【摘要】： 目的:了解四川地區(qū)麻風桿菌基因GTA9位點基因型特征及地理分布。方法:選取四川省醫(yī)學科學院·四川省人民醫(yī)院皮膚性病研究所2006年至2008年麻風病人病理活檢組織塊,精選其中皮膚厚度或直徑=0.5cm,脂肪組織較少的組織塊,共56例,其中涼山州30例,甘孜阿壩5例,其他縣市21例。所有病例均由有經驗的病理醫(yī)師核實診斷。利用QIAGEN試劑盒提取麻風桿菌DNA,參考國外學者文獻合成引物,將麻風桿菌DNA進行PCR擴增反應,經過預變性,40個熱循環(huán)及延伸后,在2!瓊脂糖中進行電泳,每組實驗設3組對照:空白對照、陰性對照和質控對照。在紫外線下觀察擴增結果,然后應用雙脫氧核糖核酸鏈末端終止法對GTA9位點可變的串聯(lián)重復序列(variable number tandem repeat,VNTR)的PCR產物進行測序,利用Chromas軟件閱讀圖譜,對序列進行判讀確定其重復拷貝數。應用SAS9.13軟件包,對結果進行卡方檢驗和秩和檢驗。結果:本研究結果顯示麻風桿菌的56例麻風菌株在GTA9位點上表達比例為93.5%,而且等位基因拷貝數具有多樣性,其拷貝數在8～53范圍內變化,以15、19、21個拷貝數為主的等位基因型菌株分別占總菌株陽性的比例分別為15.7%、11.8%、9.8%,其中以14、20、30和33個拷貝數的等位基因位點只有涼山州有,其他縣市GTA9等位基因位點的拷貝數均33;涼山州GTA9等位基因位點共13種,只在涼山州表達的有8種。四川地區(qū)總標本數n=5640,最小理論頻數T=3.145,連續(xù)校正X2值, X2=0.27,按a=0.05水準,P0.05,差別無統(tǒng)計學意義,尚不能認為涼山州與四川其他地方GTA9陽性標本存在地區(qū)差異。麻風桿菌基因GTA9等位基因拷貝數和四川涼山、甘孜阿壩及其他縣市的拷貝數地理分布,將拷貝數分成8～18,19～29,30～53三個區(qū)段,經統(tǒng)計學分析,利用成組設計頻數表資料的多個樣本的秩和檢驗計算H值,H=98.17,由于相同秩次較多,校正后Hc=116.87,自由度v=2,Hc近似服從v=2的X2分布,P0.005,按a=0.05水準,總體拷貝例數差別有統(tǒng)計學意義,進一步做成組設計兩兩比較的秩和檢驗,得到界值分別為10.79、15.26、18.93,按a=0.05水準,P0.05,差別無統(tǒng)計學意義,尚不能認為GTA9等位基因位點拷貝數在四川涼山、甘孜阿壩及其他縣市分布存在差異。結論:1.四川地區(qū)麻風桿菌基因GTA9位點陽性表達率較高。2.四川地區(qū)麻風桿菌基因GTA9位點具有明顯的多態(tài)性。3.四川地區(qū)麻風桿菌基因GTA9位點與地理分布無明顯聯(lián)系。4.麻風桿菌基因GTA9位點重復拷貝數大于33的等位基因位點是涼山州與四川其他地區(qū)等位基因的典型差別之一,可能為進一步的流行病學研究提供依據。
【圖文】：

圖2、圖3和表1顯示，四川56例麻風桿菌菌株在GTA9等位基因表達比例為93.5%，各位點拷貝數在8～53范圍的GTA9等位基因共20種，等位基因的平均個數為2.45個，等位基因拷貝數具有多樣性。圖3、圖4顯示，其中以位點15、19、21拷貝數為主的等位基因型菌株分別占總菌株陽性的比例分別為15.7%、11.8%、9.8%，其中以14、20、30和＞33個拷貝數的等位基因位點只有涼山州有，其他縣市GTA9等位基因位點的拷貝數均＜33；涼山州GTA9等位基因位點共13種，只在涼山州表達的有8種。涼山州GTA9等位基因的型別在所有51例的陽性標本中最豐富。圖 2 基因 GTA9 位點來源地Figure2 GTA9 Genotype locus source terra攀枝花阿壩巴中達州廣安資陽雅安眉山樂山自貢瀘州廣元綿陽涼山宜賓內江成都南充遂寧★德陽★8--18copy19--29 copy30--40copy＞40copy甘孜★★◆◆10

5.四川各地的麻風桿菌菌株GTA9等位基因拷貝例數地理分布如表4、圖3、圖4、圖6顯示麻風桿菌基因GTA9等位基因位點拷貝數和四川各地的位點拷貝數地理分布，經統(tǒng)計學分析，利用表5成組設計頻數表資料的多個樣本的秩和檢驗計算H值，H=98.17，由于相同秩次較多，校正后Hc=116.87,自由度v=2,Hc近似服從v=2的X2分布，P＜0.005，按a=0.05水準，差別有統(tǒng)計學意義，可以認為GTA9位點等位基因拷貝例數在四川分布不完全相同。以15、19、21個拷貝數為主的等位基因型菌株分別占總菌株陽性的比例分別為15.7%、11.8%、9.8%，除8、13、18、23、24、26、3314
【學位授予單位】：瀘州醫(yī)學院
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2009
【分類號】：R755

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1 趙蓓;四川地區(qū)麻風桿菌基因GTA9位點初步研究[D];瀘州醫(yī)學院;2009年

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本文編號：2699883