全基因組外顯子測(cè)序搜尋常染色體顯性遺傳性單純性少毛癥致病基因
發(fā)布時(shí)間:2017-06-02 19:20
本文關(guān)鍵詞:全基因組外顯子測(cè)序搜尋常染色體顯性遺傳性單純性少毛癥致病基因,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:研究背景遺傳性少毛癥是一組表現(xiàn)為毛發(fā)持續(xù)性部分或完全缺失的遺傳性疾病,該組疾病具有臨床和遺傳上的異質(zhì)性。通常會(huì)在出生時(shí)或在嬰幼兒時(shí)期開始發(fā)病,往往持續(xù)終生;颊哳^發(fā)、眉毛、睫毛、體毛、陰毛和腋毛均可受累。該組疾病根據(jù)遺傳方式不同可分為常染色體顯性遺傳、常染色體隱性遺傳和X連鎖顯性或隱性遺傳。常染色體顯性遺傳性單純性少毛癥(ADHS)是一種以毛囊微型化為特征的常染色體顯性遺傳性脫發(fā)疾病。近年來關(guān)于ADHS的分子遺傳學(xué)研究已經(jīng)取得了重要的進(jìn)展,其三個(gè)不同的亞型分別定位在APCDD1(18p11.22),RPL21(13q12)和SNRPE(1q31.3-1q41),但其發(fā)病機(jī)制尚未完全明確。 目的確定1個(gè)常染色體顯性遺傳性禿發(fā)/少毛癥大家系的致病基因,從分子遺傳學(xué)水平闡明其發(fā)病機(jī)制,為下一步開展基因診斷和遺傳咨詢奠定基礎(chǔ)。 方法(1)從該家系中挑選出2個(gè)臨床表型典型的患者和2個(gè)家系內(nèi)對(duì)照,進(jìn)行全基因組外顯子測(cè)序,獲得全基因組外顯子序列;(2)通過逐步濾過dbSNP數(shù)據(jù)庫和家系內(nèi)對(duì)照中的常見突變,并且結(jié)合前期定位信息獲得候選基因集;(3)利用Sanger測(cè)序在家系內(nèi)(8個(gè)患者和8個(gè)正常人)中對(duì)候選基因集的突變位點(diǎn)進(jìn)行測(cè)序驗(yàn)證,分析突變點(diǎn)是否與疾病共分離,獲得候選基因。 結(jié)果(1)全基因組外顯子測(cè)序得到119個(gè)變異位點(diǎn),后通過Sanger測(cè)序在排除了曾定位的染色體2p25.1-2p23.2上唯一的突變(NM_145693:exon12:c.1645AG: p.K549E)。(2)在該其它一些可能的基因(RPL21、APCDD1、SNRPE)尋找可能的致病突變,最終在該家系全部患者及一個(gè)正常人的RPL21基因上發(fā)現(xiàn)一個(gè)雜合錯(cuò)義突變(NM_000982:exon3:c.95GA:p.R32Q),與之前報(bào)道的兩個(gè)中國HHS家系中檢測(cè)到的突變相同。(3)隨訪發(fā)現(xiàn),該家族中1例患者死于不明原因的吞咽困難,2例確診患有食管癌。 結(jié)論(1)RPL21基因上的雜合錯(cuò)義突變(c.742CA,p.H248N)是一例ADHS的分子遺傳學(xué)發(fā)病基礎(chǔ)。(2)一例攜帶該突變的表型正常的家庭成員可能是一個(gè)不完全外顯的患者。(3)RPL21基因突變還可能與該家族食管癌發(fā)病有關(guān)。
【關(guān)鍵詞】:常染色體顯性 遺傳性少毛癥 突變 RPL21基因
【學(xué)位授予單位】:安徽醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R758.71
【目錄】:
- 目錄4-6
- 英文縮略詞表6-7
- 中文摘要7-9
- Abstract9-11
- 1. 引言11-14
- 2. 材料與方法14-30
- 2.1 研究對(duì)象14-16
- 2.2 實(shí)驗(yàn)試劑16-18
- 2.2.1 DNA提取試劑16
- 2.2.2 DNA標(biāo)準(zhǔn)化試劑16
- 2.2.3 電泳試劑16-17
- 2.2.4 全基因組外顯子測(cè)序試劑17
- 2.2.5 PCR擴(kuò)增試劑17
- 2.2.6 PCR產(chǎn)物純化和測(cè)序試劑17-18
- 2.3 實(shí)驗(yàn)儀器18-21
- 2.3.1 臨床資料獲取及毛發(fā)掃描電鏡檢查18
- 2.3.2 DNA提取器材18-19
- 2.3.3 檢測(cè)濃度儀器19
- 2.3.4 電泳的儀器19
- 2.3.5 全基因組外顯子測(cè)序儀器19-20
- 2.3.6 PCR儀器20-21
- 2.3.7 Sanger測(cè)序儀器21
- 2.4 分析軟件和電子數(shù)據(jù)庫查詢21
- 2.5 實(shí)驗(yàn)方法和步驟21-30
- 2.5.1 毛發(fā)標(biāo)本采集及掃描電鏡檢查22
- 2.5.2 基因組DNA的提取22-23
- 2.5.3 DNA濃度標(biāo)準(zhǔn)化23
- 2.5.4 全基因組外顯子測(cè)序23-25
- 2.5.5 LPIN1基因和RPL21基因引物的設(shè)計(jì)和合成25-27
- 2.5.6 PCR反應(yīng)27-28
- 2.5.7 PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳28-29
- 2.5.8 PCR產(chǎn)物純化29
- 2.5.9 PCR片段測(cè)序29-30
- 3. 實(shí)驗(yàn)結(jié)果30-38
- 3.1 全基因組外顯子測(cè)序結(jié)果30-37
- 3.2 致病基因突變檢測(cè)結(jié)果37-38
- 4. 討論38-41
- 5. 結(jié)論41
- 6. 參考文獻(xiàn)41-45
- 附錄45-47
- 致謝47-48
- 課題綜述 遺傳性秀發(fā)/少毛癥研究進(jìn)展48-63
- 參考文獻(xiàn)58-63
【共引文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條
1 陸平;李云鵬;高巖;劉景波;趙文杰;劉言;邢春艷;;原癌基因Pim-3在胰腺癌組織中的表達(dá)及其與胰腺癌細(xì)胞增殖的相關(guān)性[J];癌變.畸變.突變;2014年01期
2 彭正科;劉娜;黃大毛;唐發(fā)清;;二亞硝基哌嗪上調(diào)HSP70-2促進(jìn)鼻咽癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移[J];腫瘤;2014年01期
3 Ying-Yi Li;Naofumi Mukaida;;Pathophysiological roles of Pim-3 kinase in pancreatic cancer development and progression[J];World Journal of Gastroenterology;2014年28期
本文關(guān)鍵詞:全基因組外顯子測(cè)序搜尋常染色體顯性遺傳性單純性少毛癥致病基因,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
,本文編號(hào):416322
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