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酮體代謝關(guān)鍵基因抑制腎透明細(xì)胞癌增殖和轉(zhuǎn)移的研究

發(fā)布時間:2020-04-21 06:34
【摘要】:研究背景腎細(xì)胞癌是泌尿系統(tǒng)中一種最常見的惡性腫瘤,約占成年人腎臟腫瘤的90%。腎細(xì)胞癌中最常見的病理類型為腎透明細(xì)胞癌,約占腎細(xì)胞癌的80%。以現(xiàn)在的技術(shù)手段,腎透明細(xì)胞癌早期診斷還比較困難,約30%-50%的患者在確診時已經(jīng)發(fā)生了轉(zhuǎn)移。由于腎透明細(xì)胞癌生物學(xué)特征復(fù)雜,而且對放化療均不敏感,目前根治性或部分腎切除是治療腎細(xì)胞癌的主要手段。雖然外科療效確切,但仍有20%-40%的患者術(shù)后出現(xiàn)局部復(fù)發(fā)或遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移。Ⅲ期和Ⅳ期腎透明細(xì)胞癌患者預(yù)后差,5年生存率僅有50%和10%。因此,對腎透明細(xì)胞癌發(fā)生發(fā)展和轉(zhuǎn)移機(jī)制進(jìn)行研究,將有利于腎透明細(xì)胞癌的臨床診斷和治療。酮體是脂肪酸在肝細(xì)胞分解氧化時產(chǎn)生的中間產(chǎn)物,包括乙酰乙酸、β-羥丁酸和丙酮。酮體由肝臟產(chǎn)生,然后轉(zhuǎn)運(yùn)至心、腎、腦及骨骼肌組織中進(jìn)行利用。腎臟作為酮體利用的重要器官,其酮體代謝能力很強(qiáng)。酮體作為體內(nèi)代謝的重要產(chǎn)物,與腫瘤的發(fā)生發(fā)展有著緊密的關(guān)系。ACAT1、BDH2和HMGCL作為酮體代謝的關(guān)鍵基因在多種腫瘤的研究中都有相關(guān)報道,而在腎透明細(xì)胞癌中研究較少。因此,本文將探索酮體代謝關(guān)鍵基因ACAT1、BDH2和HMGCL在腎透明細(xì)胞癌中的表達(dá)情況,并且探究其在腎透明細(xì)胞癌中的生物學(xué)功能。研究目的:探索ACAT1,BDH2和HMGCL基因在腎透明細(xì)胞癌中的轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平,及其對酮體代謝的調(diào)控作用,探究ACAT1,BDH2和HMGCL的異常表達(dá)對腎透明細(xì)胞癌惡性生物學(xué)行為的影響。研究方法:1.通過生物信息學(xué)的方法,運(yùn)用GCBI平臺、TCGA數(shù)據(jù)庫和GEPIA網(wǎng)站分析ACAT1、BDH2和HMGCL在腎透明細(xì)胞癌m RNA轉(zhuǎn)錄水平以及與臨床參數(shù)的關(guān)系。2.分別通過實時熒光定量PCR和免疫組織化學(xué)染色法分別驗證ACAT1、BDH2和HMGCL在腎透明細(xì)胞癌c DNA芯片中和腎透明細(xì)胞癌組織芯片中的轉(zhuǎn)錄和表達(dá)情況。3.構(gòu)建外源性過表達(dá)ACAT1、BDH2和HMGCL的腎透明細(xì)胞癌細(xì)胞系,通過CCK-8實驗繪制生長曲線,2D細(xì)胞遷移實驗和3D細(xì)胞侵襲實驗來檢測ACAT1、BDH2和HMGCL基因?qū)δI透明細(xì)胞癌中的惡性腫瘤生物學(xué)的影響。4.檢測外源性過表達(dá)ACAT1、BDH2和HMGCL的腎透明細(xì)胞癌細(xì)胞系細(xì)胞中的酮體含量。5.利用外源性酮體處理腎透明細(xì)胞癌細(xì)胞系,通過CCK-8實驗來驗證外源性酮體對腎透明細(xì)胞癌細(xì)胞系增殖能力的影響。研究結(jié)果:1.ACAT1、BDH2和HMGCL基因在腎透明細(xì)胞癌中表達(dá)水平下調(diào)。我們通過分析生物信息學(xué)數(shù)據(jù),結(jié)果發(fā)現(xiàn)相比于正常腎臟組織,ACAT1、BDH2和HMGCL在腎透明細(xì)胞癌組織中表達(dá)下調(diào)。而且ACAT1、BDH2和HMGCL的表達(dá)量與腎透明細(xì)胞癌的生存和預(yù)后相關(guān)。進(jìn)一步通過RT-q PCR驗證ACAT1、BDH2和HMGCL基因在腎透明細(xì)胞癌組織中轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平低于癌旁組織,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。進(jìn)一步利用免疫組織化學(xué)染色方法,比較90例腎透明細(xì)胞癌和90例癌旁組織,發(fā)現(xiàn)在癌組織中ACAT1、BDH2和HMGCL蛋白表達(dá)水平顯著低于癌旁組織,兩者之間差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。結(jié)果提示,ACAT1、BDH2和HMGCL基因在腎透明細(xì)胞癌中表達(dá)下調(diào)。并且表達(dá)量高低與部分臨床參數(shù)相關(guān)。2.外源性過表達(dá)ACAT1,BDH2和HMGCL基因抑制腎透明細(xì)胞癌細(xì)胞的惡性生物學(xué)能力通過CCK-8細(xì)胞增殖實驗、細(xì)胞劃痕愈合實驗和Transwell實驗,發(fā)現(xiàn)外源性過表達(dá)ACAT1,BDH2和HMGCL可以抑制腎透明細(xì)胞癌的增殖能力和侵襲能力;外源性過表達(dá)ACAT1和BDH2可以抑制腎透明細(xì)胞癌的遷移能力。提示ACAT1,BDH2和HMGCL基因可抑制腎透明細(xì)胞癌細(xì)胞的惡性生物學(xué)行為。3.酮體β-羥丁酸抑制腎透明癌細(xì)胞增殖能力。通過β-羥丁酸檢測試劑盒檢測發(fā)現(xiàn),外源性過表達(dá)ACAT1和HMGCL基因可以增加腎透明細(xì)胞癌細(xì)胞中的酮體含量。通過CCK-8實驗發(fā)現(xiàn),外源性酮體β-羥丁酸可抑制腎透明細(xì)胞癌細(xì)胞的增殖能力,且其抑制強(qiáng)度隨著β-羥丁酸濃度升高而逐漸增加,具有濃度依賴性,提示ACAT1,BDH2和HMGCL基因可能是通過調(diào)控酮體代謝從而影響腎透明細(xì)胞癌的增殖。研究結(jié)論:1.ACAT1、BDH2和HMGCL基因在腎透明細(xì)胞癌中轉(zhuǎn)錄和表達(dá)下調(diào),而且表達(dá)量高低與患者預(yù)后有聯(lián)系。2.過表達(dá)ACAT1,BDH2和HMGCL可以抑制腎透明細(xì)胞癌的增殖和侵襲能力;過表達(dá)ACAT1和BDH2可以抑制腎透明細(xì)胞癌遷移。3.過表達(dá)ACAT1和HMGCL可以增加腎透明細(xì)胞癌細(xì)胞中β-羥丁酸的含量。4.外源性酮體β-羥丁酸抑制腎透明癌細(xì)胞增殖能力。
【圖文】:

腎透明細(xì)胞癌,基因表達(dá),芯片,平臺


將酮體代謝相關(guān)基因篩選出來,繪制了熱圖(Heatmap)。通過熱圖,我們發(fā)現(xiàn)相比于正常腎組織,ACAT1、BDH2和HMGCL基因在腎透明細(xì)胞癌中表達(dá)下調(diào)。(如圖1-1)圖1-1:通過GCBI平臺,發(fā)現(xiàn)腎透明細(xì)胞癌芯片中ACAT1、BDH2和HMGCL基因表達(dá)下調(diào)。Figure 1-1: Down-regulation of ACAT1, BDH2 and HMGCL gene expression in renal clear cell carcinomachips by GCBI.

腎透明細(xì)胞癌,數(shù)據(jù)庫,病理分期,統(tǒng)計學(xué)意義


明細(xì)胞癌和癌旁中的mRNA表達(dá)量。運(yùn)用獨(dú)立樣本t檢驗的方法計算出,這三個基因在腎透明細(xì)胞在組織中的mRNA水平的表達(dá)量顯著下調(diào),差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05,如圖1-2).圖1-2:TCGA數(shù)據(jù)庫中ACAT1、BDH2和HMGCLL在腎透明細(xì)胞癌和癌旁組織中的表達(dá)量Figure 1-2: ACAT1, BDH2, and HMGCLL expression in renal clear cell carcinoma and adjacent tissues inthe TCGA database2.2 ACAT1、BDH2 和 HMGCL 基因表達(dá)量與臨床參數(shù)的關(guān)系,高表達(dá)的患者預(yù)后更好我們從TCGA數(shù)據(jù)庫中提取了ACAT1、BDH2和HMGCL三個基因在腎透明細(xì)胞癌和癌旁中的mRNA表達(dá)量以及相對應(yīng)的臨床參數(shù),分析了三個基因的表達(dá)量與臨床參數(shù)的關(guān)系。我們發(fā)現(xiàn)ACAT1基因在較低的病理分期、較低的G分期、較低的T分期和沒有遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的人群中表達(dá)量更高,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。BDH2基因在女性,較低的病理分期、較低的T分期、沒有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和沒有遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的人群中表達(dá)量更高,,差異有統(tǒng)計學(xué)意義。HMGCL基因在較低的病理分期、較低的T分期的人群中表達(dá)量更高,差異有統(tǒng)計學(xué)意義。(見表1-1)表1-1:TCGA數(shù)據(jù)庫中ACAT1、BDH2和HMGCLL的表達(dá)量與臨床參數(shù)的關(guān)系。Table 1-1: Relationship between expression levels of ACAT1, BDH2 and HMGCLL and clinical parametersin the TCGA database.
【學(xué)位授予單位】:廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:R737.11

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