發(fā)布時間：2017-08-11 10:37

  本文關鍵詞：中國漢族人群多基因遺傳位點與高原肺水腫易感性的關聯研究

  更多相關文章： 高原肺水腫 基因多態(tài)性 單體型 中國漢族 分子標志物

【摘要】：背景：高原肺水腫(High-altitude pulmonary edema,HAPE)是高原性疾病中主要的致死性疾病,屬于肺水腫疾病中的一種罕見類型,主要發(fā)生在數天內到達海拔2,500-3,000米的人群中,使人們的健康受到嚴重的威脅。近年來,基因組研究已經發(fā)現很多單核苷酸多態(tài)性位點(SNPs)與HAPE的發(fā)病風險相關,然而在中國人群中關于SNPs和HAPE的關聯性卻鮮有報道。因此,本研究選取中國漢族人群為研究對象,重復驗證這些SNPs與HAPE的相關性,并檢測其他位點是否也存在這種相關性；此外,本研究還篩選了先前報道的與端粒長度相關基因上的一些遺傳位點,并檢測了它們與HAPE的相關性。方法：選取267個HAPE病例和304個正常對照的樣本,對109個基因多態(tài)性位點進行了分型,進而來評估它們與HAPE發(fā)病風險之間的相關性。結果：關聯分析結果表明7個多態(tài)性位點(AGTR1基因位點rs275651,rs275652, rs4524238和rs385338,ADRB2基因位點rs1042718,GSTP1基因位點rs749174,GNB3基因位點rs4963516)和2個單體型(AGTR1基因單體型AG和AA)和HAPE顯著相關(rs275651,A vs.T,p=0.017;rs275652,G vs.T,p=0.016;rs385338,CG/CC vs.GG,p= 0.045；rs4524238,AA vs.AG/AG vs.GG,矯正后p=0.040；rs1042718,A vs.C,p.0.045； rs749174,A vs.G,p=0.042;rs4963516,G vs.T,p=0.006;Haplotype AG vs.TT, p= 0.018;Haplotype AA vs.GG,p=0.040)。在對端粒長度相關基因的分析中,發(fā)現ACYP2基因位點rs6713088和rs17045754,TSPYL6基因位點rs12615793和rs11896604, RTEL1基因位點rs6089953,rs6010621,rs4809324和rs2297441和HAPE存在顯著的相關性(rs6713088,GG vs.CC,p=0.049;rs17045754,CC vs.GG,p=0.044；rs12615793, AA vs.GG,p=0.035;rs11896604,GG vs.CC,p=0.026;rs6089953,G vs.A,p=0.009; rs6010621,G vs.T,p0.001；rs2297441,A vs.G,p=0.021；rs4809324,CT vs.TT,p= 0.022)；以及后續(xù)的單體型分析顯示,GT和AT(rs6089953-rs6010621)是引起HAPE發(fā)生的主要風險單體型(GT,p=0.013;AT,p=0.008),而GG(rs6089953-rs6010621)則是主要的保護性單體型(p0.001)。結論：為研究中國漢族人群中特定多態(tài)性位點和HAPE之間的顯著相關性提供了可靠的依據,這些位點可用作HAPE的診斷和預后的分子標志物,在臨床研究中具有重要生物學意義。
【關鍵詞】：高原肺水腫 基因多態(tài)性 單體型 中國漢族 分子標志物
【學位授予單位】：西北大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：R594.3
【目錄】：

• 摘要4-6
• ABSTRACT6-8
• 縮略語對照表8-12
• 第一章 緒論12-23
• 1.1 高原肺水腫12-13
• 1.1.1 高原肺水腫的概述12-13
• 1.1.2 高原肺水腫的診斷標準13
• 1.1.3 嚴重程度分級13
• 1.2 高原肺水腫的臨床表現13-15
• 1.2.1 流行病特征13-15
• 1.2.2 臨床檢查15
• 1.3 高原肺水腫的治療和預防15-16
• 1.3.1 治療15-16
• 1.3.2 預防16
• 1.4 高原肺水腫的病因16-18
• 1.4.1 急性高原病(AMS)和低氧血癥16
• 1.4.2 肺毛細血管通透性的可變性16
• 1.4.3 先天性異常16-17
• 1.4.4 運動17
• 1.4.5 炎癥因素17-18
• 1.5 高原肺水腫的分子遺傳學研究18-19
• 1.6 單核苷酸多態(tài)性研究19
• 1.7 立題依據19-23
• 1.7.1 HAPE易感基因的位點選擇依據19-20
• 1.7.2 端粒長度相關基因的位點選擇依據20-22
• 1.7.3 實驗技術路線22-23
• 第二章 材料和方法23-31
• 2.1 實驗儀器設備23
• 2.2 主要試劑23-24
• 2.3 研究人群24-25
• 2.3.1 研究人群的來源24
• 2.3.2 人群篩選標準24-25
• 2.4 樣本采集與DNA提取與純度檢測25-26
• 2.4.1 采樣25
• 2.4.2 DNA提取25
• 2.4.3 DNA純度檢測25-26
• 2.5 SNP位點選擇26-27
• 2.5.1 HAPE相關基因位點選擇26
• 2.5.2 端粒相關基因位點選擇26-27
• 2.6 SNP分型27-28
• 2.7 統(tǒng)計分析28-31
• 2.7.1 人群特征的統(tǒng)計學分析29
• 2.7.2 哈迪-溫伯格平衡檢驗29
• 2.7.3 單SNP位點分析29
• 2.7.4 單體型分析29-31
• 第三章 結果31-64
• 3.1 Massarray分析31-33
• 3.2 HAPE對照和病例的主要人群特征33
• 3.3 候選SNP位點在等位基因模型下與HAPE的相關性33-39
• 3.4 候選SNP位點在各個模型下(基因型,顯性,隱性和加性模型)與HAPE的相關性39-47
• 3.5 高原肺水腫易感基因上檢測的SNP位點連鎖不平衡與單體型的構建47-49
• 3.6 端粒長度相關基因上檢測的SNP位點在等位基因模型下與HAPE的相關性49-52
• 3.7 端粒長度相關基因上檢測的SNP位點在各個模型下(基因型,顯性,隱性和加性)與HAPE的相關性52-62
• 3.8 端粒長度相關基因上檢測的SNP位點連鎖不平衡與單體型的構建62-64
• 第四章 討論64-71
• 4.1 AGTR1基因位點和HAPE的相關性分析65-66
• 4.2 ADRB2基因rs1042718位點和和HAPE的相關性分析66-67
• 4.3 GSTP1基因rs749174位點和HAPE的關聯性分析67-68
• 4.4 GNB3基因rs4963516位點和HAPE的關聯性分析68
• 4.5 RTEL1基因位點和HAPE的關聯性分析68-69
• 4.6 其他基因位點和HAPE的關聯性分析69-70
• 4.7 本研究的不足之處70-71
• 第五章 結論71-72
• 參考文獻72-82
• 附錄82-88
• 攻讀碩士學位期間取得的科研成果88-89
• 致謝89

【參考文獻】

中國期刊全文數據庫 前4條

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本文編號：655669