本文關(guān)鍵詞：應(yīng)用蛋白—蛋白相互作用和網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)方法研究Ⅱ型糖尿病形成機制，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：糖尿病是一種復(fù)雜的、多因素影響的以慢性高血糖為特征的代謝異常類疾病,是由于胰島素分泌量不足或者組織胰島素抵抗導(dǎo)致的,在西方糖尿病患者中Ⅱ型糖尿病的比例超過了90%。因此本論文采用兩種不同的方法對Ⅱ型糖尿病的形成機制進行了比較系統(tǒng)的研究。 第一章,介紹了研究背景和文章中用到的相關(guān)網(wǎng)站和工具。 第二章,我們在基因組水平上利用蛋白一蛋白相互作用篩選出了與Ⅱ型糖尿病有聯(lián)系新的潛在靶標(biāo)。首先,我們把網(wǎng)上的數(shù)據(jù)庫進行整合得到了一個目前最大最全面的人類蛋白一蛋白數(shù)據(jù)集。然后從比較毒理基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫(CTD)和京都基因與基因組百科全書數(shù)據(jù)庫(KEGG)中搜索研究比較清楚的靶標(biāo)作為誘餌,在蛋白一蛋白相互作用數(shù)據(jù)集中尋找潛在的與Ⅱ型糖尿病相關(guān)的蛋白質(zhì)。得到的擴展蛋白進一步與微陣列基因表達量數(shù)據(jù)處理后的結(jié)果進行比對、整合,最后根據(jù)網(wǎng)絡(luò)拓撲理論得到了與4個組織有關(guān)的9個新的潛在靶標(biāo)。 第三章,我們構(gòu)建了一個綜合性的Ⅱ型糖尿病通路圖。我們通過文獻挖掘和通路整合,利用CellDesigner構(gòu)建了一個XML格式的綜合通路,并且以葡萄糖傳輸和胰島素調(diào)節(jié)在各個器官或組織之間的相互關(guān)聯(lián)為依據(jù)完善和加強了各個通路之間的聯(lián)系。 第四章,對全文進行了總結(jié)。
【關(guān)鍵詞】：蛋白-蛋白相互作用 綜合通路圖 Ⅱ型糖尿病 網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)
【學(xué)位授予單位】：華東理工大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2014
【分類號】：R587.1
【目錄】：

• 摘要5-6
• Abstract6-9
• 第1章 緒論9-25
• 1.1 系統(tǒng)生物學(xué)的研究進展9-13
• 1.1.1 系統(tǒng)生物學(xué)的研究內(nèi)容10-11
• 1.1.2 系統(tǒng)生物學(xué)的研究方法11-12
• 1.1.3 計算系統(tǒng)生物學(xué)12-13
• 1.2 網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)的研究進展13-16
• 1.3 復(fù)雜疾病16-19
• 1.4 功能組學(xué)和相互作用組學(xué)19-21
• 1.4.1 代謝物組學(xué)19-20
• 1.4.2 蛋白質(zhì)組學(xué)和相互作用組學(xué)20-21
• 1.5 糖尿病的研究現(xiàn)狀21-22
• 1.6 計算機輔助藥物設(shè)計22-23
• 1.7 論文總體安排23-25
• 第2章 蛋白-蛋白相互作用在Ⅱ型糖尿病靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)中的應(yīng)用25-38
• 2.1 引言25-26
• 2.2 實驗方法26-31
• 2.2.1 蛋白-蛋白相互作用對(PPIs)數(shù)據(jù)集26-27
• 2.2.2 靶標(biāo)基因(Target genes)27-30
• 2.2.3 參考基因(Reference genes)30
• 2.2.4 擴展基因(Extended genes)30-31
• 2.2.5 基因與蛋白的標(biāo)準(zhǔn)化31
• 2.3 實驗結(jié)果31-36
• 2.3.1 脂肪組織中新的潛在靶標(biāo)33
• 2.3.2 心血管系統(tǒng)中新的潛在靶標(biāo)33-34
• 2.3.3 腎上腺中新的潛在靶標(biāo)34
• 2.3.4 免疫組織中新的潛在靶標(biāo)34-36
• 2.4 討論36-37
• 2.5 本章小結(jié)37-38
• 第3章 Ⅱ型糖尿病綜合通路的構(gòu)建38-50
• 3.1 引言38-43
• 3.1.1 葡萄糖的運輸38-39
• 3.1.2 胰島素抗性的分子機理和細胞機理39-40
• 3.1.3 計算工具40-42
• 3.1.4 網(wǎng)絡(luò)模型42-43
• 3.2 實驗方法43-44
• 3.2.1 文獻挖掘43-44
• 3.2.2 綜合通路圖的構(gòu)建44
• 3.3 實驗結(jié)果44-47
• 3.3.1 肝臟中的通路圖45
• 3.3.2 骨骼肌細胞中的通路圖45-46
• 3.3.3 胰島β細胞中的通路圖46
• 3.3.4 脂肪組織和腸道細胞中的通路圖46
• 3.3.5 通路的聯(lián)系和綜合通路圖46-47
• 3.4 討論47-49
• 3.5 本章小結(jié)49-50
• 第4章 全文總結(jié)50-51
• 參考文獻51-60
• 研究生期間發(fā)表的論文60-61
• 致謝61

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 唐惠儒;王玉蘭;;代謝組學(xué):一個迅速發(fā)展的新興學(xué)科(英文)[J];生物化學(xué)與生物物理進展;2006年05期

2 Noemí Eiró;Francisco J Vizoso;;Inflammation and cancer[J];World Journal of Gastrointestinal Surgery;2012年03期

3 Pieter-Jan Verhulst;Inge Depoortere;;Ghrelin's second life:From appetite stimulator to glucose regulator[J];World Journal of Gastroenterology;2012年25期

  本文關(guān)鍵詞：應(yīng)用蛋白—蛋白相互作用和網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)方法研究Ⅱ型糖尿病形成機制，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號：418697