發(fā)布時(shí)間：2017-09-02 19:03

  本文關(guān)鍵詞：影響廣西防城港地區(qū)漢族成年男性癌胚抗原水平的遺傳變異分析及其臨床意義探討

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【摘要】：[研究內(nèi)容]本研究內(nèi)容分三部分：(1)對廣西特定地區(qū)的相同種族、成年男性健康人群的血清CEA(Carcinoembryonic Antigen)水平及其影響因素進(jìn)行流行病學(xué)調(diào)查。(2)在該人群中進(jìn)行血清CEA水平與單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn)的定量全基因組關(guān)聯(lián)分析。(3)分析影響該地區(qū)散發(fā)性結(jié)直腸癌患者血清CEA水平的遺傳變異及探討其臨床意義。 第一部分 [目的]了解廣西防城港地區(qū)的漢族成年男性健康人群的血清CEA水平分布及其相關(guān)影響因素。 [材料與方法]我們對來自廣西防城港地區(qū)漢族人群的2,022名男性健康成人進(jìn)行外周靜脈血血清CEA水平的檢測。對該研究人群進(jìn)行身體健康檢查以排除患病人群；相關(guān)問卷調(diào)查以了解個(gè)體生活環(huán)境的差異并將其作為相關(guān)影響因素進(jìn)行分析。研究人群的血清CEA水平值進(jìn)行正態(tài)性轉(zhuǎn)換。單因素分析比較各影響因素對血清CEA水平的影響；利用多元線性回歸模型分析血清CEA水平與這些影響因素之間的關(guān)系；并對各個(gè)因素作出評價(jià)。統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件為SPSS17.0。 [結(jié)果]廣西防城港地區(qū)漢族成年健康男性(17-68歲)的血清CEA水平均數(shù)為2.505±1.682(ng/mL)；CEA水平分布范圍為(0.239～26.69ng/mL)；其分布呈偏態(tài)分布。單因素分析的結(jié)果提示：年齡,吸煙及吸煙量,飲酒,肥胖(BMI28)均為影響該人群血清CEA水平的相關(guān)因素。各年齡組間血清CEA水平差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p0.001)；年齡大于60歲組中CEA水平最高1.45±0.26ng/ml。吸煙組與非吸煙組間的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義p0.001；在吸煙者中按總吸煙量(年包數(shù))進(jìn)行分組后比較血清CEA水平的差異；重度吸煙組的CEA水平最高1.44±0.25ng/ml,其差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義p0.001。 BMI各組的CEA水平差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p=0.034)。乙型病毒性肝炎的感染不是影響血清CEA水平的因素(p=0.175)。通過多元線性回歸模型分析,進(jìn)入模型的自變量包括吸煙(吸煙總量)、肥胖(BMI)、飲酒；其中吸煙量對血清CEA水平的影響在上述影響因素中最大,其相關(guān)系數(shù)(校正后)為0.175,p0.001。肥胖與正常人群的血清CEA水平呈負(fù)相關(guān)(B=-0.05；p=0.006)。上述影響因素的R2(調(diào)整后)為0.07。 [結(jié)論]通過大規(guī)模流行病學(xué)調(diào)查取得防城港地區(qū)男性漢族健康人群的血清CEA水平分布數(shù)據(jù)。其單因素分析的結(jié)果提示：年齡,吸煙及吸煙量,飲酒,肥胖(BMI)均為影響該人群血清CEA水平的相關(guān)因素；多因素分析提示總吸煙量及年齡是影響CEA水平的重要因素。相關(guān)影響因素對正常人群CEA水平差異的影響較小。 第二部分 [目的]對廣西防城港地區(qū)男性漢族健康人群進(jìn)行血清CEA水平與單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn)的定量全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS);了解影響該人群血清CEA水平的遺傳變異因素。 [材料與方法]采集研究人群的外周靜脈血檢測血清CEA水平及提取DNA樣本。利用高通量的基因分型技術(shù)The Illumina Omini1全基因組SNP分型芯片對上述研究人群的DNA樣本(n=2,018)進(jìn)行SNP分型。滿足分型質(zhì)量控制標(biāo)準(zhǔn)的入組人群(n=1,999)進(jìn)行血清CEA水平與SNP分型成功位點(diǎn)(n=709,211)在多元線性回歸模型中進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析；樣本血清CEA值在關(guān)聯(lián)分析中按校正年齡,BMI及吸煙量進(jìn)行校正。全基因組關(guān)聯(lián)分析統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn)顯著性水平經(jīng)Boferroni校正后統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)為1E-7�；蚍中偷馁|(zhì)量控制標(biāo)準(zhǔn)：Hardy-Weinberg Equilibrium(HWE)test p0.001；最小等位基因頻率0.01；基因分型成功率0.95。相關(guān)位點(diǎn)及其所在基因進(jìn)行生物信息學(xué)功能分析及預(yù)測,所用分析軟件為DAVID6.7.通過與ABO血型各等位基因(A1,A2,B,O)相關(guān)SNP(rs507666,rs8176704, rs687289.與rs8176746)對研究人群進(jìn)行ABO血型進(jìn)行等位基因分型并比較各組血清CEA水平。關(guān)聯(lián)分析所用軟件為PLINK v1.06. [結(jié)果]通過GWAS發(fā)現(xiàn)25個(gè)SNP位點(diǎn)達(dá)到全基因組關(guān)聯(lián)分析統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn)顯著性(1E-7)。這些位點(diǎn)主要位于ABO基因(rs8176741；rs8176746； rs8176722； rs8176743； rs8176749； rs507666Ts7873522;176720；rs8176725)；FUT2_基因(rs1047781)；FUT6基因(rs3760775,rs778805,rs778809)；CA11基因(rs11880333)；RPL18基因(rs2292324)；SULT2B1基因(rs3786749)；FAM3B基因(rs441810)；FAM83E基因(rs433852)。基因集功能富集分析結(jié)果提示相關(guān)基因(ABO基因與在FUT1,2基因)位于鞘糖脂合成通路。ABO各等位基因型攜帶者間的血清CEA水平存在差異(BBBO; AAAO; BOAB)。 [結(jié)論]我們發(fā)現(xiàn)影響血清CEA水平的相關(guān)SNP位點(diǎn)及其所在基因。與ABO血型的等位基因相關(guān)位點(diǎn)的多態(tài)性影響血清CEA水平；提示ABO血型的等位基因型與血清CEA水平可能存在相關(guān)性。 第三部分 [目的]分析影響廣西地區(qū)散發(fā)性結(jié)直腸癌患者血清CEA水平的遺傳變異因素；探討該遺傳變異與廣西地區(qū)散發(fā)性結(jié)直腸患者臨床表現(xiàn)的關(guān)系。 [材料與方法]收集194例在廣西醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院住院并手術(shù)的散發(fā)性結(jié)腸癌患者進(jìn)行血清CEA水平檢測及DNA標(biāo)本采集。相關(guān)臨床數(shù)據(jù)通過完整住院記錄及復(fù)診、隨訪資料提供。切除組織病理經(jīng)該院病理科經(jīng)兩名資深病理科醫(yī)生共同診斷。根據(jù)全基因組關(guān)聯(lián)分析的統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性水平及ABO血型相關(guān)基因位點(diǎn)原則挑選候選SNP。 DNA標(biāo)本的相關(guān)SNP等位基因分型采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR法；分型探針采用TaqMan-MGB雙等位基因分型探針。單因素分析影響術(shù)前CEA水平的因素采用非參數(shù)法；比較各因素對淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及術(shù)后腫瘤復(fù)發(fā)的影響采用Logistic回歸分析。Kaplan-Meier法用于比較各影響因素組之間的無瘤生存時(shí)間。統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件為SPSS17.0。 [結(jié)果]194例散發(fā)性結(jié)直腸癌患者術(shù)后病理診斷為腺癌。淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移與遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移是術(shù)前CEA水平差異的影響因素(5.36vs3.41ng/ml, p=0.011;11.87vs3.60ng/ml,p=0.033).淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組術(shù)后無瘤生存時(shí)間的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p=0.021).Logistic回歸分析提示淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移是影響術(shù)后腫瘤復(fù)發(fā)的風(fēng)險(xiǎn)因素(OR:3.517；95%C.I:1.437-8.607；p=0.006).在排除腫瘤轉(zhuǎn)移的影響后,對各候選SNP的等位基因型術(shù)前CEA水平的差異分析結(jié)果提示rs107781(A/T)位點(diǎn)的等位基因型與術(shù)前CEA水平相關(guān)(AA:1.725,AT:3.49,TT:4.1lng/ml；p=0.009)。在不同淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移狀態(tài)下,rs1047781各等位基因型組的術(shù)后無瘤生存時(shí)間差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義：在伴有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移病人中,AAvs AT:p=0.146；AA vs TT:p=0.173；AT vs TT:p:0.956；無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移病人中,AA vs AT:p:0.823；AA vs TT:p=0.389；AT vs TT:p=0.254).分別以rs1047781的3個(gè)等位基因型作為遺傳背景下,分析病人的不同淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移狀態(tài)對術(shù)后無瘤生存時(shí)間的影響；結(jié)果提示AA基因型中兩組差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p=0.981)；AT及TT基因型組中兩組差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p=0.037；p=0.029).rs3760775(G/T)各等位基因組的發(fā)病部位的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(X2=18.584,p=0.017). rs2071699(A/G),各等位基因組(AA,AG,GG)的發(fā)病部位(升結(jié)腸)的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(X2=16.254,p=0.039).rs441810(A/G)各等位基因組的發(fā)病部位差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=144.123,p0.001);其大體病理表現(xiàn)的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(X2=9.304,p=0.050).rs8176746的等位基因型組間(AA,AG,GG)的區(qū)域淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移發(fā)生率的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(AA vs GG:27.4%vs1.1%；X2=7.609,p=0.022). [結(jié)論]rs1047781位點(diǎn)的等位基因多態(tài)性與廣西地區(qū)散發(fā)性結(jié)直腸癌患者術(shù)前CEA水平差異相關(guān)；該結(jié)果與正常人群的GWAS結(jié)果一致。該位點(diǎn)的等位基因多態(tài)性是影響人群CEA水平的遺傳變異因素之一。通過與無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的病人比較,結(jié)果提示rs1047781等位基因T可能與該地區(qū)伴有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的散發(fā)性結(jié)直腸癌術(shù)后早期復(fù)發(fā)有關(guān)。rs441810多態(tài)性與散發(fā)性結(jié)直腸癌大體病理分型相關(guān),等位基因A基因型是潰瘍型腫瘤風(fēng)險(xiǎn)因素；其等位基因A與升結(jié)腸癌發(fā)病相關(guān)。rs8176746多態(tài)性與CRC術(shù)前淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移發(fā)生率相關(guān),等位基因A是淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的風(fēng)險(xiǎn)因素。
【關(guān)鍵詞】：癌胚抗原 多因素分析 遺傳變異 全基因組關(guān)聯(lián)分析
【學(xué)位授予單位】：廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2013
【分類號】：R181.3
【目錄】：

• 中英文縮略詞表4-5
• 中文摘要5-11
• ABSTRACT11-17
• 第一部分 廣西防城港地區(qū)健康成年男性的血清CEA水平及其影響因素的流行病學(xué)調(diào)查17-34
• 前言17-19
• 材料與方法19-20
• 結(jié)果20-26
• 討論26-28
• 第一部分總結(jié)28-29
• References29-34
• 第二部分：廣西防城港地區(qū)漢族成年男性人群血清CEA水平與SNP的全基因組關(guān)聯(lián)分析34-59
• 前言34-36
• 材料與方法36-39
• 結(jié)果39-46
• 討論46-52
• 第二部分總結(jié)52-53
• References53-59
• 第三部分 廣西地區(qū)人群中影響血清CEA水平的相關(guān)遺傳變異及其臨床意義59-99
• 前言59-61
• 材料與方法61-67
• 結(jié)果67-84
• 討論84-90
• 第三部分總結(jié)90-92
• References92-99
• 綜述99-125
• References115-125
• 致謝125-126
• 附錄126-132

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2 李悅;陳元堂;胡江;魏臘梅;高海玲;許昌泰;;D-氨基酸氧化酶基因多態(tài)性與精神分裂癥的關(guān)聯(lián)研究[J];南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2010年09期

3 韓力揚(yáng);李曉彩;侯占平;;大學(xué)生自我護(hù)理意識與健康水平的關(guān)聯(lián)分析[J];河北工程大學(xué)學(xué)報(bào)(社會科學(xué)版);2010年03期

4 陳云志;張軍平;秦鐘;王瑤瑤;;基于Arrowsmith探討冬蟲夏草與維生素D功效的潛在相關(guān)性[J];中華醫(yī)學(xué)圖書情報(bào)雜志;2010年12期

5 劉娟,蔣永光,胡波,雍小嘉;白術(shù)類方的藥證關(guān)聯(lián)分析[J];成都中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào);2004年04期

6 何小林,趙靖平,劉鐵橋 ,劉濤,張向暉;腦源性神經(jīng)營養(yǎng)因子基因C270T多態(tài)性與精神分裂癥的關(guān)聯(lián)研究[J];中國行為醫(yī)學(xué)科學(xué);2005年07期

7 汪棟祥,朱紫青,陳建新,錢伊萍,張野,李飛,江三多;人類MICA基因多態(tài)與氯氮平致白細(xì)胞減少癥的關(guān)聯(lián)分析[J];上海精神醫(yī)學(xué);2005年05期

8 王萍,惠汝太;單核苷酸多態(tài)性研究及其應(yīng)用[J];中國分子心臟病學(xué)雜志;2005年05期

9 王育紅;石玉中;趙國秋;呂路線;李文強(qiáng);郭素芹;王義強(qiáng);婁百玉;成爽;;核心家系5-羥色胺2A受體T102C多態(tài)性與精神分裂癥關(guān)聯(lián)研究[J];中國行為醫(yī)學(xué)科學(xué);2006年02期

10 高雪屏;蘇林雁;杜亞松;李雪榮;張向暉;;注意缺陷多動障礙與兒茶酚-○-甲基轉(zhuǎn)移酶基因的關(guān)聯(lián)分析[J];中國臨床心理學(xué)雜志;2006年01期

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1 邱榮斌;許榕生;;基于關(guān)聯(lián)分析的網(wǎng)絡(luò)管理平臺的設(shè)計(jì)[A];全國網(wǎng)絡(luò)與信息安全技術(shù)研討會'2005論文集（上冊）[C];2005年

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4 程義林;楊森;張學(xué)軍;;常見復(fù)雜疾病表型基因型全基因組關(guān)聯(lián)分析的問題和對策[A];中華醫(yī)學(xué)會第14次全國皮膚性病學(xué)術(shù)年會論文匯編[C];2008年

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1 黃永卓;防城港實(shí)現(xiàn)“三突破”[N];中國化工報(bào);2007年

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3 記者 黃興忠 通訊員 黃偉勛;防城港：努力向億噸大港邁進(jìn)[N];廣西日報(bào);2006年

4 本報(bào)記者 陳保江邋王堅(jiān);見證云企借海發(fā)展[N];云南日報(bào);2008年

5 高增民;打造中國零海岸[N];丹東日報(bào);2008年

6 記者 黃宏遠(yuǎn);防城港鋼鐵基地配套產(chǎn)業(yè)區(qū)路網(wǎng)工程開工[N];廣西日報(bào);2008年

7 本報(bào)記者 李協(xié)商　實(shí)習(xí)記者 陳丹華;鋼鐵物流搶灘防城港[N];現(xiàn)代物流報(bào);2009年

8 記者 梁佳佳;全區(qū)210.42萬人受災(zāi)[N];法治快報(bào);2010年

9 通訊員 蔡燕國;防城港核電廠600噸門吊主梁吊裝到位[N];中國船舶報(bào);2011年

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1 梁毓;影響廣西防城港地區(qū)漢族成年男性癌胚抗原水平的遺傳變異分析及其臨床意義探討[D];廣西醫(yī)科大學(xué);2013年

2 陶然;SIAT8B和PDLIM5基因與中國漢族人精神分裂癥發(fā)生的關(guān)聯(lián)分析[D];中國科學(xué)院研究生院（上海生命科學(xué)研究院）;2007年

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5 羅培芬;多巴胺D2受體基因多態(tài)性與偏執(zhí)型精神分裂癥的關(guān)聯(lián)研究[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué);2008年

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9 李彩霞;精神分裂癥及其神經(jīng)認(rèn)知功能與吸煙的關(guān)系及分子遺傳機(jī)制初探[D];四川大學(xué);2006年

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10 江星本;汽車渠道聯(lián)盟穩(wěn)定性影響因素實(shí)證研究[D];重慶工商大學(xué);2011年

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本文編號：780312