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利用多基因位點系統(tǒng)發(fā)育樹鑒定新疆地區(qū)頭癬致病菌的研究

發(fā)布時間:2020-07-15 19:08
【摘要】:目的:探討新疆地區(qū)頭癬(tinea capitis)致病菌的基因特點,利用多基因位點系統(tǒng)發(fā)育樹(multi-loci phylogenetic tree)鑒定新疆地區(qū)頭癬致病菌,為新疆地區(qū)頭癬病的預防、診療提供科學的依據(jù)。方法:對22株新疆地區(qū)頭癬分離株的ITS、EF和Beta-tubulin基因進行PCR擴增、測序、序列分析,同時與24個CBS標準菌株的以上相關基因位點做比較,建立系統(tǒng)進化樹,從而通過多基因系統(tǒng)發(fā)育樹鑒定新疆地區(qū)頭癬的致病菌,同時評價這三個基因位點對皮膚癬菌鑒定的優(yōu)缺點,尋找出皮膚癬菌特異性的鑒定基因。以此評估出最好的基因標記物用來鑒定新疆地區(qū)頭癬致病菌。結果:利用全部22株來自新疆地區(qū)頭癬分離株,通過與CBS標準菌株一起構建系統(tǒng)進化樹比較以上3個基因位點后,目前為止我們發(fā)現(xiàn):在利用多基因位點構建系統(tǒng)進化樹來鑒定新疆地區(qū)頭癬致病菌的過程中,Beta-tubulin可能是最好的基因標記物。結論:通過使用ITS、EF和Beta-tubulin基因分別構建系統(tǒng)進化樹,在新疆地區(qū)頭癬分離株中我們鑒定出了7個種,它們分別是:E.floccosum;M.canis;T.ferrugineum;T.schoenleinii;T.tonsurans;T.verrucosum;T.violaceum。目前為止,在鑒定新疆地區(qū)頭癬致病菌方面,我們發(fā)現(xiàn)Beta-tublin是最好的基因標記物。
【學位授予單位】:新疆醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R756.1

【參考文獻】

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本文編號:2756892

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