基于微衛(wèi)星DNA標記的山東微山湖區(qū)放養(yǎng)釘螺遺傳結(jié)構(gòu)分析
發(fā)布時間:2017-10-02 01:15
本文關(guān)鍵詞:基于微衛(wèi)星DNA標記的山東微山湖區(qū)放養(yǎng)釘螺遺傳結(jié)構(gòu)分析
更多相關(guān)文章: 微衛(wèi)星DNA 湖北釘螺 微山湖
【摘要】:目的分析在山東微山湖地區(qū)長期放養(yǎng)的湖北釘螺(Oncomelania hupensis)群體與其來源地江蘇省長江江灘釘螺群體之間的基因差異。方法收集江蘇省揚州市江都區(qū)、儀征市和丹陽市、南京市六合區(qū)的長江釘螺以及山東省濟寧市微山湖獨山島的釘螺。微山湖區(qū)放養(yǎng)的釘螺來自于揚州市江都區(qū),放養(yǎng)時間為10年(至2014年)。選擇A18、C22、T4-33、T6-17等4對微衛(wèi)星位點對釘螺群體進行PCR擴增,分析各釘螺群體的等位基因數(shù)(Na)、期望雜合度(He)、觀察雜合度(Ho)和群體間遺傳差異平均數(shù)等指標,并進行分子變異方差分析(AMOVA),用非加權(quán)組平均法(UPGMA)和鄰接法(NJ)構(gòu)建系統(tǒng)進化樹描述群體遺傳分化及聚類情況。使用Mantel檢驗探討遺傳距離與地理距離的相關(guān)性。結(jié)果本研究收集5個釘螺群體共103只釘螺。江都、儀征、丹陽、六合、微山湖群體的Na分別為7.50、12.50、10.00、11.50和12.75;Ho分別為0.16、0.27、0.17、0.30和0.22;He分別為0.81、0.91、0.84、0.90和0.92。微山湖群體的3個遺傳多樣性指標均在較高水平,提示有較好的遺傳多樣性,但與其他群體差異無統(tǒng)計學意義(P0.05)。微山湖與江都釘螺群體間遺傳差異平均數(shù)最小(0.79),丹陽群體與其他群體之間差異較大,為0.87~0.97。AMOVA分析的遺傳變異主要來源于釘螺個體間(占92.50%)。NJ和UPGMA系統(tǒng)進化樹顯示,江都和微山湖的釘螺群體聚為一支,儀征和六合的釘螺群體聚為一支,丹陽釘螺群體與其他4個群體聚為一支。Mantel檢驗顯示遺傳距離與地理距離沒有相關(guān)性。結(jié)論江蘇省長江釘螺群體與微山湖釘螺群體基因多樣性均較高,微山湖地區(qū)放養(yǎng)的釘螺與來源地的長江釘螺群體尚未出現(xiàn)明顯遺傳分化。
【作者單位】: 江蘇省血吸蟲病防治研究所 國家衛(wèi)生計生委寄生蟲病預防與控制技術(shù)重點實驗室 江蘇省寄生蟲與媒介控制技術(shù)重點實驗室;山東省醫(yī)學科學院 山東省寄生蟲病防治研究所;
【關(guān)鍵詞】: 微衛(wèi)星DNA 湖北釘螺 微山湖
【基金】:國家重大傳染病科技專項(No.2012ZX10004-220) 國家自然科學基金(No.81101275)~~
【分類號】:R184.38
【正文快照】: 作者單位:1江蘇省血吸蟲病防治研究所,國家衛(wèi)生計生委寄生蟲病預防與控制技術(shù)重點實驗室,江蘇省寄生蟲與媒介控制技術(shù)重點實驗室,無錫214064;2山東省醫(yī)學科學院,山東省寄生蟲病防治研究所,濟寧272033引物Primer引物序列(5′→3′)Primer sequence(5′→3′)重復序列Repeat mot,
本文編號:956727
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/liuxingb/956727.html
最近更新
教材專著