本文關(guān)鍵詞：淮安市異性性傳播途徑感染HIV-1毒株的流行特征及分子進(jìn)化研究

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【摘要】：目的了解淮安市經(jīng)異性性傳播途徑感染HIV-1流行毒株的流行特征、亞型分布及進(jìn)化特點(diǎn)。方法以淮安籍HIV-1感染者為對象,收集相關(guān)流行病學(xué)資料,用巢式(RT-)PCR方法擴(kuò)增env基因片段,測序并進(jìn)行分子進(jìn)化分析。結(jié)果淮安市經(jīng)異性性傳播途徑感染的HIV-1基因亞型有5種,分別是CRF01_AE(53.68%,73/136)、CRF07_BC(18.38%,25/136)、CRF08_BC(0.09%,12/136)、B(14.71%,20/136)和A1(0.04%,6/136)。env基因的核苷酸同源性分析顯示,淮安市流行毒株與廣東、湖南、安徽、江蘇分離株的同源性高。分子進(jìn)化及遺傳距離分析提示淮安市流行的CRF01_AE重組株分為2簇(Clade A和Clade B)。其中,Clade A的組內(nèi)遺傳距離在淮安市流行株HIV-1的各基因亞型中最大。同時發(fā)現(xiàn),淮安市流行的CRF01_AE重組株的進(jìn)化速率為3.82×10-3(95%HPD 3.49~4.18×10-3)替換/位點(diǎn)/年,tMRCA為14.3年。結(jié)論淮安市經(jīng)異性性傳播途徑感染的HIV-1毒株存在多樣性,CRF01_AE重組株是淮安市HIV-1的主要流行株,于1999年8月傳入。
【作者單位】： 淮安市疾病預(yù)防控制中心;江蘇省疾病預(yù)防控制中心;
【關(guān)鍵詞】： HIV- 基因亞型 進(jìn)化樹 分子進(jìn)化
【基金】：淮安市預(yù)防醫(yī)學(xué)科研基金項目(No.hayf201504;hayf201505)
【分類號】：R512.91;R181.3
【正文快照】： ***人類免疫缺陷病毒(human immunodeficiency vi-rus,HIV)屬于逆轉(zhuǎn)錄病毒科(Retroviridae)慢病毒屬(Lentivirus),為單股正鏈RNA包膜病毒[1-2]。HIV基因組全長為9.8kb左右,包括env、gag、pol 3個結(jié)構(gòu)基因,6個非結(jié)構(gòu)基因(調(diào)節(jié)基因)以及5′、3′端的長末段重復(fù)序列(long termina

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號：613421