本文關鍵詞：應用蛋白—蛋白相互作用和網絡生物學方法研究Ⅱ型糖尿病形成機制，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：糖尿病是一種復雜的、多因素影響的以慢性高血糖為特征的代謝異常類疾病,是由于胰島素分泌量不足或者組織胰島素抵抗導致的,在西方糖尿病患者中Ⅱ型糖尿病的比例超過了90%。因此本論文采用兩種不同的方法對Ⅱ型糖尿病的形成機制進行了比較系統(tǒng)的研究。 第一章,介紹了研究背景和文章中用到的相關網站和工具。 第二章,我們在基因組水平上利用蛋白一蛋白相互作用篩選出了與Ⅱ型糖尿病有聯(lián)系新的潛在靶標。首先,我們把網上的數據庫進行整合得到了一個目前最大最全面的人類蛋白一蛋白數據集。然后從比較毒理基因組學數據庫(CTD)和京都基因與基因組百科全書數據庫(KEGG)中搜索研究比較清楚的靶標作為誘餌,在蛋白一蛋白相互作用數據集中尋找潛在的與Ⅱ型糖尿病相關的蛋白質。得到的擴展蛋白進一步與微陣列基因表達量數據處理后的結果進行比對、整合,最后根據網絡拓撲理論得到了與4個組織有關的9個新的潛在靶標。 第三章,我們構建了一個綜合性的Ⅱ型糖尿病通路圖。我們通過文獻挖掘和通路整合,利用CellDesigner構建了一個XML格式的綜合通路,并且以葡萄糖傳輸和胰島素調節(jié)在各個器官或組織之間的相互關聯(lián)為依據完善和加強了各個通路之間的聯(lián)系。 第四章,對全文進行了總結。
【關鍵詞】：蛋白-蛋白相互作用 綜合通路圖 Ⅱ型糖尿病 網絡生物學
【學位授予單位】：華東理工大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2014
【分類號】：R587.1
【目錄】：

• 摘要5-6
• Abstract6-9
• 第1章 緒論9-25
• 1.1 系統(tǒng)生物學的研究進展9-13
• 1.1.1 系統(tǒng)生物學的研究內容10-11
• 1.1.2 系統(tǒng)生物學的研究方法11-12
• 1.1.3 計算系統(tǒng)生物學12-13
• 1.2 網絡生物學的研究進展13-16
• 1.3 復雜疾病16-19
• 1.4 功能組學和相互作用組學19-21
• 1.4.1 代謝物組學19-20
• 1.4.2 蛋白質組學和相互作用組學20-21
• 1.5 糖尿病的研究現(xiàn)狀21-22
• 1.6 計算機輔助藥物設計22-23
• 1.7 論文總體安排23-25
• 第2章 蛋白-蛋白相互作用在Ⅱ型糖尿病靶標發(fā)現(xiàn)中的應用25-38
• 2.1 引言25-26
• 2.2 實驗方法26-31
• 2.2.1 蛋白-蛋白相互作用對(PPIs)數據集26-27
• 2.2.2 靶標基因(Target genes)27-30
• 2.2.3 參考基因(Reference genes)30
• 2.2.4 擴展基因(Extended genes)30-31
• 2.2.5 基因與蛋白的標準化31
• 2.3 實驗結果31-36
• 2.3.1 脂肪組織中新的潛在靶標33
• 2.3.2 心血管系統(tǒng)中新的潛在靶標33-34
• 2.3.3 腎上腺中新的潛在靶標34
• 2.3.4 免疫組織中新的潛在靶標34-36
• 2.4 討論36-37
• 2.5 本章小結37-38
• 第3章 Ⅱ型糖尿病綜合通路的構建38-50
• 3.1 引言38-43
• 3.1.1 葡萄糖的運輸38-39
• 3.1.2 胰島素抗性的分子機理和細胞機理39-40
• 3.1.3 計算工具40-42
• 3.1.4 網絡模型42-43
• 3.2 實驗方法43-44
• 3.2.1 文獻挖掘43-44
• 3.2.2 綜合通路圖的構建44
• 3.3 實驗結果44-47
• 3.3.1 肝臟中的通路圖45
• 3.3.2 骨骼肌細胞中的通路圖45-46
• 3.3.3 胰島β細胞中的通路圖46
• 3.3.4 脂肪組織和腸道細胞中的通路圖46
• 3.3.5 通路的聯(lián)系和綜合通路圖46-47
• 3.4 討論47-49
• 3.5 本章小結49-50
• 第4章 全文總結50-51
• 參考文獻51-60
• 研究生期間發(fā)表的論文60-61
• 致謝61

【參考文獻】

中國期刊全文數據庫 前3條

1 唐惠儒;王玉蘭;;代謝組學:一個迅速發(fā)展的新興學科(英文)[J];生物化學與生物物理進展;2006年05期

2 Noemí Eiró;Francisco J Vizoso;;Inflammation and cancer[J];World Journal of Gastrointestinal Surgery;2012年03期

3 Pieter-Jan Verhulst;Inge Depoortere;;Ghrelin's second life:From appetite stimulator to glucose regulator[J];World Journal of Gastroenterology;2012年25期

  本文關鍵詞：應用蛋白—蛋白相互作用和網絡生物學方法研究Ⅱ型糖尿病形成機制，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號：418697