發(fā)布時(shí)間：2017-07-15 19:20

  本文關(guān)鍵詞：2014年深圳市流行的1型登革病毒分子溯源分析

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【摘要】：目的對(duì)2014年深圳市登革熱(DF)流行時(shí)分離的登革熱1型病毒株(DENV-1)進(jìn)行E基因序列測(cè)定,了解其分子病毒學(xué)特征,探討其可能來(lái)源。方法收集35份2014年深圳市DF患者急性期血清標(biāo)本,用乳倉(cāng)鼠腎細(xì)胞(BHK-21)分離DF病毒,并用逆轉(zhuǎn)錄-半套式聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)反應(yīng)對(duì)其進(jìn)行型別鑒定。RT-PCR擴(kuò)增全長(zhǎng)E基因,測(cè)序并進(jìn)行同源性與進(jìn)化樹分析。結(jié)果 35份血清樣本中分離到DENV-1 21株。選取6株深圳DENV-1分離株測(cè)序,E基因全長(zhǎng)1 485 bp,編碼495個(gè)氨基酸。6株深圳市DENV-1分離株同源性為100.0%,其同源性與深圳市2010流行株接近,核苷酸和氨基酸同源性分別為99.5%和99.8%,與新加坡2009和日本2004流行株的核苷酸和氨基酸同源性最高達(dá)99.7%和100.0%。進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn),深圳6株DENV-1屬于基因型1型,與Shenzhen2010、Singpore2009、Japan2004的親緣關(guān)系較近,在同一進(jìn)化支上。結(jié)論2014年深圳市DENV-1屬GⅠ亞型,最可能來(lái)源于東南亞一帶,于2010年本地化而引起2014年DF流行。
【作者單位】： 南方醫(yī)科大學(xué)附屬深圳寶安醫(yī)院;
【關(guān)鍵詞】： 登革熱 登革熱病毒 E基因 序列測(cè)定 系統(tǒng)進(jìn)化樹
【基金】：深圳市寶安區(qū)科技計(jì)劃項(xiàng)目(No:2015253)
【分類號(hào)】：R512.8;R181.3
【正文快照】： 登革熱(dengue fever,DF)是由登革病毒(denguevirus,DENV)引起的一種嚴(yán)重的急性蟲媒傳染病。近十年來(lái),登革熱在全世界的發(fā)病率提高近30倍,波及全球100多個(gè)國(guó)家和地區(qū),成為世界性的公共衛(wèi)生問(wèn)題[1]。在我國(guó),登革熱主要流行于廣東、海南、廣西、福建、臺(tái)灣等南方及東南沿海省份

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本文編號(hào)：545380