ⅢA型CP/CPPS患者精液中ncRNA表達譜鑒定及miRNA差異篩選
發(fā)布時間:2020-12-21 19:27
目的:檢測ⅢA型CP/CPPS患者精液中ncRNA的表達譜,并對健康男性和ⅢA型CP/CPPS患者精液中miRNA進行篩選。方法:篩選ⅢA型CP/CPPS患者,留取精液作為疾病組,以健康成年男性精液作為對照,分別提取總RNA。通過膠回吸收方法收集ncRNA,引入3’和5’adaptor接頭,RT-PCR方法建立ncRNA cDNA文庫,采用solexa高通量測序技術分析兩組患者精液中ncRNA表達情況,并對比分析患者精液與正常精液中miRNA差異表達,篩選出主要差異表達的miRNA分子。結果:1、疾病組中的特有序列與Genbank中ncRNA進行比對,發(fā)現(xiàn)1341489個序列中rRNA117574個、scRNA7300個、snRNA4347個、snoRNA889個、tRNA49431個、其他1161948個;疾病組的公共序列與Genbank中ncRNA進行比對,發(fā)現(xiàn)39833420個序列中rRNA13484159個、scRNA1017352個、snRNA328085個、snoRNA5364個、tRNA5245222個、其他19753238個。2、最終納入差異分析的miRNA共486個,...
【文章來源】:蘭州大學甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:54 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
縮略詞表
前言
一、材料與方法
1 材料
1.1 試劑及儀器
2 研究方法
2.1 標本選擇
2.1.1 標本來源
2.1.2 常規(guī)檢查及?茊栐\
2.1.3 納入及排除標準
2.1.4 知情同意及科研倫理報告
2.2 標本收集
2.2.1 前列腺液檢查標準
2.2.2 前列腺液收集
2.3 精液處理
2.3.1 精液留取
2.3.2 精液分離處理
2.3.3 混合后精液的處理
2.4 RNA的處理
2.4.1 提取RNA
2.4.2 RNA質(zhì)量的檢測
2.5 膠分離及回收ncRNA
2.5.1 膠分離ncRNA
2.5.2 回收ncRNA
2.6 5'端及3'端adaptor連接
2.6.1 5'端adaptor連接
2.6.2 純化回收5端adaptor連接產(chǎn)物
2.6.3 3'端adaptor連接
2.6.4 3'端adaptor連接純化回收連接產(chǎn)物
2.7 ncRNA cDNA文庫建立
2.7.1 RT-PCR擴增
2.7.2 PCR產(chǎn)物回收純化
2.7.3 Small RNA已制備產(chǎn)物經(jīng)Agilent2100檢測
2.8 Solexa檢測
2.9 統(tǒng)計分析
二、結果
1 參與者基本信息
2 ncRNA質(zhì)量及長度分布
3 疾病組與對照組公共特有序列
4 疾病組與對照組標準信息分析
4.1 疾病組與對照組基因組比對
4.2 sRNA重復序列比對
5 Genbank中ncRNA的小RNA統(tǒng)計
6 匹配內(nèi)含子、外顯子的sRNA統(tǒng)計
7 sRNA的分布
8 差異分析
8.1 聚類分析
8.2 主要差異表達分子
三、討論
四、結論
五、參考文獻
六、附綜述
參考文獻
七、在學期間的研究成果
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]不同類型慢性前列腺炎前列腺液鋅含量的分布及意義[J]. 周任遠,張燕賓,馬鳳寧,何家揚. 臨床泌尿外科雜志. 2004(03)
本文編號:2930367
【文章來源】:蘭州大學甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:54 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
縮略詞表
前言
一、材料與方法
1 材料
1.1 試劑及儀器
2 研究方法
2.1 標本選擇
2.1.1 標本來源
2.1.2 常規(guī)檢查及?茊栐\
2.1.3 納入及排除標準
2.1.4 知情同意及科研倫理報告
2.2 標本收集
2.2.1 前列腺液檢查標準
2.2.2 前列腺液收集
2.3 精液處理
2.3.1 精液留取
2.3.2 精液分離處理
2.3.3 混合后精液的處理
2.4 RNA的處理
2.4.1 提取RNA
2.4.2 RNA質(zhì)量的檢測
2.5 膠分離及回收ncRNA
2.5.1 膠分離ncRNA
2.5.2 回收ncRNA
2.6 5'端及3'端adaptor連接
2.6.1 5'端adaptor連接
2.6.2 純化回收5端adaptor連接產(chǎn)物
2.6.3 3'端adaptor連接
2.6.4 3'端adaptor連接純化回收連接產(chǎn)物
2.7 ncRNA cDNA文庫建立
2.7.1 RT-PCR擴增
2.7.2 PCR產(chǎn)物回收純化
2.7.3 Small RNA已制備產(chǎn)物經(jīng)Agilent2100檢測
2.8 Solexa檢測
2.9 統(tǒng)計分析
二、結果
1 參與者基本信息
2 ncRNA質(zhì)量及長度分布
3 疾病組與對照組公共特有序列
4 疾病組與對照組標準信息分析
4.1 疾病組與對照組基因組比對
4.2 sRNA重復序列比對
5 Genbank中ncRNA的小RNA統(tǒng)計
6 匹配內(nèi)含子、外顯子的sRNA統(tǒng)計
7 sRNA的分布
8 差異分析
8.1 聚類分析
8.2 主要差異表達分子
三、討論
四、結論
五、參考文獻
六、附綜述
參考文獻
七、在學期間的研究成果
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]不同類型慢性前列腺炎前列腺液鋅含量的分布及意義[J]. 周任遠,張燕賓,馬鳳寧,何家揚. 臨床泌尿外科雜志. 2004(03)
本文編號:2930367
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