2009~2013年杭州地區(qū)甲型流感病毒基質蛋白基因的遺傳進化分析
本文關鍵詞:2009~2013年杭州地區(qū)甲型流感病毒基質蛋白基因的遺傳進化分析
【摘要】:為調查2009年至2013年杭州地區(qū)甲型流感病毒基質蛋白基因(Matrix protein,M)的遺傳進化特征,本文對5個連續(xù)的流行季中A(H1N1)pdm09亞型和季節(jié)性A(H3N2)亞型流行株的M基因序列進行了深入的研究分析。從兩家當?shù)厝壖椎柔t(yī)院發(fā)熱門診室共收集5675份流感樣病例樣本。利用病毒分離與實時熒光定量PCR法對樣本內所含病毒進行鑒定,發(fā)現(xiàn)流感病毒陽性率為20.46%,其中甲型流感病毒872株。從5個流行季的9個時間段內,隨機選取了76株甲型流感病毒進行M基因全序列測定和遺傳進化分析。研究發(fā)現(xiàn),杭州地區(qū)甲型流感病毒烷胺類耐藥相關位點M2蛋白的S31N突變率接近100%。兩株A(H1N1)pdm09本地流行株還發(fā)生了V27A/S31N或V27I/S31N雙位點耐藥突變。另外,在一株季節(jié)性A(H3N2)亞型流行株上還觀察到R45H/S31N雙位點耐藥突變。基于M基因序列進行系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現(xiàn),無論是病毒亞型間還是各流行季間,M基因進化速率明顯低于血凝素蛋白基因(Haemagglutinin,HA)和神經胺酸酶蛋白基因(Neuraminidase,NA)。對M1和M2蛋白的變異進行正向選擇壓力分析發(fā)現(xiàn),M2蛋白的編碼區(qū)所受到的選擇壓力要遠遠高于M1蛋白,且A(H1N1)pdm09亞型流行株所受到的選擇壓力要高于季節(jié)性A(H3N2)亞型。甲型流感病毒M基因的遺傳進化研究對判斷病毒的進化方向、預防和控制病毒的暴發(fā)流行具有重要的參考價值。
【作者單位】: 浙江中醫(yī)藥大學基礎醫(yī)學院;杭州市疾病預防控制中心;
【關鍵詞】: 甲型流感病毒 基質蛋白 進化 突變
【基金】:國家自然科學基金(31301098) 浙江省醫(yī)藥衛(wèi)生科技計劃(2013KYB219) 杭州市衛(wèi)生科技計劃(2011A055)資助
【分類號】:R373.13;R181.2
【正文快照】: 臨床上常用的抗流感病毒藥物有兩類,即針對基質蛋白離子通道的阻滯劑金剛烷胺類(Amanta-dine)和特異性結合神經氨酸酶的抑制劑。而目前流行的絕大多數(shù)流感病毒對烷胺類藥物都有很強的耐藥性,使得包括中國和美國在內的大多數(shù)國家?guī)缀醵挤艞壛送榘奉愃幬锏氖褂。病毒基質蛋白基
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,本文編號:880575
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