全基因組外顯子測序搜尋常染色體顯性遺傳性單純性少毛癥致病基因
發(fā)布時間:2017-06-02 19:20
本文關鍵詞:全基因組外顯子測序搜尋常染色體顯性遺傳性單純性少毛癥致病基因,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:研究背景遺傳性少毛癥是一組表現為毛發(fā)持續(xù)性部分或完全缺失的遺傳性疾病,該組疾病具有臨床和遺傳上的異質性。通常會在出生時或在嬰幼兒時期開始發(fā)病,往往持續(xù)終生;颊哳^發(fā)、眉毛、睫毛、體毛、陰毛和腋毛均可受累。該組疾病根據遺傳方式不同可分為常染色體顯性遺傳、常染色體隱性遺傳和X連鎖顯性或隱性遺傳。常染色體顯性遺傳性單純性少毛癥(ADHS)是一種以毛囊微型化為特征的常染色體顯性遺傳性脫發(fā)疾病。近年來關于ADHS的分子遺傳學研究已經取得了重要的進展,其三個不同的亞型分別定位在APCDD1(18p11.22),RPL21(13q12)和SNRPE(1q31.3-1q41),但其發(fā)病機制尚未完全明確。 目的確定1個常染色體顯性遺傳性禿發(fā)/少毛癥大家系的致病基因,從分子遺傳學水平闡明其發(fā)病機制,為下一步開展基因診斷和遺傳咨詢奠定基礎。 方法(1)從該家系中挑選出2個臨床表型典型的患者和2個家系內對照,進行全基因組外顯子測序,獲得全基因組外顯子序列;(2)通過逐步濾過dbSNP數據庫和家系內對照中的常見突變,并且結合前期定位信息獲得候選基因集;(3)利用Sanger測序在家系內(8個患者和8個正常人)中對候選基因集的突變位點進行測序驗證,分析突變點是否與疾病共分離,獲得候選基因。 結果(1)全基因組外顯子測序得到119個變異位點,后通過Sanger測序在排除了曾定位的染色體2p25.1-2p23.2上唯一的突變(NM_145693:exon12:c.1645AG: p.K549E)。(2)在該其它一些可能的基因(RPL21、APCDD1、SNRPE)尋找可能的致病突變,最終在該家系全部患者及一個正常人的RPL21基因上發(fā)現一個雜合錯義突變(NM_000982:exon3:c.95GA:p.R32Q),與之前報道的兩個中國HHS家系中檢測到的突變相同。(3)隨訪發(fā)現,該家族中1例患者死于不明原因的吞咽困難,2例確診患有食管癌。 結論(1)RPL21基因上的雜合錯義突變(c.742CA,p.H248N)是一例ADHS的分子遺傳學發(fā)病基礎。(2)一例攜帶該突變的表型正常的家庭成員可能是一個不完全外顯的患者。(3)RPL21基因突變還可能與該家族食管癌發(fā)病有關。
【關鍵詞】:常染色體顯性 遺傳性少毛癥 突變 RPL21基因
【學位授予單位】:安徽醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R758.71
【目錄】:
- 目錄4-6
- 英文縮略詞表6-7
- 中文摘要7-9
- Abstract9-11
- 1. 引言11-14
- 2. 材料與方法14-30
- 2.1 研究對象14-16
- 2.2 實驗試劑16-18
- 2.2.1 DNA提取試劑16
- 2.2.2 DNA標準化試劑16
- 2.2.3 電泳試劑16-17
- 2.2.4 全基因組外顯子測序試劑17
- 2.2.5 PCR擴增試劑17
- 2.2.6 PCR產物純化和測序試劑17-18
- 2.3 實驗儀器18-21
- 2.3.1 臨床資料獲取及毛發(fā)掃描電鏡檢查18
- 2.3.2 DNA提取器材18-19
- 2.3.3 檢測濃度儀器19
- 2.3.4 電泳的儀器19
- 2.3.5 全基因組外顯子測序儀器19-20
- 2.3.6 PCR儀器20-21
- 2.3.7 Sanger測序儀器21
- 2.4 分析軟件和電子數據庫查詢21
- 2.5 實驗方法和步驟21-30
- 2.5.1 毛發(fā)標本采集及掃描電鏡檢查22
- 2.5.2 基因組DNA的提取22-23
- 2.5.3 DNA濃度標準化23
- 2.5.4 全基因組外顯子測序23-25
- 2.5.5 LPIN1基因和RPL21基因引物的設計和合成25-27
- 2.5.6 PCR反應27-28
- 2.5.7 PCR產物瓊脂糖凝膠電泳28-29
- 2.5.8 PCR產物純化29
- 2.5.9 PCR片段測序29-30
- 3. 實驗結果30-38
- 3.1 全基因組外顯子測序結果30-37
- 3.2 致病基因突變檢測結果37-38
- 4. 討論38-41
- 5. 結論41
- 6. 參考文獻41-45
- 附錄45-47
- 致謝47-48
- 課題綜述 遺傳性秀發(fā)/少毛癥研究進展48-63
- 參考文獻58-63
【共引文獻】
中國期刊全文數據庫 前3條
1 陸平;李云鵬;高巖;劉景波;趙文杰;劉言;邢春艷;;原癌基因Pim-3在胰腺癌組織中的表達及其與胰腺癌細胞增殖的相關性[J];癌變.畸變.突變;2014年01期
2 彭正科;劉娜;黃大毛;唐發(fā)清;;二亞硝基哌嗪上調HSP70-2促進鼻咽癌細胞轉移[J];腫瘤;2014年01期
3 Ying-Yi Li;Naofumi Mukaida;;Pathophysiological roles of Pim-3 kinase in pancreatic cancer development and progression[J];World Journal of Gastroenterology;2014年28期
本文關鍵詞:全基因組外顯子測序搜尋常染色體顯性遺傳性單純性少毛癥致病基因,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
,本文編號:416322
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