新疆北疆地區(qū)鼠類和體外寄生生物病原攜帶及遺傳特征研究
發(fā)布時間:2017-09-16 01:26
本文關(guān)鍵詞:新疆北疆地區(qū)鼠類和體外寄生生物病原攜帶及遺傳特征研究
更多相關(guān)文章: 鼠類 漢坦病毒 萊姆螺旋體 立克次體 利氏曼原蟲
【摘要】:目的:2010-2015年期間在新疆北疆地區(qū)選擇四類不同生境(包括烏魯木齊、伊寧及阿拉山口在內(nèi)的城區(qū)、精河縣南山牧區(qū)、準噶爾盆地西緣半荒漠生境和新源縣那拉提草原),選擇不同方法捕獲生境內(nèi)鼠類和采集體外寄生生物,以優(yōu)勢鼠種和寄生媒介為主分別進行漢坦病毒、萊姆螺旋體、立克次體、利氏曼原蟲等病原體檢測及開展遺傳進化分析,完善北疆地區(qū)鼠傳疾病研究并為針對相關(guān)疾病做到早期管控提供依據(jù)。方法:1)采用不同捕獲方法,收集北疆地區(qū)四類不同生境鼠種及體表寄生生物,開展物種形態(tài)學鑒定,并將宿主動物按要求進行解剖取材和保存;2)利用分子生物技術(shù)檢測褐家鼠漢坦病毒的M基因部分片段,通過做遺傳進化分析確定褐家鼠病毒感染及變異情況。同時檢測褐家鼠線粒體細胞色素b基因(Cytb),了解新疆輸入鼠種的遺傳變異情況;3)檢測伊犁普通田鼠Cytb基因和HV攜帶情況,選擇初篩陽性樣本開展S基因測定并做遺傳進化分析;4)開展大沙鼠及寄生媒介蜱、蚤攜帶萊姆螺旋體、利什曼原蟲及立克次體等病原分子生物學檢測,掌握病原攜帶流行病學情況;5)開展長尾黃鼠立克次體、萊姆螺旋體等病原攜帶檢測,并對檢測到立克次體運用多位點序列分析(MLSA)技術(shù),研究病原種屬地位。結(jié)果:1)從北疆區(qū)域不同生境共捕獲鼠類優(yōu)勢種1135只(其中褐家鼠458只,大沙鼠226只,長尾黃鼠253只,普通田鼠198只),蚤5123匹,螨699只,蜱3635只;2)從烏魯木齊市區(qū)褐家鼠臟器組織中檢測到漢城病毒(SEOV)核酸陽性樣本,陽性率為15%,呈高攜帶狀態(tài)。M片段核酸序列與疆外及國外相比,未表現(xiàn)出遺傳多樣性及地理聚集特征;3)新疆地區(qū)褐家鼠Cytb全基因檢測,并與疆外及國外褐家鼠Gen Bank上傳序列開展比對分析,未發(fā)現(xiàn)明顯獨立進化的現(xiàn)象;4)通過開展Cytb基因檢測確定伊犁新源縣那拉提草原采集普通田鼠為普通田鼠北疆亞種(Microtus arvali obscurus),并首次在中國境內(nèi)從普通田鼠北疆亞種檢出圖拉型漢坦病毒,陽性率為16%,通過對S基因做遺傳進化分析發(fā)現(xiàn)其與哈薩克斯坦東部檢出毒株更為近源;5)從準噶爾盆地西緣阿拉山口口岸周邊捕獲大沙鼠和體外寄生亞洲璃眼蜱檢出狹義萊姆螺旋體(B.burgdorferi sensu strict)陽性核酸片段,陽性率分別為24%,3%;檢出嗜吞噬細胞無形體(Anaplasma phagocytophilum)和查菲埃立克體(Ehrlichia chaffeensis)陽性核酸片段,陽性率分別為8%,31%和5%,34%;從大沙鼠和體外寄生臀突客蚤檢出都蘭利氏曼原蟲(Leishmania turanica)陽性核酸片段,陽性率分比為6%和2%;6)從長尾黃鼠和體外寄生草原革蜱檢出立克次體核酸陽性片段,陽性率分別為34%和53%,經(jīng)多序列位點分析確定為立克次體屬斑點熱群勞氏立克次體(Rickettsiae raoultii)。結(jié)論:1)雖然目前新疆無本地腎綜合征出血熱(HFRS)病例,但烏魯木齊部分區(qū)域褐家鼠SEOV出現(xiàn)高攜帶率,提示在烏魯木齊褐家鼠已經(jīng)作為保存宿主參與SEOV在當?shù)氐淖匀谎h(huán),烏魯木齊存在導致HFRS發(fā)病的病原、宿主和易感人群基礎(chǔ)。今后需要開展以烏魯木齊為重點的北疆城區(qū)人群和宿主動物漢坦病毒感染的長期監(jiān)測和研究工作,并采取措施減少人群暴露機會;2)本研究中除在烏魯木齊和伊犁新源縣那拉提草原分別捕獲褐家鼠和普通田鼠檢測到漢坦病毒核酸以外,其余所有鼠種均為陰性,提示其他鼠種所在生境可能不存在漢坦病毒傳播,但也不排除該宿主動物對漢坦病毒不易感的可能;3)從通過分子鑒定確認的普通田鼠北疆亞種組織樣本檢測到圖拉病毒核酸,為我國境內(nèi)新發(fā)現(xiàn)的新型漢坦病毒,豐富了我國境內(nèi)漢坦病毒的種屬分型,為全面做好我國漢坦病毒感染防控提供了依據(jù);4)從準噶爾盆地西緣鼠疫宿主-大沙鼠及體外寄生生物檢出萊姆、無形體、埃立克體及利氏曼病原核酸片段陽性樣本,表明準噶爾盆地大沙鼠棲息地半荒漠生境應(yīng)當是多種人獸共患病和病媒生物性疾病病原混合共存的自然疫源地,應(yīng)當加強相關(guān)宿主、媒介和病原監(jiān)測工作。另外從臀突客蚤檢出都蘭利氏曼原蟲,提示除白蛉作為主要媒介傳播皮膚利什曼病以外,蚤類也有可能作為伴隨媒介參與人群感染,應(yīng)繼續(xù)開展相關(guān)研究;5)首次運用分子生物檢測技術(shù)和MLSA方法從精河天山山地草原生境鼠疫宿主-長尾黃鼠及寄生草原革蜱中檢出勞氏立克次體,提示在該生境內(nèi)可能會造成當?shù)厝巳毫⒖舜误w感染,在該區(qū)域開展包括鼠疫、立克次體等病原在內(nèi)的疾病監(jiān)測研究具有重要的公共衛(wèi)生學意義。
【關(guān)鍵詞】:鼠類 漢坦病毒 萊姆螺旋體 立克次體 利氏曼原蟲
【學位授予單位】:新疆醫(yī)科大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:R184.3
【目錄】:
- 中英文縮略詞對照表5-9
- 摘要9-11
- Abstract11-14
- 前言14-19
- 第一部分 北疆地區(qū)鼠類漢坦病毒篩查和褐家鼠漢城病毒的檢出及遺傳特征研究19-44
- 1 研究內(nèi)容與方法19-28
- 1.1 研究對象19-21
- 1.2 試劑和材料21-22
- 1.3 內(nèi)容與方法22-28
- 2 結(jié)果28-40
- 3 討論40-43
- 4 小結(jié)43-44
- 第二部分 伊犁普通田鼠攜帶新型漢坦病毒的檢出及S基因測定分析44-64
- 1 研究內(nèi)容與方法44-46
- 1.1 研究對象44-45
- 1.2 試劑和材料45
- 1.3 內(nèi)容與方法45-46
- 2 結(jié)果46-60
- 3 討論60-63
- 4 小結(jié)63-64
- 第三部分 大沙鼠、長尾黃鼠及寄生生物攜帶萊姆螺旋體、立克次體等病原檢測及及多位點序列分析64-86
- 1 研究內(nèi)容與方法65-71
- 1.1 研究對象65
- 1.2 試劑和材料65
- 1.3 內(nèi)容與方法65-71
- 2 結(jié)果71-80
- 3 討論80-84
- 4 小結(jié)84-86
- 結(jié)論86-89
- 致謝89-90
- 參考文獻90-105
- 綜述一 哈薩克斯坦病媒生物性疾病105-114
- 參考文獻111-114
- 綜述二 漢坦病毒感染生態(tài)流行病學研究現(xiàn)狀114-123
- 參考文獻119-123
- 攻讀博士學位期間獲得的學術(shù)成果123-124
- 個人簡歷124-125
- 導師評閱表125
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1 郭剛;新疆北疆地區(qū)鼠類和體外寄生生物病原攜帶及遺傳特征研究[D];新疆醫(yī)科大學;2016年
,本文編號:860084
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