【摘要】：目的通過ChinaPca全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)數(shù)據(jù)中驗(yàn)證、免疫組化實(shí)驗(yàn)及公共數(shù)據(jù)庫分析,探討低密度蛋白受體相關(guān)蛋白1基因(LRP1)基因?qū)η傲邢侔?PCa)的影響。方法基于前期26例廣西壯族人群PCa組織全外顯子測序結(jié)果,選擇可能和PCa相關(guān)的LRP1基因,在ChinaPCa的GWAS數(shù)據(jù)中對9個LRP1的單核苷酸多態(tài)性(SNP)進(jìn)行驗(yàn)證;分別取PCa、癌旁和前列腺炎組織各12、18和4例進(jìn)行免疫組化實(shí)驗(yàn);分析癌癥和腫瘤基因圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫的LRP1基因表達(dá)數(shù)據(jù),對TCGA和(基因型組織表達(dá))GTEx數(shù)據(jù)庫的LRP1基因表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行作圖,在STRING網(wǎng)站構(gòu)建蛋白與蛋白交互網(wǎng)絡(luò)(PPI)圖,并驗(yàn)證相關(guān)基因聯(lián)系。統(tǒng)計分析采用SPSS及STATA軟件。結(jié)果ChinaPCa GWAS數(shù)據(jù)驗(yàn)證結(jié)果顯示LRP1的rs11172113和PCa可能存在關(guān)聯(lián)(P=0.083),其中TC基因型和PCa風(fēng)險關(guān)聯(lián)顯著(OR=1.27,95%CL,1.066-1.505,P=0.007)。免疫組化實(shí)驗(yàn)及TCGA數(shù)據(jù)庫統(tǒng)計分析顯示LRP1在PCa和癌旁組織的表達(dá)無統(tǒng)計學(xué)差異(分別為P=0.167,P=0.729),TCGA和GTEx數(shù)據(jù)庫聯(lián)合作圖顯示LRP1在癌組織表達(dá)量降低(P0.05),PPI網(wǎng)絡(luò)研究結(jié)果顯示LRP1與前列腺癌通路相關(guān)基因PLAT、PDGFB、PDGFRB有關(guān)聯(lián)(P0.05)。結(jié)論LRP1基因的rs11172113和前列腺癌有關(guān),LRP1基因在前列腺癌組織的低表達(dá)可能和前列腺癌有關(guān)。LRP1可能通過調(diào)節(jié)相關(guān)基因來調(diào)控前列腺癌相關(guān)通路。
【學(xué)位授予單位】：廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2019
【分類號】：R737.25
【圖文】：

免疫組化結(jié)果顯示其中在 4 例前列腺炎組織中有 2 例 LRP1 染色呈陰性（-）（圖 2-1.b），1 例 LRP1 染色呈弱陽性（1+），1 例 LRP1 染色呈中等強(qiáng)度陽性（2+） ；在 18 例前列腺正常組織中有 8 例 LRP1 染色呈陰性（-）（圖 2-1.c），5 例 LRP1 染色呈弱陽性（1+），5 例 LRP1 染色呈中等強(qiáng)度陽性（2+）（圖 2-1.d）；在 12 例前列腺癌組織中有 7 例 LRP1 染色呈陰性（-）（圖 2-1.e），5 例 LRP1 染色呈弱陽性（1+）（圖 2-1.f）。癌組織與癌旁正常組織的 LRP1 表達(dá)量無統(tǒng)計學(xué)差異（P=0.133）；前列腺炎與癌旁正常組織的LRP1 表達(dá)量無統(tǒng)計學(xué)差異（P=1.000）。組織病理類型與 LRP1 染色分級統(tǒng)計如表 2-2 所示。

基于 ChinaPca 全基因組數(shù)據(jù)和基因表達(dá)量探討 LRP1 與前列腺癌的關(guān)系 Black 7 12.151±0.521Asian 2 12.587±1.040*P ＜0.05 為差異有統(tǒng)計學(xué)意義；a.前列腺組織分組、年齡組、前列腺癌 TNM 分期組的統(tǒng)計學(xué)方法采用兩獨(dú)立樣本 t 檢b.格里森評分分組、人種分組的統(tǒng)計學(xué)方法采用單因素 ANOVA 分析。

.在 GEPIA 網(wǎng)站中繪制在 TCGA 前列腺癌 vs TCGA 正常組織的箱形圖。e 2-3.Box plot of LRP1 Gene Expression in TCGA Prostate Cancal Tissue Drawn on GEPIA Website.The red box plot represen prostate cancer.The gray box plot represents the expression levGEX normal tissue.The expression level of LRP1 in cancer tisss（P＜0.05）.LRP1 基因的網(wǎng)絡(luò)互作分析結(jié)果本研究通過STRING網(wǎng)站構(gòu)建的LRP1基因的

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前9條

1 劉芬;許雪飛;王菲;張覓;彭文興;;LRP1對腦內(nèi)β淀粉樣蛋白水平的調(diào)節(jié)作用[J];中南藥學(xué);2013年07期

2 施詠梅;宇輝;柏峰;袁勇貴;鄧玲瓏;;LRP1基因多態(tài)性與遺忘型輕度認(rèn)知功能損害的相關(guān)性[J];江蘇醫(yī)藥;2010年05期

3 楊二平;彭飛;梁杰;杜遠(yuǎn)立;;敲低LRP1基因?qū)NF-α誘導(dǎo)的大鼠軟骨細(xì)胞損傷的影響[J];華中科技大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版);2016年04期

4 熊慧姊;于倩;宋軍;陳文娟;費(fèi)s貊

本文編號：2772995