腫瘤的發(fā)生發(fā)展伴隨著基因組突變的積累和被選擇,第二代高通量測序技術(shù)的發(fā)展使得腫瘤研究步入了基因組學(xué)時代。腦部腫瘤由于樣本獲取不易,成為腫瘤研究中的難點。為了拓展我們對腦部腫瘤形成機制的認(rèn)識,結(jié)合外顯子組測序技術(shù),我們分別對Ⅱ型神經(jīng)纖維瘤和脊索瘤進(jìn)行了初步的研究。神經(jīng)纖維瘤指起源于神經(jīng)鞘細(xì)胞的一種良性腫瘤,當(dāng)神經(jīng)纖維瘤多發(fā)或伴發(fā)全身其它系統(tǒng)疾患時,稱為神經(jīng)纖維瘤病（Neurofibromatosis, NF）,該病有三種類型,其中Ⅱ型神經(jīng)纖維瘤�。∟eurofibromatosis type2, NF2）是由于NF2抑癌基因突變導(dǎo)致的常染色體顯性遺傳疾病。通過對一例散發(fā)患者的Ⅱ型神經(jīng)纖維瘤樣本進(jìn)行了候選基因Sanger測序發(fā)現(xiàn)在NF2基因11號外顯子區(qū)域存在一個已報道的無義突變。克隆測序結(jié)果表明該突變在患者不同胚層來源的樣本中的均存在,還發(fā)現(xiàn)該患者在克隆測序區(qū)域就存在較多的低頻突變位點,因此我們對該患者及其父母的口腔樣本進(jìn)行了外顯子組測序,在外顯子組中也觀察到患者的低頻突變位點要多于患者父母。通過對比患者和患者父母外顯子組測序結(jié)果,在鈣釋放激活鈣調(diào)節(jié)蛋白3（calcium release... 

【文章頁數(shù)】：56 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
致謝
摘要
Abstract
第一章 緒論
    1 體細(xì)胞突變和腫瘤發(fā)生
        1.1 體細(xì)胞突變
        1.2 體細(xì)胞突變對腫瘤發(fā)生的影響
    2 高通量測序技術(shù)
        2.1 測序技術(shù)的發(fā)展
        2.2 二代測序技術(shù)基本原理和對比
        2.3 外顯子組測序技術(shù)及其應(yīng)用
    3 腫瘤基因組研究
第二章 Ⅱ型神經(jīng)纖維瘤病的外顯子組研究
    1 引言
        1.1 Ⅱ型神經(jīng)纖維瘤病的研究背景
        1.2 Ⅱ型神經(jīng)纖維瘤病的研究進(jìn)展
        1.3 研究目的和技術(shù)路線
    2 材料和方法
        2.1 樣本采集
        2.2 DNA提取
        2.3 PCR擴增分析
        2.4 克隆測序
        2.5 外顯子組測序
        2.6 測序數(shù)據(jù)分析和驗證
    3 研究結(jié)果和分析
        3.1 NF2基因外顯子擴增定位致病突變位點
        3.2 克隆測序量化突變位點在不同組織中的比率
        3.3 外顯子組測序結(jié)果概況
        3.4 NF2基因組編碼區(qū)域測序結(jié)果驗證突變位點
        3.5 患者家系外顯子組區(qū)域突變率具有明顯差異
        3.6 De novo突變分析發(fā)現(xiàn)患者ORAI3基因存在一個錯義突變
        3.7 定位人群稀有純合位點
    4 結(jié)論
    5 討論
        5.1 ORAI3對DNA修復(fù)系統(tǒng)及腫瘤發(fā)生的影響
        5.2 低頻突變的定位和驗證
        5.3 低頻突變率的統(tǒng)計和對比
第三章 脊索瘤的外顯子組研究
    1 引言
        1.1 脊索瘤研究背景
        1.2 脊索瘤研究進(jìn)展
        1.3 研究目的和技術(shù)路線
    2 材料和方法
        2.1 樣本采集和DNA提取
        2.2 復(fù)發(fā)腫瘤樣本的全基因組擴增
        2.3 全基因組SNP分型和數(shù)據(jù)分析
        2.4 外顯子組測序和分析
        2.5 等位基因型不平衡性檢測
        2.6 候選位點驗證
    3 研究結(jié)果和分析
        3.1 SNP芯片分型結(jié)果分析
        3.2 外顯子組測序結(jié)果分析
    4 結(jié)論
    5 討論
        5.1 脊索瘤特有突變的檢測
參考文獻(xiàn)
附錄
作者簡介及在學(xué)期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果



本文編號：3663147