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急性腎損傷轉(zhuǎn)錄組學(xué)特征分析及潛在生物標(biāo)記物的研究

發(fā)布時間:2024-04-06 16:55
  急性腎損傷(Acute kidney injury,AKI)是臨床中常見的急重癥之一,據(jù)估計,我國2013年約有290萬成年住院患者罹患AKI,其中約70萬患者死亡。血肌酐和尿量是診斷AKI的重要指標(biāo),但上述指標(biāo)受諸多因素的影響。近年,隨著人類基因組學(xué)及生物樣本大數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建發(fā)展,對AKI相關(guān)數(shù)據(jù)的合理利用,能夠幫助我們發(fā)現(xiàn)新型標(biāo)記物,挖掘出基因?qū)用鏉撛诘牟±砩韺W(xué)機制。目的:1.基于生物信息學(xué)理論挖掘AKI轉(zhuǎn)錄組芯片數(shù)據(jù)的信息特征;2.尋找能夠早期預(yù)測AKI的新型準(zhǔn)確的生物標(biāo)記物;3.探討該標(biāo)記物相關(guān)的病理生理機制。方法:1.檢索在歐洲生物信息學(xué)研究所(European bioinformatics institute,EBI)和美國國家生物技術(shù)信息中心數(shù)據(jù)庫(National Center for Biotechnology Information,NCBI)中AKI相關(guān)的轉(zhuǎn)錄組芯片數(shù)據(jù)集;2.利用網(wǎng)頁工具、R軟件等對數(shù)據(jù)集的每一項研究中的實驗組和對照組數(shù)據(jù)進行差異表達基因(Differentially expressed genes,DEGs)計算分析;3.利用“clusterP...

【文章頁數(shù)】:57 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖2-3JUNB在不同實驗組中的表達情況

圖2-3JUNB在不同實驗組中的表達情況

b,c中,藍色、紅色點分別代表有顯著性低表達、高表達的DEGs,黑色代表無明顯意義的差異基因。熱圖為4個數(shù)據(jù)集所共同的DEGs。圖2-3JUNB在不同實驗組中的表達情況



本文編號:3946907

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