肺炎克雷伯菌醫(yī)院血流感染暴發(fā)的分子流行病學(xué)研究
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【摘要】:目的 醫(yī)院感染暴發(fā)即在醫(yī)療機(jī)構(gòu)或其科室中,短時(shí)間內(nèi)發(fā)生3例以上同種同源醫(yī)院感染事件的現(xiàn)象。醫(yī)院感染暴發(fā),病死率高,易引起公眾的普遍關(guān)注。為了有效地控制感染的流行,必須迅速查明感染源,目前公認(rèn)的查找感染源的方法是分離病原菌并對(duì)其同源性進(jìn)行分析。本研究選取一起近期醫(yī)院血流感染暴發(fā)事件分離的肺炎克雷伯菌株,應(yīng)用抗生素藥敏試驗(yàn),脈沖場(chǎng)凝膠電泳和多位點(diǎn)序列分析的方法對(duì)病原體進(jìn)行同源性分型,為及時(shí)有效的控制感染的流行提供依據(jù)。 方法 1、菌株來(lái)源和藥敏試驗(yàn):試驗(yàn)菌株分離自天津市某醫(yī)院外科病房2010年7月16日至7月28日5名醫(yī)院血流感染患者的8株肺炎克雷伯菌臨床株(Kpl-Kp8);對(duì)照菌株分離自同期天津市另一家醫(yī)院感染科病房的6株肺炎克雷伯菌臨床株(Kp9-Kp13)。采用瓊脂紙片擴(kuò)散法(K-B法)和微量肉湯稀釋法(MICs)檢測(cè)肺炎克雷伯菌臨床株對(duì)11種常用抗菌藥物(氨芐西林、頭孢唑林、慶大霉素、頭孢哌酮、環(huán)丙沙星、頭孢曲松、阿莫西林/克拉維酸、美羅培能、哌拉西林、復(fù)方磺胺甲惡唑、氨曲南)的耐藥性。 2、脈沖場(chǎng)凝膠電泳(PFGE):提取肺炎克雷伯菌全基因組DNA,經(jīng)限制性?xún)?nèi)切酶Xbal酶解后進(jìn)行肺炎克雷伯菌全基因組DNA的脈沖場(chǎng)凝膠電泳(PFGE)分析。 3、多位點(diǎn)序列分析(MLST):從試驗(yàn)株中選取菌株Kp1及另2株Kp4,Kp5;從對(duì)照株中選取2株Kp9和K13,共5株肺炎克雷伯菌臨床株,分別擴(kuò)增其7個(gè)管家基因(rpoB,gapA,mdh,pgi,phoEinfB,tonB)的核心片段(318bp-501bp),并進(jìn)行序列分析,將測(cè)序結(jié)果提交國(guó)際數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)站http://www.mlst.net,獲得菌株的ST型。 結(jié)果 1、藥敏試驗(yàn):8株試驗(yàn)菌株對(duì)11種抗菌藥物的藥敏結(jié)果顯示:菌株Kp1對(duì)氨芐西林、頭孢唑林、慶大霉素、阿莫西林/克拉維酸耐藥,對(duì)美羅培能、哌拉西林、復(fù)方磺胺甲惡唑、氨曲南、頭孢哌酮、環(huán)丙沙星、頭孢曲松敏感;菌株Kp2等其他7株肺炎克雷伯菌臨床株的抗生素藥敏譜完全相同,且均為多重耐藥菌,即對(duì)氨芐西林、頭孢唑林、慶大霉素、頭孢哌酮、環(huán)丙沙星、頭孢曲松耐藥,對(duì)阿莫西林/克拉維酸、美羅培能、哌拉西林、復(fù)方磺胺甲惡唑、氨曲南敏感。6株對(duì)照菌株中:菌株Kp14對(duì)11種抗菌藥物均敏感;菌株Kp9和Kp12對(duì)哌拉西林、氨芐西林、頭孢嘩林、慶大霉素、頭孢哌酮、環(huán)丙沙星、頭孢曲松、阿莫西林/克拉維酸耐藥,對(duì)美羅培能、復(fù)方磺胺甲惡嘩、氨曲南敏感;其它3株菌的藥敏譜不盡相同。 2、PFGE結(jié)果:8株試驗(yàn)菌株中,共分出2型,菌株Kp2-Kp8共7株肺炎克雷伯菌臨床株的PFGE譜型一致,即均具有11條電泳條帶,且相應(yīng)條帶大小相同,為PFGE Ⅱ型;菌株Kp1具有12條電泳條帶,與Kp2等其它7株有7條條帶以上的差異,為PFGE I型。6株對(duì)照菌株共分出6型,其電泳條帶數(shù)9-12條不等,均具有7條以上條帶的差異。 3、MLST的結(jié)果:3株試驗(yàn)菌株中,菌株Kp4,Kp5具有一致的MLST型,即ST133(12,1,1,2,5,1,36),與菌株Kp1(10,1,1,1,9,4,12)有5個(gè)基因座不同,為不相關(guān)菌株。2株對(duì)照菌株中,菌株Kp13的ST型為ST86(9,4,2,1,1,1,27)與菌株Kp9(1,1,1,1,1,1,36)具有6個(gè)基因座的不同,為不相關(guān)菌株。這一研究結(jié)果與PFGE的研究結(jié)果一致。菌株Kpl與菌株Kp9均在MLST數(shù)據(jù)庫(kù)中未查詢(xún)到相應(yīng)的ST型。菌株Kp1的ST型與ST23, ST548, ST793, ST808最為接近,菌株Kp9的ST型與ST15, ST132, ST326, ST655, ST709, ST748最為接近。 結(jié)論 1、經(jīng)抗生素藥敏試驗(yàn)、脈沖場(chǎng)凝膠電泳和多位點(diǎn)序列分析的分型研究,可以判定天津市某醫(yī)院外科病房2010年7月16日至7月28日手術(shù)后發(fā)生的5例血流感染患者為肺炎克雷伯菌醫(yī)院血流感染暴發(fā)。分離自患者A的痰和血液中的肺炎克雷伯菌(Kp2,Kp3,Kp6)與分離自患者B(Kp4),C(Kp5),D(Kp7),E(Kp8)4名患者血液中的肺炎克雷伯菌為同一克隆株,根據(jù)5名患者感染的先后順序,可能患者A為此次醫(yī)院感染暴發(fā)的感染源,通過(guò)交互感染傳給B,C,D,E四名患者。分離自患者A腹腔引流液的菌株Kp1與分離自其痰(Kp2)和血液中(Kp3,Kp6)的肺炎克雷伯菌不具有同源性。菌株Kp6可能是患者A的感染未治愈或?yàn)橹斡蟮亩胃腥尽?2、抗生素藥敏譜分型對(duì)初步判斷醫(yī)院血流感染暴發(fā)有一定價(jià)值,尤其適合于基層醫(yī)院,但精確性欠缺。 3、脈沖場(chǎng)凝膠電泳分型與多位點(diǎn)序列分析等分子生物學(xué)分型方法,均顯示了一致的分型結(jié)果,對(duì)醫(yī)院感染暴發(fā)的調(diào)查及追蹤溯源有重大價(jià)值。 PFGE分型結(jié)果可靠,能較好反映流行病學(xué)相關(guān)性。MLST分型結(jié)果易于標(biāo)準(zhǔn)化,可進(jìn)行不同實(shí)驗(yàn)室間的比較,且實(shí)驗(yàn)過(guò)程較簡(jiǎn)便,更具推廣價(jià)值。
【關(guān)鍵詞】:醫(yī)院感染暴發(fā) 血流感染 肺炎克雷伯菌 脈沖場(chǎng)凝膠電泳(PFGE) 多位點(diǎn)序列分析(MLST) 基因分型 表型分型
【學(xué)位授予單位】:天津醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2012
【分類(lèi)號(hào)】:R181.3
【目錄】:
- 中文摘要4-7
- Abstract7-13
- 英文縮略詞表13-15
- 前言15-19
- 研究現(xiàn)狀、成果15-17
- 研究目的、方法17-19
- 一、肺炎克雷伯菌感染菌株的抗生素藥敏譜分析19-27
- 1.1 對(duì)象和方法19-23
- 1.1.1 對(duì)象19-20
- 1.1.2 方法20-23
- 1.2 結(jié)果23-25
- 1.2.1 藥物敏感試驗(yàn)23-24
- 1.2.2 藥物敏感性分析24-25
- 1.3 討論25-27
- 二、肺炎克雷伯菌感染菌株的脈沖場(chǎng)凝膠電泳(PFGE)分型研究27-33
- 2.1 對(duì)象和方法27-30
- 1.1.1 對(duì)象27-28
- 1.1.2 方法28-30
- 2.2 結(jié)果30-31
- 2.3 討論31-33
- 三、肺炎克雷伯菌感染菌株的多位點(diǎn)序列分析33-45
- 3.1 對(duì)象和方法33-36
- 3.1.1 對(duì)象33-34
- 3.1.2 方法34-36
- 3.2 結(jié)果36-43
- 3.2.1 MLST結(jié)果圖36-38
- 3.2.2 MLST結(jié)果分析38-43
- 3.3 討論43-45
- 小結(jié)45-46
- 結(jié)論46-47
- 參考文獻(xiàn)47-52
- 發(fā)表論文和參加科研情況說(shuō)明52-53
- 綜述53-62
- 參考文獻(xiàn)59-62
- 致謝62
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