中型無(wú)綠藻不同致病性菌株的差異表達(dá)蛋白篩選及相關(guān)蛋白功能研究
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【摘要】:目的研究不同致病性中型無(wú)綠藻菌株的蛋白組學(xué)差異,并對(duì)差異蛋白進(jìn)行功能研究,從而探索無(wú)綠藻的致病機(jī)制。方法應(yīng)用液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜法(LC-MS/MS),通過(guò)同位素標(biāo)記相對(duì)和絕對(duì)定量技術(shù)(iTRAQ),測(cè)定中型無(wú)綠藻環(huán)境株(基因1型)與中型無(wú)綠藻臨床分離株(基因2型)之間的差異表達(dá)蛋白,并應(yīng)用生物信息學(xué)技術(shù)對(duì)鑒定得到的差異表達(dá)蛋白進(jìn)行功能分析。結(jié)果共鑒定得到245個(gè)不同表達(dá)蛋白,其中表達(dá)差異1.5倍的蛋白共有35個(gè),包括16個(gè)上調(diào)蛋白和19個(gè)下調(diào)蛋白;生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),在致病的基因2型中型無(wú)綠藻菌株中,差異表達(dá)蛋白的功能主要涉及抑制能量產(chǎn)生與轉(zhuǎn)化,降低碳水化合物的轉(zhuǎn)運(yùn)和代謝以及加強(qiáng)翻譯等生物學(xué)過(guò)程。結(jié)論無(wú)綠藻的致病涉及多種蛋白表達(dá)的改變,iTRAQ技術(shù)可以有效篩選出基因1型與基因2型中型無(wú)綠藻的差異表達(dá)蛋白,對(duì)進(jìn)一步探索無(wú)綠藻病的發(fā)病機(jī)制,干預(yù)或治療無(wú)綠藻病具有重要意義,并為研究無(wú)綠藻感染治療靶點(diǎn)提供了理論基礎(chǔ)。
【作者單位】: 復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院皮膚科真菌室;
【關(guān)鍵詞】: 中型無(wú)綠藻 毒力因子 蛋白組學(xué) 液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜法
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(81573056)
【分類號(hào)】:R756
【正文快照】: 無(wú)綠藻是一種普遍存在于自然界的單細(xì)胞、無(wú)葉綠素的微藻類生物,屬于小球藻科,可導(dǎo)致人類和動(dòng)物的感染[1]。無(wú)綠藻侵入免疫缺陷或外傷的個(gè)體,可引起致命的感染。目前無(wú)綠藻被確認(rèn)為6個(gè)種,其中,中型無(wú)綠藻與小型無(wú)綠藻具有致病性。根據(jù)生化、血清學(xué)以及遺傳學(xué)的分析,中型無(wú)綠藻
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,本文編號(hào):818674
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