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泛發(fā)性膿皰型銀屑病的轉(zhuǎn)錄組學(xué)及炎癥因子變化的研究

發(fā)布時(shí)間:2025-02-14 20:54
  背景及研究目的泛發(fā)性膿皰型銀屑病(Generalized Pustular Psoriasis,GPP)是一種罕見的、周期性發(fā)作的炎癥性皮膚疾病,臨床上表現(xiàn)為出現(xiàn)在紅斑或正常皮膚上的急性或亞急性全身性無(wú)菌膿皰。GPP可以累及多個(gè)系統(tǒng),嚴(yán)重時(shí)可危及生命。GPP最常見于中年人,也可發(fā)生于兒童。目前,GPP的發(fā)病機(jī)制仍不清楚,治療方法仍未達(dá)成共識(shí),因此亟需開展深入研究。本課題擬對(duì)GPP病人在不同時(shí)期外周血中基因及炎癥因子蛋白的表達(dá)變化情況進(jìn)行系統(tǒng)研究,以期發(fā)現(xiàn)關(guān)鍵基因及調(diào)控通路,為新的GPP的治療靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)提供線索和依據(jù)。研究方法1.招募5名GPP患者,在其初次確診時(shí)入組并進(jìn)行了長(zhǎng)達(dá)6個(gè)月的阿維A治療與觀察。在GPP患者膿皰期(治療前),膿皰消退期(治療后2周)和穩(wěn)定期(治療維持6個(gè)月)三個(gè)時(shí)間點(diǎn)進(jìn)行了外周血采樣;利用RNA測(cè)序(RNA Sequencing,RNA-Seq)方法對(duì)這些患者外周單核細(xì)胞(Peripheral Blood Mononuclear Cell,PBMC)的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行分析;通過(guò)實(shí)時(shí)定量PCR實(shí)驗(yàn)對(duì)RNA-Seq分析結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證;利用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,獲得治療...

【文章頁(yè)數(shù)】:101 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

圖1.1?GPP患者在急性發(fā)作期(TO)、治療開始后2周(T1)和治療開始后6月(T2)時(shí)樣??

圖1.1?GPP患者在急性發(fā)作期(TO)、治療開始后2周(T1)和治療開始后6月(T2)時(shí)樣??

.???患者性別?發(fā)病年齡/病?年齡(歲)?PsAa?PsVb?GPP評(píng)分???程(年)?TO?T1?T2??P1?男?2W13?34?12?5?2??P2?女?64/3?67?+?+?15?7?3??P3?女?24/0?24?-?+?15?6?2??P4?女?37/1?38?+....


圖1.2?RNA電泳圖??HeLa表示HeLa細(xì)胞RNA對(duì)照,各樣本條帶清晰,泳道無(wú)明顯彌散區(qū),無(wú)明顯蛋白??

圖1.2?RNA電泳圖??HeLa表示HeLa細(xì)胞RNA對(duì)照,各樣本條帶清晰,泳道無(wú)明顯彌散區(qū),無(wú)明顯蛋白??

果顯示所有RNA樣品均滿足RNA-seq建庫(kù)需求,即每個(gè)樣本RNA純度??OD260/280?在?1.7?2.1?范圍內(nèi),rRNA?比值?28S/18S?>1.0,RNA?完整指數(shù)(RNA??Integrity?Number,RIN)?>?7.0?(表1.2)。RNA樣品電泳顯示....


圖1.3治療前后差異表達(dá)基因數(shù)柱狀圖??T1組樣本的轉(zhuǎn)錄組與T0組的配對(duì)比較后獲得的2392個(gè)差異表達(dá)基因中,90丨個(gè)??

圖1.3治療前后差異表達(dá)基因數(shù)柱狀圖??T1組樣本的轉(zhuǎn)錄組與T0組的配對(duì)比較后獲得的2392個(gè)差異表達(dá)基因中,90丨個(gè)??

2392個(gè)差異表達(dá)基因,其中901個(gè)(38%)表達(dá)上調(diào),1491個(gè)(62°/。)表達(dá)下??調(diào)。將T2組樣本的轉(zhuǎn)錄組與T0組樣本配對(duì)比較后共獲得2296個(gè)差異表達(dá)基??因,其中約40%?(n=911)的表達(dá)上調(diào),60%(n=1385)表達(dá)下調(diào)(圖1.3)。??2000-1?up-r....


圖1.4治療前后差異表達(dá)基因數(shù)目維恩圖??T1組樣本的轉(zhuǎn)錄組與T0組的配對(duì)比較獲得的DEGs與T2組樣本的轉(zhuǎn)錄組與T0組樣??

圖1.4治療前后差異表達(dá)基因數(shù)目維恩圖??T1組樣本的轉(zhuǎn)錄組與T0組的配對(duì)比較獲得的DEGs與T2組樣本的轉(zhuǎn)錄組與T0組樣??

2392個(gè)差異表達(dá)基因,其中901個(gè)(38%)表達(dá)上調(diào),1491個(gè)(62°/。)表達(dá)下??調(diào)。將T2組樣本的轉(zhuǎn)錄組與T0組樣本配對(duì)比較后共獲得2296個(gè)差異表達(dá)基??因,其中約40%?(n=911)的表達(dá)上調(diào),60%(n=1385)表達(dá)下調(diào)(圖1.3)。??2000-1?up-r....



本文編號(hào):4034062

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