MicroRNA靶位點多態(tài)性與2型糖尿病遺傳易感性的關(guān)聯(lián)研究
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《南京醫(yī)科大學(xué)》 2013年
MicroRNA靶位點多態(tài)性與2型糖尿病遺傳易感性的關(guān)聯(lián)研究
趙旭
【摘要】:糖尿病是一種由多種病因引起的,以慢性高血糖為特征的代謝性疾病,是目前全世界發(fā)病率和死亡率最高的5種疾病之一。據(jù)估計,到2030年全球糖尿病患者數(shù)量將增至5.52億人,患病率為9.9%,平均每年增長2.7%,是全球人口數(shù)量增長的1.7倍。我國成人糖尿病已達(dá)9240萬,其中2型糖尿。╰ype2dibetes mellitus, T2DM)占90%以上,同時約有1.48億人處于糖尿病前期。糖尿病引起的急、慢性并發(fā)癥,尤其是慢性并發(fā)癥累及多個器官,,致殘、致死率高,嚴(yán)重影響患者的身心健康,并給患者家庭和社會帶來沉重的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)。T2DM已成為嚴(yán)重危害人們健康和生命的重要的公共衛(wèi)生問題,尋找T2DM的危險因素,預(yù)防其發(fā)生、發(fā)展已迫在眉睫。 新近研究發(fā)現(xiàn)一類調(diào)控小分子MicroRNAs(miRNAs),它是一類長度很短的非編碼調(diào)控單鏈小分子RNA,它不但與正常的生理功能調(diào)控關(guān)系密切,也已被證實在人類多種疾。òㄌ悄虿。┑陌l(fā)生發(fā)展中有極為重要的調(diào)控作用。miRNAs參與調(diào)節(jié)胰島素的生成和分泌、胰島的發(fā)育及作用、以及參與調(diào)節(jié)脂代謝,進(jìn)而影響糖尿病及其并發(fā)癥的發(fā)生發(fā)展。miRNAs主要通過與靶mRNA的3'UTR(非翻譯區(qū))堿基互補,特異性序列結(jié)合,對基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)控。研究發(fā)現(xiàn)miRNA靶基因的3'UTRs結(jié)合區(qū)域的單核苷酸多態(tài)性位點(SNPs)可以影響miRNA與靶區(qū)域的結(jié)合效率,使miRNA調(diào)控作用發(fā)生改變,進(jìn)而改變靶基因或靶蛋白表達(dá)水平或方式,最終影響疾病的發(fā)生。然而有關(guān)miRNAs靶基因結(jié)合區(qū)域單核苷酸多態(tài)性與2型糖尿病易感性的關(guān)聯(lián)研究未見報道。 本研究利用生物信息學(xué)方法篩選T2DM相關(guān)的miRNAs靶結(jié)合區(qū)域內(nèi)的單核苷酸多態(tài)性位點,進(jìn)一步采用病例-對照研究在中國東南方漢族人群中,研究這些基因多態(tài)性與2型糖尿病易感性的關(guān)聯(lián)。從miRNAs調(diào)控靶基因的角度,探討T2DM潛在的危險因素。研究結(jié)果將進(jìn)一步豐富T2DM分子病因機制的內(nèi)容,可為T2DM分子診斷及高危人群篩查提供新的遺傳易感性標(biāo)志物。 第一部分單個miRNA靶位點多態(tài)性與2型糖尿病易感性的關(guān)聯(lián)研究 本文首先利用公共數(shù)據(jù)庫和分子生物遺傳學(xué)方面的文獻(xiàn),查找2型糖尿病相關(guān)的miRNAs,然后運用生物信息學(xué)軟件預(yù)測其靶位點,經(jīng)過篩選,確定納入本研究的候選的T2DM相關(guān)的靶基因及靶結(jié)合區(qū)域SNPs位點。采用病例-對照研究設(shè)計,應(yīng)用Taqman-MGB探針的技術(shù),檢測全部研究對象(T2DM患者1017例,正常對照1059例)10個候選miRNAs靶多態(tài)性位點,分析其不同基因型在中國東南方漢族人群中頻率的分布及其與T2DM的關(guān)聯(lián)。應(yīng)用Logistic回歸模型計算不同基因型人群患T2DM的風(fēng)險(OR)及其95%可信區(qū)間(95%CI)主要結(jié)果如下: 1. T2DM相關(guān)的miRNA靶多態(tài)性位點與T2DM的關(guān)系分別對10個miRNA靶多態(tài)性位點進(jìn)行分析。經(jīng)調(diào)整年齡、性別和腰圍因素后,INSR基因的rs1366600(TC)和ACSL1基因的rs2292899(GA)位點變異與T2DM的發(fā)生成正關(guān)聯(lián),而FABP2基因的rs11724758(GA)位點變異與T2DM的發(fā)生成負(fù)關(guān)聯(lián)。與野生型rs1366600TT相比,突變純合型rs1366600CC及TC/CC可以顯著增加T2DM的患病風(fēng)險[調(diào)整ORs (95%CIs)分別為2.03(1.02-4.01);1.28(1.04-1.57)]。與野生型rs2292899GG相比,攜帶rs2292899GA雜合型個體的T2DM患病風(fēng)險增加了22%[調(diào)整OR(95%CI)=1.22(1.004-1.49)]。然而與野生型rs11724758GG相比,突變純合型11724758AA則會顯著降低2型糖尿病的患病風(fēng)險[調(diào)整OR(95%CI)=0.76(0.58-0.997)]。經(jīng)1000次隨機檢驗方法校正后,這3個位點的基因型頻率分布在病例組與對照組間仍存在統(tǒng)計學(xué)差異。未發(fā)現(xiàn)其余7個位點多態(tài)性與T2DM存在統(tǒng)計學(xué)關(guān)聯(lián)。2. T2DM相關(guān)的miRNA靶位點多態(tài)性與T2DM易感性的分層分析 分層分析表明,相加模型中,在男性、>55歲、腹型肥胖、不吸煙及不飲酒人群中攜帶INSR基因rs1366600危險等位基因C的個體患T2DM的風(fēng)險顯著增加[調(diào)整ORs (95%CIs)分別為1.31(1.00-1.70);1.41(1.11-1.80);1.55(1.17-2.06);1.29(1.03-1.61);1.31(1.06-1.63)]。男性人群中,攜帶ACSL1基因rs2292899的危險等位基因A個體的T2DM患病風(fēng)險增加了21%[調(diào)整OR (95%CI)為1.21(1.01-1.46)]。在男性、>55歲、吸煙及飲酒人群中,攜帶FABP2基因rs11724758位點保護(hù)性等位基因A的個體,患T2DM風(fēng)險可以顯著降低[調(diào)整ORs (95%CIs)分別為0.83(0.69-0.99);0.75(0.63-0.89);0.78(0.61-0.99);0.70(0.53-0.93)]。其他7個多態(tài)性位點在不同分層因素的特征人群中,未發(fā)現(xiàn)病例與對照分布差異存在統(tǒng)計學(xué)意義。 第二部分多個miRNA靶位點及其環(huán)境的聯(lián)合作用與2型糖尿病易感性關(guān)系 鑒于2型糖尿病是由遺傳和環(huán)境因素共同作用的多因子疾病。本研究應(yīng)用叉生分析、Logistic回歸模型及誤差逆?zhèn)鞑ト斯ど窠?jīng)網(wǎng)絡(luò)(Back Propagation artificialneural network, BPANN)方法探討基因-基因、基因-環(huán)境之間的聯(lián)合作用與中國東南方漢族人群T2DM遺傳易感性的關(guān)系。主要結(jié)果如下: 1. miRNA靶位點多態(tài)性的聯(lián)合作用對2型糖尿病易感性的影響基于第一部分單個位點分析結(jié)果,選取與T2DM患病風(fēng)險存在統(tǒng)計學(xué)關(guān)聯(lián)的多態(tài)位點(INSR基因的rs1366600位點、ACSL1基因的rs2292899位點和FABP2基因的rs11724758位點),分析這三個SNPs位點的聯(lián)合作用與2型糖尿病易感性的關(guān)系。結(jié)果顯示三個位點的聯(lián)合作用與T2DM的易感性間存在累積效應(yīng),即隨著攜帶危險等位基因個數(shù)的增加,2型糖尿病的患病風(fēng)險也顯著增加。分層分析顯示,在男性、>55歲、腹型肥胖及是否吸煙或飲酒的人群仍然存在這種危險等位基因的累積效應(yīng),攜帶2~6個風(fēng)險等位基因的個體較攜帶0~1個危險等位基因的個體患T2DM的風(fēng)險顯著增加。 2.基因與環(huán)境因素聯(lián)合作用的效應(yīng)分析對INSR rs1366600、ACSL1rs2292899和FABP2rs11724758三個SNP位點與環(huán)境危險因素(腹型肥胖)的叉生分析發(fā)現(xiàn)與非腹型肥胖且不攜帶危險基因(rs1366600TC/CC)者相比,不攜帶危險基因的腹型肥胖者糖尿病的風(fēng)險顯著增加[調(diào)整OR (95%CI)為2.17(1.75-2.68)];與非腹型肥胖且不攜帶危險基因(rs2292899GA/AA)者相比,不攜帶危險基因(rs2292899GA/AA)的腹型肥胖者和僅攜帶相對風(fēng)險基因的非腹型肥胖者患糖尿病的風(fēng)險均顯著增加[調(diào)整ORs(95%CIs)分別為2.73(2.04-3.67);1.32(1.01-1.72)];但是,與非腹型肥胖且不攜帶危險基因的個體相比,那些既攜帶危險基因型又暴露在危險環(huán)境因素下的個體的患病風(fēng)險增加的最大[調(diào)整ORs=3.56,3.04;95%CIs=(2.61-4.87),(2.31-3.99)]。攜帶保護(hù)基因型的(rs11724758GA/AA)腹型肥胖者的T2DM患病率風(fēng)險可以增加124%[調(diào)整OR=2.24;95%CI=(1.71-2.95)];但是攜帶危險基因型(rs11724758GG)且腹型肥胖者T2DM患病風(fēng)險最高[調(diào)整OR=2.62;95%CI=(1.92-3.58)]。 3.多因素Logistic回歸分析對19個因素變量,包括10個miRNA靶位點和相關(guān)環(huán)境因素,采用逐步后退法,進(jìn)行T2DM的多因素Logistic回歸分析,顯示糖尿病家族史、高血壓史、腰圍、飲酒、高血脂史、吸煙及rs1366600,7個因素與T2DM的發(fā)病有正向或負(fù)向的統(tǒng)計學(xué)關(guān)聯(lián)(P0.05)。 4. BPANN多因素分析將19個影響因素作為輸入,T2DM診斷作為輸出,用全部可用樣本建立BPANN模型,傳遞函數(shù)為logsig函數(shù),學(xué)習(xí)率為0.1,訓(xùn)練誤差為0.01,最大訓(xùn)練步數(shù)設(shè)為1000步。訓(xùn)練終止后求得各影響因素的平均影響值(mean impactvalue, MIV),按MIV的絕對值大小排出的相關(guān)因素順位,居于前10位因素的MIV從大到小依次為:高血壓史、腰圍、年齡、高血脂史、糖尿病家族史、飲酒、rs2292899、性別、rs1048956、rs1366600。
【關(guān)鍵詞】:
【學(xué)位授予單位】:南京醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號】:R587.1
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4 宋西珠;李玉姝;單忠艷;滕衛(wèi)平;;2型糖尿病與甲狀腺激素水平的相關(guān)性[A];中華醫(yī)學(xué)會第十次全國內(nèi)分泌學(xué)學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2011年
5 駱文書;郭志榮;胡曉抒;周正元;武鳴;張麗君;劉景超;;兩年的腰圍和體重指數(shù)動態(tài)變化對2型糖尿病發(fā)病的影響[A];中國心臟大會(CHC)2011暨北京國際心血管病論壇論文集[C];2011年
6 楊銘;賈杰;吳毅;;“2型糖尿病經(jīng)穴電刺激下有氧運動技術(shù)”的社區(qū)應(yīng)用研究[A];中國康復(fù)醫(yī)學(xué)會運動療法分會第十一屆全國康復(fù)學(xué)術(shù)大會學(xué)術(shù)會議論文摘要匯編[C];2011年
7 岳仁宋;王帥;陳源;員富圓;廖秋雙;王丹;;治未病理論在2型糖尿病防治中的應(yīng)用[A];第十二屆全國中醫(yī)糖尿病大會論文匯編[C];2010年
8 陳樹源;于波;;冠心病合并2型糖尿病的臨床分析[A];第十三次全國心血管病學(xué)術(shù)會議論文集[C];2011年
9 李鳳麗;張會娟;;2型糖尿病并非酒精性脂肪性肝病患者檢測同型半胱氨酸的臨床意義[A];中華醫(yī)學(xué)會第十次全國內(nèi)分泌學(xué)學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2011年
10 劉碧紅;;6例嬰兒1型糖尿病的護(hù)理[A];2011年浙江省醫(yī)學(xué)會兒科學(xué)分會學(xué)術(shù)年會暨兒內(nèi)科疾病診治新進(jìn)展國家級學(xué)習(xí)班論文匯編[C];2011年
中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 本報記者 陳錚;[N];中國醫(yī)藥報;2010年
2 應(yīng)夢佳 編譯;[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報;2011年
3 編譯 曹淑芬;[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報;2009年
4 王建華 山東省濟(jì)南醫(yī)院糖尿病診療中心;[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報;2011年
5 本報記者 張士國;[N];健康報;2011年
6 記者 李天舒;[N];健康報;2008年
7 笑陽;[N];工人日報;2009年
8 岳陽;[N];中國醫(yī)藥報;2009年
9 駐滬記者 魏赟;[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報;2011年
10 保健時報記者 何召霞;[N];保健時報;2010年
中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 陳愛榮;1、葉酸代謝酶相關(guān)亞甲基四氫葉酸還原酶基因多態(tài)性與2型糖尿病及代謝綜合征易感性的關(guān)聯(lián)研究 2、膀胱癌石蠟包埋組織microRNA檢測及臨床意義的初步探討[D];蘭州大學(xué);2010年
2 王雷;胰管內(nèi)乳頭狀粘液性腫瘤:臨床特征與microRNA的差異表達(dá)[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2010年
3 崔熠;microRNA在砷致胚胎發(fā)育毒性中的作用機制研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2011年
4 王鎮(zhèn);食管黏膜鱗狀上皮癌變相關(guān)microRNA的研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2011年
5 侯晉;microRNA在病毒感染和肝細(xì)胞癌中的作用及相關(guān)機制研究[D];清華大學(xué);2010年
6 駱黎靜;人卵巢癌干細(xì)胞的分離、鑒定及其特異性microRNA的篩選[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2011年
7 于曼麗;Let-7d對血管平滑肌細(xì)胞增殖調(diào)控的研究[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2011年
8 陳勇;microRNA-200c在胃癌SGC7901/CDDP細(xì)胞中的作用及其機制的研究[D];河北醫(yī)科大學(xué);2011年
9 于琦;雄激素受體在乳腺癌中表達(dá)意義和相關(guān)microRNA篩選的研究[D];天津醫(yī)科大學(xué);2010年
10 翁春華;血管生成素特異microRNAs的鑒定與功能分析[D];浙江大學(xué);2010年
中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 鄭曉燕;1型糖尿病與HLA-DRB1基因頻率的關(guān)聯(lián)研究[D];山西醫(yī)科大學(xué);2010年
2 陳浩;視黃醇結(jié)合蛋白4與2型糖尿病及頸動脈中層內(nèi)膜厚度的相關(guān)性研究[D];廣西醫(yī)科大學(xué);2012年
3 孟湧生;黃連素對2型糖尿病血脂異常調(diào)脂研究[D];中國中醫(yī)科學(xué)院;2010年
4 楊彬;RBP4單核苷酸多態(tài)性與2型糖尿病的相關(guān)性研究[D];南華大學(xué);2010年
5 李翔;2型糖尿病與肺癌的相關(guān)性分析[D];廣西醫(yī)科大學(xué);2012年
6 石鑫;SRC-1基因多態(tài)性與2型糖尿病的關(guān)聯(lián)性研究[D];吉林大學(xué);2012年
7 馬靜;廣西壯族人Caveolin-3基因多態(tài)性與2型糖尿病的關(guān)系[D];廣西醫(yī)科大學(xué);2011年
8 曾俊;利拉魯肽對2型糖尿病人血漿Omentin水平的影響[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2011年
9 王玲;AHSG基因多態(tài)性、血漿水平及骨密度改變與2型糖尿病下肢動脈粥樣硬化的相關(guān)性研究[D];昆明醫(yī)學(xué)院;2010年
10 湯珂珂;2型糖尿病臨床路徑管理初探及治療成本效益分析[D];浙江大學(xué);2010年
本文關(guān)鍵詞:MicroRNA靶位點多態(tài)性與2型糖尿病遺傳易感性的關(guān)聯(lián)研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號:174818
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