【摘要】：目的明確邯鄲市2010-2012年EV71流行株的基因型及其VP1區(qū)基因特征,為手足口病防治提供分子生物學(xué)依據(jù)。方法用RD細胞分離培養(yǎng)EV71病毒,RT-PCR方法擴增VP1區(qū)基因片段,進行核苷酸和氨基酸序列同源性分析,構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。結(jié)果邯鄲市EV71分離株VP1區(qū)核苷酸同源性為96.4%~100.0%,與A、B基因型代表株VP1區(qū)核苷酸同源性在81.8%~82.7%與83.6%~84.5%之間。與已知基因型C1、C2、C3、C4代表株的核苷酸同源性分別在89.9%~90.3%、89.3%~90.1%、87.9%~88.7%和96.0%~96.9%之間,與1998年臺灣分離株同源性為92.4%~93.2%,與2008年阜陽、2009年河南、2010年河北和2011年陜西分離的EV71代表株同源性在96.6%~99.1%之間�；赩P1區(qū)構(gòu)建的EV71系統(tǒng)進化樹顯示,這14株EV71均為C4a亞型。結(jié)論邯鄲市2010-2012年EV71流行株為C4a亞型,與中國大陸近年流行株分離結(jié)果一致。
[Abstract]:Objective to identify the genotypes and VP1 gene characteristics of EV71 epidemic strains from 2010 to 2012 in Handan City, and to provide molecular biological basis for the prevention and control of HFMD. Methods RD cells were used to isolate and culture EV71 virus. The VP1 region gene fragment was amplified by RT-PCR. The homology of nucleotide and amino acid sequence was analyzed and the phylogenetic tree was constructed. Results the nucleotide homology of the VP1 region of the EV71 isolates in Handan City was 96. 4%. The nucleotide homology of the VP1 region was 81.8% and 84.5% respectively with the VP1 region, which was the representative of AZB genotype. The nucleotide homology with the known genotype C _ 1C _ 2C _ 3C _ 3C _ 4 was 89.9, respectively. The nucleotide homology was 87.9% and 96.0%, respectively. The homology with the Taiwan isolate in 1998 was 92.493. 2%, and the homology with the representative strains of EV71 isolated from Fuyang, Henan, Hebei and Shaanxi in 2010 and 2011 was 96.6% and 99.1% respectively, and the homology was 92.40.92% with that of the Taiwan isolate in 1998, and the homology was 99.1% with the representative strains isolated from Fuyang in 2008, Henan Province in 2009, Hebei Province in 2010 and Shaanxi in 2011. The phylogenetic tree of EV71 based on VP1 region showed that the 14 EV71 strains were all C4a subtypes. Conclusion the epidemic strain of EV71 in Handan City from 2010 to 2012 is C4a subtype, which is consistent with the results of isolation of epidemic strains in mainland China in recent years.
【作者單位】： 邯鄲市疾病預(yù)防控制中心;
【分類號】：R373.2;R181.3

【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前7條

1 楊國威,何雅清,薛穎,周世力,馬驪,金奇;腸道病毒71型外殼蛋白VP1在Pichia pastoris酵母中的表達[J];病毒學(xué)報;2003年02期

2 崔愛利,許文波,李秀珠,胡家瑜,凌華,唐偉,楊智宏,張燕,陳立,Hiroyuki Shimizu;腸道病毒71型的RT-PCR診斷及基因特征[J];病毒學(xué)報;2004年02期

3 何雅青;楊洪;李琳琳;譚潔;毛麗莎;陽帆;劉建軍;呂星;周麗;;深圳地區(qū)2001~2004年腸道病毒71型部分VP1區(qū)基因分析[J];病毒學(xué)報;2006年05期

4 晏開力;趙月萍;陳曉琴;周淑潔;陳霞;劉丹青;沈永剛;任軍;;安徽省腸道病毒71型VP1區(qū)基因分析[J];中華疾病控制雜志;2009年05期

5 馬超鋒;鄭海潮;鄧惠玲;杜全麗;李一為;楊揚;龔建人;李江博;陳志軍;;2009年西安地區(qū)手足口病病原血清型分析及腸道病毒71型基因特征[J];西安交通大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版);2010年05期

6 鄭書發(fā);崔大偉;余斐;楊先知;陳瑜;;浙江省杭州地區(qū)手足口病病原譜分析和腸道病毒71型VP1基因分析[J];現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué);2011年02期

7 衛(wèi)海燕;黃學(xué)勇;許玉玲;馬宏;陳豪敏;許汴利;;河南省2010年腸道病毒71型VP1基因特征分析[J];現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué);2012年14期

【共引文獻】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 李國蘭;郭玲;李治悅;卜戈;于昌軍;張威;楊帆;李建國;王偉;;RT-PCR法在快速檢測腸道病毒71型(EV71)核酸中應(yīng)用[J];安徽醫(yī)學(xué);2008年04期

2 楊敏;都鵬飛;;小兒手足口病病原體研究進展[J];安徽醫(yī)學(xué);2011年03期

3 何雅青;楊洪;李琳琳;譚潔;毛麗莎;陽帆;劉建軍;呂星;周麗;;深圳地區(qū)2001~2004年腸道病毒71型部分VP1區(qū)基因分析[J];病毒學(xué)報;2006年05期

4 朱俊萍;徐子剛;陳輝;張霞;范東瀛;王娟;;2007年北京地區(qū)兒童手足口病病原的初步篩查[J];病毒學(xué)報;2009年01期

5 陶澤新;李巖;王海巖;宋立志;劉桂芳;劉堯;林小娟;馮蕾;楊赫;樊慶瑩;徐愛強;;腸道病毒A組山東地方株的基因型分布[J];病毒學(xué)報;2009年06期

6 何雅青;齊銳;楊洪;冼慧霞;姚相杰;陽帆;張海龍;楊小柯;許文波;;2005～2008年深圳地區(qū)腸道病毒71型基因特征研究[J];病毒學(xué)報;2009年06期

7 滕崢;檀曉娟;邵俊杰;張勇;匡小舟;張曦;許文波;;2009年上海市手足口病流行病學(xué)和病原學(xué)特征[J];病毒學(xué)報;2010年06期

8 劉國軍;吳燕;田炳均;寸建萍;尹潔;姜黎黎;馬躍;陸林;徐聞;;云南省2009～2010年腸道病毒71型的基因特征分析[J];病毒學(xué)報;2012年04期

9 林馨;韓關(guān)根;;腸道病毒71型分子生物學(xué)研究[J];浙江中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報;2008年03期

10 楊曉紅;吳茜;溫柏平;代宏劍;莊宇;楊俊逸;;2010年昆明地區(qū)兒童手足口病的流行特征[J];中國當代兒科雜志;2012年03期

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 茅凌翔;腸道病毒71型分子流行病學(xué)調(diào)查及miRNA抑制腸道病毒71型體外復(fù)制的研究[D];江蘇大學(xué);2011年

2 徐娟;腸道病毒EV71 VP1基因的優(yōu)化和免疫原性的研究[D];南京醫(yī)科大學(xué);2011年

3 王宏亮;EV71 VP1抑制劑的設(shè)計、合成與活性評價[D];沈陽藥科大學(xué);2011年

4 徐愛強;新型人類腸道病毒山東分離株的分子流行病學(xué)及其基因組特征研究[D];山東大學(xué);2012年

5 羅文英;腸道病毒71型感染人腦微血管內(nèi)皮細胞的機制研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2012年

6 劉丹;致死性EV71感染的病理學(xué)及分子病毒學(xué)研究[D];華中科技大學(xué);2012年

7 陳盼;人腸道病毒71型和日本腦炎病毒進入細胞機制的研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2013年

8 王驥濤;2009年河南省洛陽市、開封市手足口病病原譜研究[D];山西大學(xué);2013年

9 鄧軍霞;靶向5’UTR的化學(xué)修飾siRNAs抑制腸道病毒71型感染的研究[D];第四軍醫(yī)大學(xué);2013年

10 呂鐵鋼;腸道病毒71型感染致小鼠腦線粒體損傷及可能機制研究[D];青島大學(xué);2013年

【二級參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前8條

1 崔愛利,許文波,李秀珠,胡家瑜,凌華,唐偉,楊智宏,張燕,陳立,Hiroyuki Shimizu;腸道病毒71型的RT-PCR診斷及基因特征[J];病毒學(xué)報;2004年02期

2 楊帆,金奇,何雅青,李良成,侯云德;腸道病毒71型中國分離株全基因組核苷酸序列分析[J];中國科學(xué)(C輯:生命科學(xué));2001年02期

3 趙惠欣;張艷玲;張奕;鄧潔;朱汝南;錢淵;;2007年北京兒童中流行的手足口病病原學(xué)及臨床特點[J];臨床兒科雜志;2008年06期

4 陳立,李秀珠,張禮璧,朱暉,胡家瑜,丁曉光,祝雙利,清水博之;一起引發(fā)手足口病流行的腸道病毒71型的分子特征[J];中國計劃免疫;2003年05期

5 楊智宏,朱啟昒,李秀珠,王曉紅,王建設(shè),胡家瑜,唐偉,崔愛利;2002年上海兒童手足口病病例中腸道病毒71型和柯薩奇病毒A組16型的調(diào)查[J];中華兒科雜志;2005年09期

6 龔黎明;葛瓊;嚴菊英;盧亦愚;馮燕;茅海燕;李敏紅;周敏;;浙江省腸道病毒71型的分離與VP1區(qū)域序列分析[J];中華流行病學(xué)雜志;2005年12期

7 何雅青,楊帆,李良成,楊洪,陳淑霞,金奇;我國深圳地區(qū)手足口病患者腸道病毒71型的分離與鑒定[J];中華實驗和臨床病毒學(xué)雜志;1999年01期

8 楊秀惠;何家鑫;嚴延生;何愛華;沈曉娜;陳前進;;一起手足口病暴發(fā)的病原學(xué)診斷與分析[J];中國人獸共患病學(xué)報;2007年04期

【相似文獻】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 葉予;;研究獲得腸道病毒71型精確結(jié)構(gòu)[J];前沿科學(xué);2013年01期

2 陳姝蒙;丁崢嶸;趙智嫻;羅梅;田炳均;湯晶晶;張杰;陸林;;云南省2012年邊境地區(qū)健康兒童腸道病毒監(jiān)測及基因特征分析[J];中國病毒病雜志;2013年03期

3 馬子行;沈美s，

本文編號：2273410