目的探討特應(yīng)性皮炎(AD)與銀屑病之間差異表達(dá)的微小RNA(miRNA)及其生物學(xué)功能。方法采用第二代測(cè)序技術(shù)對(duì)8例AD及8例銀屑病皮損組織的miRNA表達(dá)譜進(jìn)行高通量測(cè)序,篩選差異表達(dá)的miRNA。使用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),選取上、下調(diào)表達(dá)差異顯著的miRNA進(jìn)行高通量測(cè)序結(jié)果的驗(yàn)證。針對(duì)差異表達(dá)miRNA進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè),取交集后進(jìn)行基因本體功能及京都基因和基因組百科全書通路富集分析。結(jié)果 AD與銀屑病相比,有204個(gè)差異表達(dá)的miRNA,包括168個(gè)表達(dá)上調(diào)的miRNA和36個(gè)表達(dá)下調(diào)的miRNA。上調(diào)基因hsa-miRNA-133a-3p和下調(diào)基因hsa-miRNA-199b-3p的驗(yàn)證結(jié)果與檢測(cè)結(jié)果具有較好的一致性。差異表達(dá)miRNA的靶基因多富集在蛋白結(jié)合、離子結(jié)合、生物調(diào)節(jié)、細(xì)胞代謝等分子功能和生物功能上,多涉及代謝途徑、磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信號(hào)通路、EB病毒感染及絲裂原活化蛋白激酶信號(hào)通路等。結(jié)論 AD與銀屑病之間存在多個(gè)差異表達(dá)的miRNA,其涉及多種生物功能及通路;PI3K/Akt通路、脂質(zhì)代謝途徑等通路在AD和銀屑病的發(fā)生及病情演變...

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【文章目錄】：
1 資料和方法
    1.1 高通量測(cè)序標(biāo)本來源
    1.2 試劑與儀器
    1.3 高通量測(cè)序方法
        1.3.1 標(biāo)本獲取:
        1.3.2 總RNA提取:
        1.3.3 文庫的構(gòu)建與測(cè)序:
        1.3.4 測(cè)序數(shù)據(jù)分析和處理:
    1.4 實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證
        1.4.1 標(biāo)本來源:
        1.4.2 引物設(shè)計(jì):
        1.4.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè):
    1.5 生物信息學(xué)分析
    1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2 結(jié) 果
    2.1 差異表達(dá)miRNA的篩查結(jié)果
    2.2 實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證結(jié)果
    2.3 生物學(xué)分析結(jié)果
3 討 論



本文編號(hào)：4016323