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ⅢA型CP/CPPS患者精液中ncRNA表達(dá)譜鑒定及miRNA差異篩選

發(fā)布時(shí)間:2020-12-21 19:27
  目的:檢測(cè)ⅢA型CP/CPPS患者精液中ncRNA的表達(dá)譜,并對(duì)健康男性和ⅢA型CP/CPPS患者精液中miRNA進(jìn)行篩選。方法:篩選ⅢA型CP/CPPS患者,留取精液作為疾病組,以健康成年男性精液作為對(duì)照,分別提取總RNA。通過(guò)膠回吸收方法收集ncRNA,引入3’和5’adaptor接頭,RT-PCR方法建立ncRNA cDNA文庫(kù),采用solexa高通量測(cè)序技術(shù)分析兩組患者精液中ncRNA表達(dá)情況,并對(duì)比分析患者精液與正常精液中miRNA差異表達(dá),篩選出主要差異表達(dá)的miRNA分子。結(jié)果:1、疾病組中的特有序列與Genbank中ncRNA進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)1341489個(gè)序列中rRNA117574個(gè)、scRNA7300個(gè)、snRNA4347個(gè)、snoRNA889個(gè)、tRNA49431個(gè)、其他1161948個(gè);疾病組的公共序列與Genbank中ncRNA進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)39833420個(gè)序列中rRNA13484159個(gè)、scRNA1017352個(gè)、snRNA328085個(gè)、snoRNA5364個(gè)、tRNA5245222個(gè)、其他19753238個(gè)。2、最終納入差異分析的miRNA共486個(gè),... 

【文章來(lái)源】:蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:54 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
縮略詞表
前言
一、材料與方法
    1 材料
        1.1 試劑及儀器
    2 研究方法
        2.1 標(biāo)本選擇
            2.1.1 標(biāo)本來(lái)源
            2.1.2 常規(guī)檢查及?茊(wèn)診
            2.1.3 納入及排除標(biāo)準(zhǔn)
            2.1.4 知情同意及科研倫理報(bào)告
        2.2 標(biāo)本收集
            2.2.1 前列腺液檢查標(biāo)準(zhǔn)
            2.2.2 前列腺液收集
        2.3 精液處理
            2.3.1 精液留取
            2.3.2 精液分離處理
            2.3.3 混合后精液的處理
        2.4 RNA的處理
            2.4.1 提取RNA
            2.4.2 RNA質(zhì)量的檢測(cè)
        2.5 膠分離及回收ncRNA
            2.5.1 膠分離ncRNA
            2.5.2 回收ncRNA
        2.6 5'端及3'端adaptor連接
            2.6.1 5'端adaptor連接
            2.6.2 純化回收5端adaptor連接產(chǎn)物
            2.6.3 3'端adaptor連接
            2.6.4 3'端adaptor連接純化回收連接產(chǎn)物
        2.7 ncRNA cDNA文庫(kù)建立
            2.7.1 RT-PCR擴(kuò)增
            2.7.2 PCR產(chǎn)物回收純化
            2.7.3 Small RNA已制備產(chǎn)物經(jīng)Agilent2100檢測(cè)
        2.8 Solexa檢測(cè)
        2.9 統(tǒng)計(jì)分析
二、結(jié)果
    1 參與者基本信息
    2 ncRNA質(zhì)量及長(zhǎng)度分布
    3 疾病組與對(duì)照組公共特有序列
    4 疾病組與對(duì)照組標(biāo)準(zhǔn)信息分析
        4.1 疾病組與對(duì)照組基因組比對(duì)
        4.2 sRNA重復(fù)序列比對(duì)
    5 Genbank中ncRNA的小RNA統(tǒng)計(jì)
    6 匹配內(nèi)含子、外顯子的sRNA統(tǒng)計(jì)
    7 sRNA的分布
    8 差異分析
        8.1 聚類分析
        8.2 主要差異表達(dá)分子
三、討論
四、結(jié)論
五、參考文獻(xiàn)
六、附綜述
    參考文獻(xiàn)
七、在學(xué)期間的研究成果
致謝


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不同類型慢性前列腺炎前列腺液鋅含量的分布及意義[J]. 周任遠(yuǎn),張燕賓,馬鳳寧,何家揚(yáng).  臨床泌尿外科雜志. 2004(03)



本文編號(hào):2930367

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