發(fā)布時間：2020-10-17 16:42

　　 研究目的:該研究在同領(lǐng)域者研究的基礎(chǔ)上,目的在于:1.發(fā)現(xiàn)肌層浸潤性膀胱癌患者不同臨床病理特征與KRT6B表達(dá)水平的關(guān)系。2.評估腫瘤組織和癌旁正常組織中KRT6B表達(dá)的關(guān)系。3.探討KRT6B表達(dá)與肌層浸潤性膀胱癌患者預(yù)后的關(guān)系。4.尋找KRT6B在膀胱癌腫瘤細(xì)胞上表達(dá)的位置。希望通過該研究能夠找到跟膀胱癌有關(guān)的新的標(biāo)記物,以利于膀胱癌的診斷,以利于后期評估患者預(yù)后。給治療新靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)提供新的方向和思路。研究方法:膀胱癌患者腫瘤組織及癌旁正常組織的所有基因mRNA表達(dá)的原始數(shù)據(jù)來源于TCGA公共數(shù)據(jù)庫。我們從中獲得所需要的KRT6B mRNA原始表達(dá)數(shù)據(jù)。從Firehose上獲取膀胱癌患者的所有臨床資料信息。利用R軟件和edgeR包標(biāo)準(zhǔn)化KRT6B mRNA表達(dá)譜原始數(shù)據(jù)。然后將數(shù)據(jù)與臨床進(jìn)行資料整合。經(jīng)過排除,最終選定403例肌層浸潤性膀胱癌病例和19例癌旁正常組織。定義KRT6B mRNA表達(dá)量≥中位數(shù)(35.80)為高表達(dá)。KRT6B mRNA表達(dá)量35.80為低表達(dá)。評定各臨床病理特征與KRT6B mRNA表達(dá)水平的關(guān)系采用卡方檢驗(yàn)。腫瘤組織與癌旁正常組織KRT6B mRNA表達(dá)量的關(guān)系用非參數(shù)檢驗(yàn)。分析膀胱癌的預(yù)后采用Cox回歸分析。采用Kaplan-Meier法繪制相關(guān)生存曲線。當(dāng)P0.05時才認(rèn)為具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。為了觀察KRT6B蛋白在膀胱癌的表達(dá)位置,我們采用免疫組化染色方法。研究結(jié)果:1.KRT6B mRNA在患者不同性別之間(P0.05)、不同膚色之間(P0.05)、不同病理分級之間(P0.05)、不同亞型之間(P0.05)以及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移與否(P0.05)中差異均存在統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。KRT6B mRNA在不同年齡、腫瘤浸潤深度、淋巴管血管的侵犯情況、復(fù)發(fā)情況之間的差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P值0.05)。2.KRT6B mRNA在肌層浸潤性膀胱癌腫瘤組織和癌旁正常組織中的表達(dá)存在顯著性差異(P0.05)。MIBC腫瘤組織中KRT6B mRNA的表達(dá)量較癌旁正常組織高。3.經(jīng)COX單因素、多因素分析結(jié)果顯示:MIBC患者的KRT6B mRNA的表達(dá)水平、年齡、復(fù)發(fā)情況、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況和腫瘤的浸潤深度都是影響MIBC患者總生存期的獨(dú)立危險因素(P均0.05),MIBC組織學(xué)亞型與其預(yù)后也相關(guān)。然而MIBC的膚色、性別、脈管侵犯情況同MIBC患者預(yù)后的關(guān)系統(tǒng)計(jì)結(jié)果無明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。4.免疫組化結(jié)果顯示KRT6B蛋白在膀胱癌腫瘤細(xì)胞的胞膜和胞漿均可表達(dá)。結(jié)論1.KRT6B可能參與了MIBC的發(fā)生和進(jìn)展。2.KRT6B的表達(dá)水平影響MIBC患者的預(yù)后。3.KRT6B蛋白在膀胱癌腫瘤組織中有表達(dá),且細(xì)胞漿或細(xì)胞膜上表達(dá)。
【學(xué)位單位】：天津醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位年份】：2019
【中圖分類】：R737.14
【部分圖文】：

膀胱癌的表達(dá)及預(yù)后意義1.1 對象和方法1.1.1 研究對象1.1.1.1 KRT6B mRNA 表達(dá)數(shù)據(jù)及臨床資料的來源本研究的所有數(shù)據(jù)均來源于 TCGA 公共數(shù)據(jù)庫。進(jìn)入 TCGA 官網(wǎng)（https://cancergenome.nih.gov/），登陸 GDC 數(shù)據(jù)門戶。在“Repository”界面下設(shè)定檢索條件，如圖 1.1。其一、Cases 條件界面中 Primary Site 選定 Bladder；Program選定 TCGA；其它條件為系統(tǒng)默認(rèn)選項(xiàng)。其二 Files 條件界面選項(xiàng)中選定Transcriptome Profiling，Gene Expression Quantification 和 HTSeq – Counts；Files中的其它條件為系統(tǒng)默認(rèn)選項(xiàng)。最終從中共獲取 433 個膀胱癌患者樣本原始基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)，其中包括 414 例膀胱癌腫瘤組織和 19 例癌旁正常膀胱組織的原始 mRNA 表達(dá)數(shù)據(jù)。

圖1.2 FIREHOSE登陸界面1.1.1.2 入組標(biāo)準(zhǔn)納入標(biāo)準(zhǔn)：①包含KRT6B mRNA原始表達(dá)數(shù)據(jù)的膀胱癌病例；②有基本資料和臨床病理信息的病例；③被明確診斷為MIBC的病例；④已經(jīng)死亡的病例且有明確死亡時間的病例；⑤膀胱癌癌旁正常組織病例。排除標(biāo)準(zhǔn)：①排除無臨床基本資料和病理信息的病例；②排除被明確診斷為NMIBC的病例；③排除已死亡的卻沒有明確死亡時間的病例；④排除重復(fù)檢測的病例。由于TCGA數(shù)據(jù)庫中膀胱癌患者臨床資料信息的收錄存在不同程度的缺失，我們將各組內(nèi)沒有相關(guān)臨床資料信息的病例予以剔除。所以最終納入各臨床特征下的病例總數(shù)不均相等。

T2、T3、T4期MIBC患者K-M生存曲線（P＜0.05）
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本文編號：2845054