DNA羥甲基化和組蛋白甲基化表觀修飾的疾病關(guān)聯(lián)性研究
發(fā)布時(shí)間:2023-01-30 20:18
絕大多數(shù)人類重大疾病的病因和發(fā)病機(jī)制極其復(fù)雜。近年來(lái)大量研究表明表觀遺傳在許多人類疾病的形成過(guò)程中起著重要的作用。最近研究發(fā)現(xiàn),一種新的DNA修飾一一5羥甲基胞嘧啶(5hmC)在許多組織中廣泛存在。5hmC作為一種新的表觀遺傳標(biāo)記,與許多人類疾病的關(guān)聯(lián)所知甚少。在本論文中,我們綜合利用分子生物學(xué)、生物化學(xué)、基因組學(xué)和生物信息學(xué)交叉手段,探尋DNA羥甲基化和組蛋白甲基化與肺腺癌和男性不育癥的關(guān)聯(lián)性。 肺癌列居惡性腫瘤致死類型的首位,其中肺腺癌是常見(jiàn)的肺癌類型。與癌旁組織相比,我們發(fā)現(xiàn)5hmC在肺腺癌組織中出現(xiàn)大量缺失的現(xiàn)象。進(jìn)一步利用化學(xué)標(biāo)記和生物素親和吸附方法富集了一例肺腺癌患者癌組織和癌旁組織含5hmC的DNA片段并應(yīng)用于高通量測(cè)序,生物信息分析表明5hmC在肺腺癌基因組中主要以中等密度CpGs分布于基因的內(nèi)含子和基因間區(qū)域。通過(guò)分析比較肺腺癌組織及對(duì)應(yīng)的癌旁組織,我們發(fā)現(xiàn)肺腺癌的5hmC缺失與許多重要的癌癥通路和癌癥相關(guān)信號(hào)通路密切相關(guān)。我們的結(jié)果表明在肺腺癌的發(fā)生發(fā)展過(guò)程中,5hmC的丟失可能是肺腺癌的一種表觀遺傳標(biāo)志。另一方面,我們還繪制了一例肺腺患者癌組織及其癌旁組織的...
【文章頁(yè)數(shù)】:51 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
致謝
摘要
ABSTRACT
專業(yè)詞匯中英文對(duì)照表
1 引言
1.1 表觀遺傳學(xué)
1.1.1 DNA甲基化
1.1.2 組蛋白修飾
1.2 表觀遺傳學(xué)與癌癥
1.3 表觀遺傳學(xué)與不育癥
1.4 本論文的主要內(nèi)容及研究意義
1.4.1 選題依據(jù)和研究意義
1.4.2 主要研究?jī)?nèi)容及技術(shù)路線
2 材料與方法
2.1 病例樣本獲取及處理
2.2 基因組DNA提取
2.2.1 肺癌組織基因組DNA提取
2.2.2 精子基因組DNA提取
2.3 DNA斑點(diǎn)雜交
2.4 5hmC DNA富集
2.5 染色體免疫共沉淀
2.6 文庫(kù)構(gòu)建及測(cè)序
2.7 生物信息學(xué)分析
3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.1 肺腺癌5hmC和組蛋白甲基化圖譜及變化規(guī)律
3.1.1 肺腺癌基因組5hmC水平變化
3.1.2 肺腺癌5hmC DNA的富集及測(cè)序
3.1.3 5hmC在肺腺癌中的分布及特征
3.1.4 肺腺癌5hmC的缺失與重要癌癥通路相關(guān)聯(lián)
3.1.5 肺腺癌組蛋白甲基化圖譜
3.2 精子5hmC DNA甲基化圖譜及變化規(guī)律
3.2.1 人正常和畸形精子提取和分離
3.2.2 檢測(cè)5hmC在精子基因組中的含量
3.2.3 5hmC在精子基因組的分布及特點(diǎn)
3.2.4 精子基因組5hmC功能富集分析
3.2.5 5hmC與印記基因
4 分析與討論
4.1 5hmC DNA和組蛋白甲基化對(duì)肺腺癌發(fā)生發(fā)展的作用及機(jī)制
4.2 5hmC DNA調(diào)控精子發(fā)育及其不育的作用及機(jī)制
參考文獻(xiàn)
附錄
作者簡(jiǎn)介及在學(xué)期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果
本文編號(hào):3733413
【文章頁(yè)數(shù)】:51 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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致謝
摘要
ABSTRACT
專業(yè)詞匯中英文對(duì)照表
1 引言
1.1 表觀遺傳學(xué)
1.1.1 DNA甲基化
1.1.2 組蛋白修飾
1.2 表觀遺傳學(xué)與癌癥
1.3 表觀遺傳學(xué)與不育癥
1.4 本論文的主要內(nèi)容及研究意義
1.4.1 選題依據(jù)和研究意義
1.4.2 主要研究?jī)?nèi)容及技術(shù)路線
2 材料與方法
2.1 病例樣本獲取及處理
2.2 基因組DNA提取
2.2.1 肺癌組織基因組DNA提取
2.2.2 精子基因組DNA提取
2.3 DNA斑點(diǎn)雜交
2.4 5hmC DNA富集
2.5 染色體免疫共沉淀
2.6 文庫(kù)構(gòu)建及測(cè)序
2.7 生物信息學(xué)分析
3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.1 肺腺癌5hmC和組蛋白甲基化圖譜及變化規(guī)律
3.1.1 肺腺癌基因組5hmC水平變化
3.1.2 肺腺癌5hmC DNA的富集及測(cè)序
3.1.3 5hmC在肺腺癌中的分布及特征
3.1.4 肺腺癌5hmC的缺失與重要癌癥通路相關(guān)聯(lián)
3.1.5 肺腺癌組蛋白甲基化圖譜
3.2 精子5hmC DNA甲基化圖譜及變化規(guī)律
3.2.1 人正常和畸形精子提取和分離
3.2.2 檢測(cè)5hmC在精子基因組中的含量
3.2.3 5hmC在精子基因組的分布及特點(diǎn)
3.2.4 精子基因組5hmC功能富集分析
3.2.5 5hmC與印記基因
4 分析與討論
4.1 5hmC DNA和組蛋白甲基化對(duì)肺腺癌發(fā)生發(fā)展的作用及機(jī)制
4.2 5hmC DNA調(diào)控精子發(fā)育及其不育的作用及機(jī)制
參考文獻(xiàn)
附錄
作者簡(jiǎn)介及在學(xué)期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果
本文編號(hào):3733413
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