3.1 沉默RHOB對(duì)AS細(xì)胞增殖的影響
            3.3.2 過(guò)表達(dá)RHOB對(duì)AS細(xì)胞增殖及存活的影響
        3.4 RHOB不同表達(dá)水平對(duì)Perifosine作用的影響
            3.4.1 在AS細(xì)胞中,沉默RHOB對(duì)Perifosine作用的影響
            3.4.2 在AS細(xì)胞中,過(guò)表達(dá)RHOB對(duì)Perifosine作用的影響
        3.5 RHOB不同表達(dá)水平對(duì)AS細(xì)胞化療敏感性的影響
            3.5.1 RHOB不同表達(dá)水平對(duì)AS細(xì)胞化療敏感性的影響-依托泊苷(Etoposide)
            3.5.2 RHOB不同表達(dá)水平對(duì)AS細(xì)胞化療敏感性的影響-長(zhǎng)春新堿(VCR)
            3.5.3 RHOB不同表達(dá)水平對(duì)AS細(xì)胞化療敏感性的影響-阿霉素(ADR)
            3.5.4 RHOB不同表達(dá)水平對(duì)AS細(xì)胞化療敏感性的影響..順鉑(Cisplatin)
    4 討論
    5 結(jié)論
    參考文獻(xiàn)
第二部分:Perifosine治療神經(jīng)母細(xì)胞瘤的泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)研究
    1 前言
    2 材料和方法
        2.1 主要試劑和儀器
            2.1.1 主要試劑
            2.1.2 主要儀器
        2.2 實(shí)驗(yàn)方法
            2.2.1 細(xì)胞培養(yǎng)
            2.2.2 SILAC標(biāo)記
            2.2.3 蛋白提取
            2.2.4 酶解消化
            2.2.5 HPLC分餾
            2.2.6 親和富集
            2.2.7 液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)(LC-MS/MS)
            2.2.8 數(shù)據(jù)分析
            2.2.9 生物信息學(xué)分析
            2.2.10 免疫共沉淀
            2.2.11 統(tǒng)計(jì)分析
    3 結(jié)果
        3.1 Perifosine處理AS細(xì)胞后泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)的定量分析
        3.2 Perifosine處理AS細(xì)胞后泛素化蛋白的Motif分析
        3.3 Perifosine處理AS細(xì)胞后差異表達(dá)的泛素化蛋白分析
            3.3.1 亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)定位分析
            3.3.2 GO(基因本體)分析
            3.3.3 富集分析
            3.3.4 基于富集分析的聚類分析
        3.4 Perifosine處理AS細(xì)胞后HMGCR泛素化水平升高
    4 討論
    5 結(jié)論
    參考文獻(xiàn)
本研究創(chuàng)新性的自我評(píng)價(jià)
綜述
    參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)介


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Akt Inhibitor Perifosine Prevents Epileptogenesis in a Rat Model of Temporal Lobe Epilepsy[J]. Feng Zhu,Jiejing Kai,Linglin Chen,Meiling Wu,Jingyin Dong,Qingmei Wang,Ling-Hui Zeng.  Neuroscience Bulletin. 2018(02)
[2]Role of E3 ubiquitin ligases in lung cancer[J]. Barbara C Snoek,Leonie HAM de Wilt,Gerrit Jansen,Godefridus J Peters.  World Journal of Clinical Oncology. 2013(03)



本文編號(hào):3677389

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