研究背景:皮膚黑色素瘤是世界范圍內(nèi)致死性最高的皮膚腫瘤,如何能更好的判斷預(yù)后,指導(dǎo)治療從而提高其生存幾率是全球的研究熱點(diǎn)之一。既往用于判斷皮膚黑色素瘤預(yù)后的指標(biāo)主要有性別、年齡、病理分期,Breslow厚度,有無潰瘍,有絲分裂率等臨床及病理指標(biāo)等,但仍不能很好地判定皮膚黑色素瘤預(yù)后的差別。分子生物標(biāo)志物在黑色素瘤預(yù)后中有著重要的應(yīng)用價(jià)值,其中基因多態(tài)性作為黑色素瘤重要的遺傳生物標(biāo)志物,能夠?yàn)榛颊叩念A(yù)后和個(gè)體化治療提供重要信息。得益于人類基因組計(jì)劃（HGP）和人類基因組單體型圖計(jì)劃（Hap Map Project）的完成,以及高通量基因檢測(cè)技術(shù)的完善,研究者已經(jīng)可以在全基因組水平上進(jìn)行基因多態(tài)性和復(fù)雜疾病相關(guān)性的分析,即全基因組關(guān)聯(lián)研究（Genome-wide Association Study,GWAS）,通過GWAS已經(jīng)發(fā)現(xiàn)眾多與黑色素瘤易感性相關(guān)的基因多態(tài)性位點(diǎn)。然而,GWAS也有不盡如人意的方面,比如GWAS可能會(huì)漏掉一些統(tǒng)計(jì)學(xué)意義不是最顯著,然而有著重要生物學(xué)功能的基因多態(tài)性位點(diǎn);單點(diǎn)的GWAS很難分析其背后的分子機(jī)制等�；谕返暮驡WAS數(shù)據(jù)分析策略在GWAS基礎(chǔ)上,整合了... 

【文章來源】：吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：97 頁

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
前言
中文摘要
Abstract
中英文縮略詞對(duì)照表
第1章 緒論
    1.1 皮膚黑色素瘤的流行病學(xué)概況
    1.2 黑色素瘤的基因多態(tài)性研究
        1.2.1 基因多態(tài)性與全基因組關(guān)聯(lián)分析
        1.2.2 CM的基因多態(tài)性研究現(xiàn)狀
        1.2.3 基因多態(tài)性的研究前景
    1.3 鈣信號(hào)通路與CM
        1.3.1 鈣信號(hào)通路的生物學(xué)功能
        1.3.2 鈣信號(hào)通路與腫瘤
        1.3.3 鈣信號(hào)通路基因多態(tài)性與CM的預(yù)后
第2章 材料和方法
    2.1 研究對(duì)象
        2.1.1 數(shù)據(jù)庫簡(jiǎn)介
        2.1.2 全基因組基因分型
    2.2 鈣信號(hào)通路基因及SNP位點(diǎn)的提取
        2.2.1 鈣信號(hào)通路基因集
        2.2.2 SNP位點(diǎn)的選擇
    2.3 SNPs與CMSS的關(guān)聯(lián)分析
        2.3.1 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
        2.3.2 多重假設(shè)檢驗(yàn)校正
        2.3.3 標(biāo)簽SNP的選擇
    2.4 基因型生存分析
        2.4.1 篩選獨(dú)立預(yù)后的SNP位點(diǎn)進(jìn)行基因型生存分析
        2.4.2 組合生存分析
        2.4.3 分層生存分析
    2.5 功能驗(yàn)證方法
        2.5.1 In-silico功能預(yù)測(cè)網(wǎng)站
        2.5.2 表達(dá)數(shù)量性狀基因座分析
    2.6 軟件匯總
第3章 結(jié)果
    3.1 研究對(duì)象的臨床特征
    3.2 鈣信號(hào)通路SNPs與CMSS
        3.2.1 實(shí)驗(yàn)流程概覽
        3.2.2 鈣信號(hào)通路SNPs與CMSS的關(guān)聯(lián)分析
    3.3 選擇與CMSS獨(dú)立相關(guān)的標(biāo)簽SNPs
        3.3.1 同一基因位點(diǎn)的連鎖分析
        3.3.2 選擇獨(dú)立相關(guān)的SNPs
        3.3.3 標(biāo)簽SNP的功能驗(yàn)證
    3.4 標(biāo)簽SNPs基因型的預(yù)后分析
C">        3.4.1 PDE1A rs6750552 T>C
G">        3.4.2 ITPR1 rs6785564 A>G
A">        3.4.3 RYR3 rs2596191 C>A
    3.5 組合分析
        3.5.1 保護(hù)型基因型組合與CMSS的關(guān)系
        3.5.2 分層分析
    3.6 表達(dá)數(shù)量性狀基因座分析
    3.7 ROC曲線和時(shí)間依賴曲線下面積預(yù)測(cè)CMSS
第4章 討論
    4.1 本研究對(duì)鈣信號(hào)通路與CM的研究發(fā)現(xiàn)
    4.2 PDE1A基因與CM的預(yù)后
    4.3 ITPR1基因與CM的預(yù)后
    4.4 RYR3基因與CM的預(yù)后
    4.5 本研究的局限性
第5章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
作者簡(jiǎn)介及在學(xué)期間所取得的科研成果
致謝



本文編號(hào)：2906059