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HSV-2新發(fā)感染率與分子流行病學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2017-07-08 10:23

  本文關(guān)鍵詞:HSV-2新發(fā)感染率與分子流行病學(xué)研究


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【摘要】:一,云南省德宏州HIV單陽(yáng)夫妻HSV-2新發(fā)感染率及其影響因素研究 研究目的:了解云南省德宏州HIV感染狀況不一致夫妻(簡(jiǎn)稱"HIV單陽(yáng)夫妻”)中單純皰疹病毒2型(HSV-2)的新發(fā)感染率及其影響因素,為預(yù)防控制HSV-2傳播和流行提供依據(jù)。 研究方法:云南省德宏州所轄5個(gè)縣市中2009年6月啟動(dòng)調(diào)查時(shí)隨訪的存活HIV感染者人數(shù)在20及以上的全部34個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)全部納入研究,在這些鄉(xiāng)鎮(zhèn)內(nèi)招募一方感染HIV、另一方未感染HIV的夫妻(簡(jiǎn)稱"HIV單陽(yáng)夫妻”)參加調(diào)查,采集血樣檢測(cè)HSV-2抗體,獲得基線HSV-2感染率。一年后對(duì)基線調(diào)查HSV-2 IgG抗體陰性的對(duì)象進(jìn)行隨訪調(diào)查并再次抽取血樣進(jìn)行HSV-2 IgG抗體檢測(cè),獲得HSV-2新發(fā)感染率,結(jié)合HIV單陽(yáng)夫妻人口學(xué)、行為學(xué)及感染特征,采用Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型分析終期HSV-2新發(fā)感染的危險(xiǎn)因素。 研究結(jié)果:(1)基線招募HIV感染者1048人、HIV陰性配偶1022人;基線HIV感染者HSV-2感染率為36.4%,其中男性感染率為29.4%,女性感染率為61.1%;陰性配偶基線HSV-2感染率為28.9%,其中男性感染率為25.7%,女性感染率為29.7%。(2)至2010年6月底,共進(jìn)入隊(duì)列研究HSV-2陰性的HIV感染者有667人,陰性配偶有727人,終末調(diào)查時(shí)HIV感染者中失訪248人,隨訪者和失訪者在性別、年齡、文化程度、職業(yè)分布上的差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,失訪者中傣族及來(lái)自于盈江縣者所占的比例均顯著高于隨訪者。終末調(diào)查陰性配偶中失訪194人,隨訪者和失訪者在性別、年齡、文化程度、職業(yè)分布上的差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,失訪者中漢族及來(lái)自于盈江縣者所占的比例均顯著高于隨訪者。(3)終末調(diào)查時(shí)HIV感染者HSV-2發(fā)病密度為2.98/100人年;其中男、女性發(fā)病密度分別為2.83/100人年和3.96/100人年;陰性配偶HSV-2發(fā)病密度為4.17/100人年;其中男性為8.22/100人年,女性為3.18/100人年。多因素分析顯示,配偶中漢族HSV-2發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)高于傣族等其他民族,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(HR=3.13,95%CI:1.15-8.54);HIV單陽(yáng)夫妻各自HSV-2新發(fā)感染情況均與對(duì)方基線HSV-2感染相關(guān),基線陰配HSV-2陽(yáng)性者其陽(yáng)性配偶HSV-2新發(fā)感染風(fēng)險(xiǎn)高于基線陰偶HSV-2陰性者的HIV陽(yáng)性配偶(HR=13.15,95%CI:3.11-55.52),基線合并感染HSV-2的HIV感染者其配偶終期HSV-2新發(fā)感染風(fēng)險(xiǎn)為基線未合并感染HSV-2的HIV感染者的配偶的5.87倍(HR=5.87,95%CI:2.07-16.66)。 研究結(jié)論:HIV單陽(yáng)夫妻的基線HSV-2感染率及終期HSV-2新發(fā)感染率均較高;基線時(shí)HIV感染者中女性HSV-2感染率高于男性,而終末調(diào)查時(shí)配偶中男性HSV-2新發(fā)感染率高于女性,HIV單陽(yáng)夫妻各自HSV-2新發(fā)感染情況與對(duì)方基線HSV-2感染相關(guān),存在HSV-2在夫妻間相互傳播的現(xiàn)象,特別是HIV感染者本身HSV-2感染率較高,推測(cè)傳播途徑多為從HIV感染者到配偶,使配偶處于HIV及HSV-2感染的雙重風(fēng)險(xiǎn)中。提示盡早、盡快在HSV-2單陽(yáng)夫妻中開展相關(guān)干預(yù)及治療措施勢(shì)在必行,同時(shí)此舉對(duì)控制HIV從高危人群向一般人群傳播也具有深遠(yuǎn)的意義。 二,上海及浙江臺(tái)州地區(qū)HSV-2基因亞型研究 研究目的:探討HSV-2分子分型方法,了解我國(guó)HSV-2基因亞型分布情況,為進(jìn)一步相關(guān)分子流行病學(xué)研究奠定基礎(chǔ)。 研究方法:以上海和浙江臺(tái)州性病門診作為標(biāo)本采集地,從臨床確診生殖器皰疹病人水皰部位采集皰疹液標(biāo)本,分離病毒并在Vero細(xì)胞中培養(yǎng),待80%細(xì)胞出現(xiàn)細(xì)胞病變即收獲細(xì)胞,取上清液提取病毒DNA作進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)。根據(jù)GenBank中HSV-2國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)株HG52全基因序列以及以往文獻(xiàn)設(shè)計(jì)引物擴(kuò)增HSV-2 US4和US6全基因片段,將PCR鑒定正確的擴(kuò)增產(chǎn)物送測(cè)序公司回收和測(cè)序。測(cè)定的序列采用ClustalX2.0軟件進(jìn)行多重比對(duì),SplitsTree4.0軟件繪制重組網(wǎng)絡(luò),Simplot3.5.1軟件中的"Bootscan方法”驗(yàn)證重組事件。剔除具有重組信號(hào)的病毒分離株后,與GenBank中下載的48株HSV-2病毒US4基因序列和6株病毒US6基因序列一起進(jìn)行比對(duì)分析,采用最大似然法繪制分子進(jìn)化樹鑒定HSV-2的分子分型情況,100次循環(huán)bootstrap檢驗(yàn)估算進(jìn)化樹的可靠性。 研究結(jié)果:(1)Vero細(xì)胞產(chǎn)生明顯的細(xì)胞病變效應(yīng),病毒成功地在Vero細(xì)胞中擴(kuò)增。30份采集自上海的皰疹液標(biāo)本有20份出現(xiàn)CPE,病毒分離率為66.7%;13份采自浙江臺(tái)州的皰疹液樣本中有12份出現(xiàn)CPE,病毒分離率為92.3%。(2)提取病毒DNA,擴(kuò)增US4和US6全基因片段,經(jīng)電泳鑒定在2180bp及1200bp左右有擴(kuò)增帶,大小與目標(biāo)片段相符,32份CPE陽(yáng)性標(biāo)本均成功擴(kuò)增。(3)所測(cè)得的序列經(jīng)多重比對(duì)后顯示,US4基因間及US6基因間同源性都較高,其中US4基因比對(duì)序列上探測(cè)到34個(gè)突變位點(diǎn),其中15個(gè)(45.7%)為同義突變,19個(gè)(54.3%)為非同義突變;US6基因比對(duì)序列發(fā)現(xiàn)有10個(gè)突變位點(diǎn),其中6個(gè)(60%)為同義突變,4個(gè)(40%)為非同義突變。(4)以HSV-2國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)株HG52的對(duì)應(yīng)序列作為外部參照,對(duì)US4基因和US6基因各自構(gòu)建重組網(wǎng)絡(luò),US6基因網(wǎng)絡(luò)圖基本為樹枝狀分叉,而US4基因呈現(xiàn)復(fù)雜且相互交織的網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu),采用Bootscan方法驗(yàn)證為重組信號(hào)。將具有重組信號(hào)的的樣本去除后再次構(gòu)建重組網(wǎng)絡(luò),US4基因的網(wǎng)絡(luò)圖呈現(xiàn)樹枝狀分叉。去除US4及US6基因的重組網(wǎng)絡(luò)圖均顯示HSV-2的序列可分為兩大主要分支。(5)將以往研究報(bào)道的48株HSV-2病毒分離株US4基因序列以及GenBank下載的另外6株病毒US6基因序列加入本研究進(jìn)行序列比對(duì).,去除具有重組信號(hào)的樣本后采用PhyML軟件對(duì)比對(duì)好的序列繪制系統(tǒng)進(jìn)化樹,US4基因的分子進(jìn)化結(jié)果顯示,8株坦桑尼亞的病毒序列聚集于一簇,為A亞型;8株坦桑尼亞、挪威和瑞典的病毒序列,10株本研究采集的病毒序列以及HSV-2國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)株HG52為B亞型;而另外12株本研究采集的病毒分離株US4基因序列從A亞型及B亞型中分化出來(lái),聚集于一簇,本研究暫定為B’亞型。US6基因分子進(jìn)化結(jié)果顯示,16株上海的病毒分離株基因序列、7株浙江的病毒分離株基因序列、2株瑞典的病毒序列、3株美國(guó)的病毒序列以及HSV-2國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)株HG52在分子進(jìn)化樹上處于一簇,為B亞型;而其他8株本研究的病毒序列(4株上海,4株臺(tái)州)以及1株伊朗的病毒序列處于同一分支,為B’亞型。Bootstrap檢驗(yàn)各主要分支統(tǒng)計(jì)值達(dá)75以上,證實(shí)進(jìn)化樹的可靠性。 研究結(jié)論:本研究首次提出存在HSV-2的B’亞型,可能是A、B亞型之間進(jìn)化的過(guò)渡型別。目前我國(guó)的流行株主要為HSV-2的B亞型及B’亞型。結(jié)合以往研究,A亞型主要分布于非洲及部分歐洲地區(qū),B亞型廣泛分布于非洲、歐洲、美國(guó)以及中國(guó),而B’亞型可能主要存在于亞洲地區(qū)(中國(guó)及伊朗)的病毒分離株中。病毒基因亞型的分布可能與古代人類的遷徙有關(guān),同時(shí)皰疹病毒的基因內(nèi)及基因間重組也對(duì)HSV-2的進(jìn)化起著重要的推動(dòng)作用。
【關(guān)鍵詞】:人類單純皰疹病毒2型 艾滋病病毒感染狀況不一致夫妻 新發(fā)感染率 危險(xiǎn)因素 基因亞型
【學(xué)位授予單位】:復(fù)旦大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2011
【分類號(hào)】:R181.3
【目錄】:
  • 中文摘要5-8
  • Abstract8-12
  • 前言12-15
  • 第一部分 云南省德宏州HIV單陽(yáng)夫妻HSV-2新發(fā)感染率及其影響因素研究15-31
  • 對(duì)象與方法15-18
  • 結(jié)果18-29
  • 討論29-30
  • 小結(jié)30-31
  • 第二部分 上海及浙江臺(tái)州地區(qū)HSV-2基因亞型研究31-47
  • 材料與方法31-37
  • 結(jié)果37-45
  • 討論45-46
  • 小結(jié)46-47
  • 總結(jié)47-49
  • 參考文獻(xiàn)49-55
  • 綜述55-67
  • 參考文獻(xiàn)63-67
  • 附錄:碩士期間發(fā)表論文67-68
  • 致謝68-69

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前6條

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5 汪海波;汪寧;丁國(guó)偉;馬建國(guó);王桂香;陸林;馬艷玲;徐俊杰;常東方;張國(guó)磊;張斕;董瑞玲;烏正賚;鄭錫文;;云南省某市女性性工作者HIV感染及其危險(xiǎn)因素調(diào)查[J];中國(guó)艾滋病性病;2007年03期

6 湯少開;葉興東;黃雪梅;曹文苓;鄧蕙妍;黎小東;譚學(xué)英;丘小珊;;廣州地區(qū)女性不同人群HSV-2感染調(diào)查及危險(xiǎn)因素分析[J];現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué);2008年07期

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本文編號(hào):534171

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