通路相關(guān)模塊研究七氟烷和異丙酚在OPCABG術(shù)中心肌保護作用
發(fā)布時間:2023-10-06 14:47
[研究背景]冠狀動脈疾病的發(fā)病趨勢近年逐漸增高。非體外循環(huán)冠狀動脈旁路移植術(shù)(off-pump coronary artery bypass graft,OPCABG)是常用的手術(shù)治療方法,其優(yōu)勢是避免了體外循環(huán)導(dǎo)致的全身炎性反應(yīng)、凝血功能紊亂及多器官功能障礙等并發(fā)癥。七氟烷和異丙酚是CABG中廣泛使用的麻醉藥物。研究發(fā)現(xiàn)異丙酚和七氟烷均具有一定的心血管保護特性,但二者的保護作用機制不同。在過去的幾十年中,許多實驗策略(關(guān)聯(lián)研究、全基因組關(guān)聯(lián)掃描、蛋白質(zhì)組學(xué)和全球微陣列基因表達分析)已經(jīng)被應(yīng)用到研究。Lucchinetti等對心臟手術(shù)麻醉中應(yīng)用吸入麻醉和靜脈麻醉在基因表達水平上進行直接比較。這些結(jié)果表明,麻醉誘導(dǎo)構(gòu)成的基因調(diào)節(jié)可通過調(diào)控心肌能量底物代謝,并可預(yù)測行OPCABG的患者術(shù)后心臟功能。然而,這些麻醉藥在基因水平上的潛在機制尚不清楚;蚬脖磉_網(wǎng)絡(luò)包含了在不同的生物體中表現(xiàn)出相似表達模式的基因。功能相關(guān)的基因經(jīng)常在組成保守轉(zhuǎn)錄模塊的生物體內(nèi)共表達。通過構(gòu)建一個共同表達網(wǎng)絡(luò),可以估計不同條件下的潛在的監(jiān)管關(guān)系。為了定義鄰接矩陣,我們使用了一個鄰接函數(shù),它將共表達的相似性轉(zhuǎn)化為連接...
【文章頁數(shù)】:129 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
英文摘要
符號說明
第一章 研究背景
1. 麻醉藥物在冠狀動脈旁路移植術(shù)中的心肌保護作用
1.1 冠心病
1.2 非體外循環(huán)冠狀動脈旁路移植術(shù)
1.3 麻醉藥物的心肌保護作用
2. 基因芯片技術(shù)及其在藥物作用機制中的應(yīng)用
2.1 基因芯片表達譜技術(shù)
2.2 基因芯片技術(shù)在藥物作用機制中的應(yīng)用
3. 生物信息學(xué)概況及基因表達譜數(shù)據(jù)庫
3.1 生物信息學(xué)概況
3.2 基因表達譜數(shù)據(jù)庫
3.3 KEGG數(shù)據(jù)庫
4. 基因表達譜通路富集分析
4.1 差異表達基因的識別
4.2 差異基因功能富集分析
5. 基因共表達網(wǎng)絡(luò)建設(shè)
6. 模塊挖掘和拓撲分析
7. 參考文獻
第二章 七氟烷和異丙酚在OPCABG術(shù)中通路相關(guān)的模塊
1. 前言
2. 資料和方法
2.1 數(shù)據(jù)收集
2.2 數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.3 差異表達基因的篩選
2.4 差異表達基因富集分析
2.5 共表達網(wǎng)絡(luò)分析與建設(shè)
2.6 通路相關(guān)的模塊挖掘和拓撲分析
3. 結(jié)果
3.1 差異表達基因
3.2 差異表達基因的KEGG通路分析
3.3 差異表達基因共表達網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與拓撲分析
3.4 通路相關(guān)模塊的挖掘與拓撲分析
4. 討論
4.1 通路相關(guān)模塊的討論
4.1.1 補體與凝血級聯(lián)通路相關(guān)模塊
4.1.2 細胞因子-細胞因子受體相互作用通路相關(guān)模塊
4.1.3 P53信號通路相關(guān)模塊
4.1.4 NOD樣受體信號通路相關(guān)模塊
4.1.5 趨化因子信號通路相關(guān)模塊
4.1.6 幽門螺桿菌感染上皮細胞信號通路模塊
4.1.7 MAPK信號通路相關(guān)模塊
4.1.8 JAK-STAT信號通路模塊
4.1.9 膀胱癌通路相關(guān)模塊
4.2 通路中重要基因的討論
4.2.1 表達值較高的基因
4.2.2 位于多個通路相關(guān)模塊中的基因
4.2.3 位于共表達網(wǎng)絡(luò)中心的基因
5. 結(jié)論
6. 附圖表
7. 參考文獻
第三章 總結(jié)與展望
1. 總結(jié)
2. 創(chuàng)新點
3. 展望
致謝
攻讀博士學(xué)位期間已發(fā)表或待發(fā)表的論文
學(xué)位論文評閱及答辯情況表
英文論文Ⅰ
英文論文Ⅱ
本文編號:3851908
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第一章 研究背景
1. 麻醉藥物在冠狀動脈旁路移植術(shù)中的心肌保護作用
1.1 冠心病
1.2 非體外循環(huán)冠狀動脈旁路移植術(shù)
1.3 麻醉藥物的心肌保護作用
2. 基因芯片技術(shù)及其在藥物作用機制中的應(yīng)用
2.1 基因芯片表達譜技術(shù)
2.2 基因芯片技術(shù)在藥物作用機制中的應(yīng)用
3. 生物信息學(xué)概況及基因表達譜數(shù)據(jù)庫
3.1 生物信息學(xué)概況
3.2 基因表達譜數(shù)據(jù)庫
3.3 KEGG數(shù)據(jù)庫
4. 基因表達譜通路富集分析
4.1 差異表達基因的識別
4.2 差異基因功能富集分析
5. 基因共表達網(wǎng)絡(luò)建設(shè)
6. 模塊挖掘和拓撲分析
7. 參考文獻
第二章 七氟烷和異丙酚在OPCABG術(shù)中通路相關(guān)的模塊
1. 前言
2. 資料和方法
2.1 數(shù)據(jù)收集
2.2 數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.3 差異表達基因的篩選
2.4 差異表達基因富集分析
2.5 共表達網(wǎng)絡(luò)分析與建設(shè)
2.6 通路相關(guān)的模塊挖掘和拓撲分析
3. 結(jié)果
3.1 差異表達基因
3.2 差異表達基因的KEGG通路分析
3.3 差異表達基因共表達網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與拓撲分析
3.4 通路相關(guān)模塊的挖掘與拓撲分析
4. 討論
4.1 通路相關(guān)模塊的討論
4.1.1 補體與凝血級聯(lián)通路相關(guān)模塊
4.1.2 細胞因子-細胞因子受體相互作用通路相關(guān)模塊
4.1.3 P53信號通路相關(guān)模塊
4.1.4 NOD樣受體信號通路相關(guān)模塊
4.1.5 趨化因子信號通路相關(guān)模塊
4.1.6 幽門螺桿菌感染上皮細胞信號通路模塊
4.1.7 MAPK信號通路相關(guān)模塊
4.1.8 JAK-STAT信號通路模塊
4.1.9 膀胱癌通路相關(guān)模塊
4.2 通路中重要基因的討論
4.2.1 表達值較高的基因
4.2.2 位于多個通路相關(guān)模塊中的基因
4.2.3 位于共表達網(wǎng)絡(luò)中心的基因
5. 結(jié)論
6. 附圖表
7. 參考文獻
第三章 總結(jié)與展望
1. 總結(jié)
2. 創(chuàng)新點
3. 展望
致謝
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本文編號:3851908
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