2017-2019年廣州市禽類(lèi)市場(chǎng)H9N2禽流感病毒全基因組遺傳進(jìn)化特征分析
發(fā)布時(shí)間:2021-05-21 16:26
目的對(duì)H9N2禽流感病毒分離株進(jìn)行全基因進(jìn)化特征分析,為禽流感的防控提供研究數(shù)據(jù)。方法對(duì)24株2017—2019年廣州市禽類(lèi)市場(chǎng)H9N2禽流感毒株進(jìn)行測(cè)序,通過(guò)生物信息學(xué)軟件,分析全基因組遺傳進(jìn)化特點(diǎn)。結(jié)果 24株H9N2病毒核苷酸同源性為86.20%~100.00%,核苷酸進(jìn)化距離為0.00~1.54,其中HA基因的核苷酸和氨基酸進(jìn)化距離變化最大,其次為PB2基因。遺傳進(jìn)化分析顯示,所有毒株各基因在系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)上聚為一簇,屬于G57基因型。分子特征分析顯示,所有毒株屬于低致病性禽流感病毒,在HA蛋白受體結(jié)合位點(diǎn)均發(fā)生Q226L突變,提示H9N2更容易識(shí)別人源受體。在HA-N166D、PB2-L89V/292V、PB1-I368V、L473V、PA-K356R、S409N、M1-N30D、T215A、NS1-P42S等致病性相關(guān)位點(diǎn)上,大部分毒株發(fā)生致病性增強(qiáng)突變。耐藥性上,所有毒株對(duì)神經(jīng)氨酸酶抑制劑敏感,對(duì)烷胺類(lèi)藥物耐藥。結(jié)論 2017—2019年期間廣州市禽類(lèi)市場(chǎng)H9N2禽流感病毒為G57基因型,該基因型病毒普遍發(fā)生與人受體結(jié)合能力增強(qiáng)的穩(wěn)定變異,且大部分毒株發(fā)生致病性增強(qiáng)的突變,需...
【文章來(lái)源】:疾病監(jiān)測(cè). 2020,35(03)
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]The D253N Mutation in the Polymerase Basic 2 Gene in Avian Influenza(H9N2) Virus Contributes to the Pathogenesis of the Virus in Mammalian Hosts[J]. Jinfeng Zhang,Rong Su,Xiaoyun Jian,Hongliang An,Ronbing Jiang,Chris Ka Pun Mok. Virologica Sinica. 2018(06)
[2]廣州市活禽市場(chǎng)7株H9N2亞型禽流感病毒全基因進(jìn)化分析[J]. 蔡孟楷,張偉東,秦鋒,卜德新,黃俊明,冀池海,方博,付新亮,曹振鵬,張桂紅. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(02)
本文編號(hào):3200021
【文章來(lái)源】:疾病監(jiān)測(cè). 2020,35(03)
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]The D253N Mutation in the Polymerase Basic 2 Gene in Avian Influenza(H9N2) Virus Contributes to the Pathogenesis of the Virus in Mammalian Hosts[J]. Jinfeng Zhang,Rong Su,Xiaoyun Jian,Hongliang An,Ronbing Jiang,Chris Ka Pun Mok. Virologica Sinica. 2018(06)
[2]廣州市活禽市場(chǎng)7株H9N2亞型禽流感病毒全基因進(jìn)化分析[J]. 蔡孟楷,張偉東,秦鋒,卜德新,黃俊明,冀池海,方博,付新亮,曹振鵬,張桂紅. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(02)
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