2011年甘肅省和陜西省流行的人副流感病毒1、2、3型基因特征分析
本文關鍵詞:2009-2011年甘肅省和陜西省流行的人副流感病毒1、2、3型基因特征分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
《蘭州大學》 2013年
2009-2011年甘肅省和陜西省流行的人副流感病毒1、2、3型基因特征分析
張鵬
【摘要】:目的:研究我國甘肅省、陜西省流行的人副流感病毒(Human Parainfluenza viruse, HPIVs)的基因特征和流行規(guī)律,為中國大陸人副流感病毒分子流行病學研究累積數據。 方法:2009年1月至2011年12月共采集甘肅省和陜西省因急性呼吸道感染的住院患者的咽拭子標本719份,采用多重反轉錄聚合酶鏈反應(Multiplex reverse transcription polymerase chain reaction,多重RT-PCR)方法對常見呼吸道病毒性病原體進行篩查。多重RT-PCR篩查HPIVs陽性的標本用巢式PCR (nested polymerase chain reaction, nested PCR)擴增其血凝素-神經氨酸酶蛋白(Hemagglutinin-neuraminidase, HN)基因,擴增產物采用全自動核酸分析儀進行分析,HN陽性樣本進行序列測定和基因分析。根據序列測定結果進行核苷酸和氨基酸(Amino acid, AA)同源性分析,應用比鄰法(Neighbor-Joining Tree)建立HPIVHN基因系統(tǒng)進化樹。 結果:經多重PCR篩選出67份感染HPIVs的樣本,其中39份為HPIVs與其它呼吸道病毒混合感染的樣本。巢式PCR和序列測定分析共得到HPIVs HN蛋白基因全長序列17條,其中HPIV-12條、HPIV-22條和HPIV-313條。2株HPIV-1均屬于B群,其核甘酸和氨基酸的同源性分別為99.2%和100%;與17株日本代表毒株的核苷酸和氨基酸同源性分別為96.3%-98.8%和96.5-99.7%,其中分別與AB641251/Yamagata/07/2072、AB641301/Yamagata/2145/09的核苷酸同源性最大,分別為98.8%、98.8%、98.7%,和98.7%,但是氨基酸同源性皆為100%。2株HPIV-2(?)中gansu11-62110396屬A群、gansu11-s191屬于B群,2株HPIV-2的HN全基因序列的核苷脧和氨基酸同源性分別為92.5%和94.3%;與18株HPIV-2代表毒株的核苷酸和氨基酸同源性分別為91.7%-98.4%和94.2%-98.4%。Gansul1-62110396與Oklahoma/94/USA/09的核苷酸和氦基酸同源性最大,分別為97.6%和98.4%,而gansu11-s191則與日本分離株4-80/04的核苷酸同源性最大,為98.4%,但氨基酸同源性儀為97.7%。13株HPIV-3均屬C3亞群,其核苷酸和氦基酸同源性分別為97.8%-99.8%和98.9%-100%;與美國、加拿大和澳大利亞的HPIV-3的HN基因序列之間的核苷酸和氨基酸同源性較小,最小分別為94.0%和96.6%。Shaanxi09-2與shaanxi10-H0091、shaanxi10-H0091與gansu11-62110372以及shaanxi09-2與BJ/291/09之間的核苷酸同源性分別為99.4%、99.3%和99.4%,但是其氨基酸同源性均為100%。 結論:2009-2011年甘肅省和陜西省的HPIVs流行毒株以HPIV-3株為主,均屬C3亞群,提示甘肅和陜西兩省不同年份間存在HPIV-3的持續(xù)循環(huán)傳播;并且和日本的HPIVs毒株的核苷酸和氨基酸同源性比較高,提示HPIVs的流行毒株存在一定的地域局限性。HPIV-1株和HPIV-2株僅在甘肅省散在發(fā)病。
【關鍵詞】:
【學位授予單位】:蘭州大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2013
【分類號】:R181.3;R373.13
【目錄】:
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【參考文獻】
中國期刊全文數據庫 前6條
1 李瑾;毛乃穎;秦萌;胡秀梅;楊夢婕;王淼;張晨;許文波;馬學軍;;GeXP多重PCR技術同時檢測12種常見呼吸道病毒[J];病毒學報;2011年06期
2 陳行昀,高琦,許楠,李梅,李曉眠;副流感病毒的分子生物學性狀及其疫苗的研究進展[J];國外醫(yī)學.病毒學分冊;2004年05期
3 雷小英;彭東紅;;人副流感病毒的研究進展[J];兒科藥學雜志;2012年11期
4 林斌;田新貴;唐啟慧;王長兵;游愛萍;周榮;;副流感病毒核衣殼蛋白的基因克隆、原核表達與多克隆抗體制備[J];熱帶醫(yī)學雜志;2008年04期
5 陳翊;曾華;鐘家禹;林濤;朱冰;周榮;;人副流感病毒廣州分離株ZYMgz01全基因組序列測定及分析[J];熱帶醫(yī)學雜志;2011年08期
6 黃志英;董琳;陳小芳;張海鄰;周曉聰;羅運春;李昌崇;;溫州地區(qū)兒童副流感病毒感染的流行病學特點[J];實用兒科臨床雜志;2006年16期
【共引文獻】
中國期刊全文數據庫 前10條
1 張紅斌;陳紹威;毛熙光;黃桂英;王芳;;地區(qū)不孕不育婦女TORCH檢測情況及分析[J];北方藥學;2012年03期
2 曲芬;;氣單胞菌感染的研究進展[J];傳染病信息;2006年01期
3 常潔;李春云;李海靜;羅運春;陳小芳;楊少燕;;2007~2008年溫州地區(qū)急性呼吸道感染病毒病原學研究[J];中國當代兒科雜志;2010年01期
4 宋幼林;李晉華;嚴榮榮;;重癥醫(yī)學科感染細菌的種類及耐藥性監(jiān)測[J];當代醫(yī)學;2012年01期
5 俞蘇蒙;葉曉波;邢云卿;高彥軍;馮莉;;入伍新兵副流感病毒抗體水平流行病學調查[J];公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學;2009年06期
6 張建明;肖武;王宇平;高博;陳亮;鄭燕平;;福州市入境發(fā)熱人群部分病毒性傳染病病原譜初步研究[J];福建醫(yī)科大學學報;2012年02期
7 王雷;魏強;李春雨;武桂珍;;病原微生物材料安全數據單編寫研究[J];中國公共衛(wèi)生管理;2011年02期
8 劉瓊;丁海榕;鄭榮;彭鳳英;童明華;;葡萄球菌凝固酶試驗玻片法結果最佳判讀標準的探討[J];中國感染控制雜志;2009年01期
9 黃志英;董琳;;人副流感病毒的病原學、流行病學及所致疾病的特點[J];國際呼吸雜志;2006年09期
10 馬翔;劉伯偉;李怡芬;徐五星;;關注泌尿生殖道支原體培養(yǎng)和鑒定[J];國際檢驗醫(yī)學雜志;2009年09期
中國重要會議論文全文數據庫 前3條
1 尤克友;李克誠;章國忠;金國信;鄭戈;夏菲;吳曉霞;胡安利;孫慶豐;;腸道病毒腦炎的季節(jié)分布及臨床特點[A];2011年浙江省醫(yī)學會兒科學分會學術年會暨兒內科疾病診治新進展國家級學習班論文匯編[C];2011年
2 劉志輝;何霞;;應加強對非結核分枝桿菌病的研究[A];2007年中國防癆協(xié)會全國學術會議論文集[C];2007年
3 吳曉娟;陳崢宏;王菲;;抗生素致幽門螺桿菌細胞壁缺陷的研究[A];第3屆全國人畜共患病學術研討會論文集[C];2011年
中國博士學位論文全文數據庫 前1條
1 陳蓉;兒童呼吸道感染病原學及肺炎鏈球菌耐藥的分子流行病學研究[D];復旦大學;2010年
中國碩士學位論文全文數據庫 前10條
1 劉騰飛;犬副流感病毒的檢測和NP基因的克隆、表達及其重組蛋白的免疫學活性的研究[D];新疆農業(yè)大學;2010年
2 盧錦萍;兒童銅綠假單胞菌感染臨床特點及高危因素分析[D];重慶醫(yī)科大學;2011年
3 肖霓光;長沙地區(qū)急性下呼吸道感染住院兒童病毒譜調查及人偏肺病毒的現(xiàn)狀分析[D];南華大學;2011年
4 余道澄;輪狀病毒ELISA法的改進及臨床應用[D];重慶醫(yī)科大學;2006年
5 潘啟明;病炎清Ⅳ號抗副流感病毒體外實驗及對其痰熱型支氣管炎的臨床研究[D];廣州中醫(yī)藥大學;2007年
6 王宗耀;仙臺病毒F基因的表達與間接ELISA檢測方法的建立和應用[D];揚州大學;2007年
7 成娟;復發(fā)性外陰陰道假絲酵母菌病患者假絲酵母菌與支原體混合感染研究[D];中南大學;2007年
8 歐陽華偉;嗜酸乳桿菌標準株對銅綠假單孢菌抑殺效果的觀察[D];中南大學;2007年
9 王嵐峰;三株TMPD降解菌的鑒定[D];西北農林科技大學;2007年
10 古麗努爾·阿吾提;Beagle犬即刻種植體齦下菌群的研究[D];新疆醫(yī)科大學;2007年
【二級參考文獻】
中國期刊全文數據庫 前9條
1 任桂杰,王志玉;副粘病毒包膜糖蛋白分子生物學研究進展[J];病毒學報;2005年01期
2 郭姍姍;黃洋;趙曄;高英杰;鞏文峰;崔曉蘭;;梔子提取物ZG對副流感病毒1型感染后宿主細胞膜的影響[J];病毒學報;2007年05期
3 胡秀梅;張勇;徐邦牢;楊夢婕;王淼;張晨;李瑾;白如銀;周小棉;許文波;馬學軍;;GeXP多重基因表達遺傳分析系統(tǒng)在手足口病病原分型檢測中的應用[J];病毒學報;2011年04期
4 黃志英;董琳;;人副流感病毒的病原學、流行病學及所致疾病的特點[J];國際呼吸雜志;2006年09期
5 李杰;馮捷;陳立明;;32046例住院患者醫(yī)院感染的調查與分析[J];熱帶醫(yī)學雜志;2007年03期
6 白慕群;安靜;安紅;包紅;周旭;;人3型副流感病毒HN基因的克隆、表達及其免疫原性[J];中國生物制品學雜志;2008年12期
7 黃志英;董琳;陳小芳;張海鄰;周曉聰;羅運春;李昌崇;;溫州地區(qū)兒童副流感病毒感染的流行病學特點[J];實用兒科臨床雜志;2006年16期
8 董琳;陳小芳;周曉聰;林劍;李錦燕;;呼吸道合胞病毒、副流感病毒3型毛細支氣管炎患兒鼻咽分泌物趨化因子水平的比較[J];實用兒科臨床雜志;2007年04期
9 裘紅梅;于舒;苗迎秋;劉為國;鄭叢龍;;納米銀抑制副流感病毒的研究[J];實用醫(yī)學雜志;2010年14期
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1 傅燕;董紅軍;倪紅霞;胡逢蛟;;寧波地區(qū)2004年-2009年麻疹病毒分離株血溶素蛋白基因特征分析[J];中國衛(wèi)生檢驗雜志;2011年05期
2 李薇;李建強;趙祖波;王智永;趙英杰;王玉琳;;腸道病毒71型甘肅分離株VP1基因特征分析[J];中國生物制品學雜志;2010年10期
3 王艷;李丹;馬艷;韓悅;郭軍巧;;遼寧省風疹野病毒基因特征分析[J];中國公共衛(wèi)生;2011年02期
4 王艷;李丹;馬艷;韓悅;郭軍巧;;遼寧省流行性腮腺炎野病毒的分離與鑒定[J];病毒學報;2011年01期
5 劉建鋒;張勇;李慧;趙曉虹;甄曉榮;嚴冬梅;付鴻;陳瑛;王東絕;祝雙利;安洪秋;郭學斌;許文波;;從手足口病病例分離的兩株柯薩奇病毒A組4型毒株的VP_4~VP_2區(qū)基因特征分析[J];中國疫苗和免疫;2009年04期
6 陳莉萍;徐德順;紀蕾;吳曉芳;;湖州市甲型H1N1流感病毒株的HA基因分析[J];中國衛(wèi)生檢驗雜志;2011年05期
7 許松濤;姬奕昕;朱貞;關蓉暉;蔣小泓;張燕;劉中華;崔愛利;毛乃穎;梁勇;周淑潔;張杰;李崇山;許文波;;中國2005年流行麻疹野病毒H_(1a)基因亞型血凝素基因和氨基酸特征分析[J];中國計劃免疫;2006年01期
8 吳宏偉;許松濤;周劍惠;朱貞;姬奕欣;鄭煥英;趙春芳;梁勇;陸培善;張紅;王艷;司源;張燕;蔣小泓;崔愛利;毛乃穎;許文波;;中國2006年麻疹野病毒血溶素基因特征分析[J];中國疫苗和免疫;2009年03期
9 陶澤新;王海巖;徐愛強;宋立志;李巖;劉桂芳;劉堯;樊慶瑩;;人類腸道病毒B組73、75和97型山東地方株的鑒定及其基因特征分析[J];病毒學報;2010年01期
10 朱貞;許文波;毛乃穎;蔣小泓;許松濤;何吉蘭;孫莉;凌華;張珍英;李聰勇;巴卓瑪;詹軍;陳慧;王飛霞;周淑潔;陳霞;鄭蕾;戴德芳;張紅;梁勇;;2003~2007年中國風疹病毒基因特征分析[J];病毒學報;2008年01期
中國重要會議論文全文數據庫 前10條
1 李茂寧;趙武;秦毅斌;盧冰霞;李斌;梁家幸;肖愛歡;何穎;蘇乾蓮;梁保忠;覃勇;張偉;韋建華;曹國敏;黃偉堅;;廣西豬乙型腦炎病毒的分離與鑒定[A];中國畜牧獸醫(yī)學會獸醫(yī)公共衛(wèi)生學分會第二次學術研討會論文集[C];2010年
2 劉命華;王克雙;費菲;程玉琴;范在豐;;中國北京、河北地區(qū)葡萄卷葉伴隨病毒種類調查及其分子變異研究[A];中國植物病理學會2010年學術年會論文集[C];2010年
3 楊華可;黃勇;袁達康;黎景全;李艷芬;;東莞市2008年麻疹野病毒基因型分析[A];2010廣東省預防醫(yī)學會學術年會資料匯編[C];2010年
4 成子強;哈斯阿古拉;張利;趙振華;;J亞群白血病的病理學觀察及基因分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學會禽病學分會雞淋巴白血病防控技術研討會論文集[C];2010年
5 羅鴻斌;覃健萍;薛春宜;陳峰;謝青梅;畢英佐;曹永長;;2009-2010年雞傳染性支氣管炎病毒分子流行病學研究[A];中國畜牧獸醫(yī)學會禽病學分會第十五次學術研討會論文集[C];2010年
6 王開功;周思旋;周碧君;隆華;文明;;PRRSV Nsp10基因的克隆及序列分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學會2010年學術年會——第二屆中國獸醫(yī)臨床大會論文集(下冊)[C];2010年
7 王劭;陳少鶯;朱小麗;程曉霞;陳仕龍;林鋒強;李兆龍;;鴨病毒性肝炎病毒NA株全基因序列測定及分析[A];福建省畜牧獸醫(yī)學會2009年學術年會論文集[C];2009年
8 李麗莉;許愛娥;;不同地區(qū)申克孢子絲菌基因分型研究[A];2006中國中西醫(yī)結合皮膚性病學術會議論文匯編[C];2006年
9 王旭榮;王小輝;韓富杰;李建喜;孟嘉仁;;甘肅犬瘟熱病毒野毒株的分離和N基因遺傳進化分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學會2010年學術年會——第二屆中國獸醫(yī)臨床大會論文集(上冊)[C];2010年
10 吳斌;閆強;湯奮揚;李亮;徐飛海;葛勝祥;崔侖標;王慎驕;付建光;田華;秦圓方;鄧斐;祁賢;朱鳳才;羊海濤;汪華;;江蘇省腸道病毒71型分離株的分子遺傳進化特征[A];華東地區(qū)第十次流行病學學術會議暨華東地區(qū)流行病學學術會議20周年慶典論文匯編[C];2010年
中國重要報紙全文數據庫 前10條
1 記者 譚嘉;[N];健康報;2009年
2 ;[N];新華每日電訊;2006年
3 本報記者 吳佳學;[N];江蘇科技報;2008年
4 何進喜 時仲省;[N];健康報;2002年
5 趙卓昀;[N];健康報;2006年
6 林苗 黃運生 高彥生;[N];中國國門時報;2003年
7 李偉;[N];農民日報;2006年
8 本報編輯部編譯;[N];中國經濟導報;2005年
9 記者 陳江;[N];廣西日報;2004年
10 袁苑;[N];經濟參考報;2001年
中國博士學位論文全文數據庫 前10條
1 劉振宇;海藻中兩種與植物抗病相關銅結合蛋白的分離、特性和基因特征[D];福建農林大學;2004年
2 劉紅;版納病毒全基因組序列特征及其分子進化研究[D];中國疾病預防控制中心;2011年
3 王旭榮;“高熱病”豬群中PRRSV流行株的研究[D];西北農林科技大學;2008年
4 王礞礞;豬源TTV:分子流行病學,全長序列分析及感染性分子克隆的構建[D];中國農業(yè)科學院;2011年
5 王煜;產AmpC酶肺炎克雷伯菌、大腸埃希菌基因特征及耐藥機制的研究[D];中國醫(yī)科大學;2005年
6 王勇軍;文昌魚cathepsin、β-MSP和allantoicase基因的特征、表達和進化研究[D];中國海洋大學;2005年
7 吳承春;侵染蕌頭的病毒種類鑒定及其部分病毒序列基因組特性分析[D];華中農業(yè)大學;2009年
8 張建新;西瓜花葉病毒基因組全序列分析及其蚜蟲體內受體蛋白的分離與鑒定[D];西北農林科技大學;2007年
9 劉永宏;高致病性豬繁殖與呼吸綜合征病理學研究及其病毒的序列分析[D];內蒙古農業(yè)大學;2010年
10 孟勝利;中國流行的狂犬病病毒時空進化分析[D];武漢生物制品研究所;2010年
中國碩士學位論文全文數據庫 前10條
1 張鵬;2009-2011年甘肅省和陜西省流行的人副流感病毒1、2、3型基因特征分析[D];蘭州大學;2013年
2 王儒彬;河北省兒童手足口病病原感染狀況及病原特征分析[D];河北醫(yī)科大學;2011年
3 晁靈;2008年河南省埃柯病毒25型基因特征分析[D];鄭州大學;2011年
4 楊猛;河南省乙型腦炎病毒的分離鑒定及分子特性分析[D];河南農業(yè)大學;2011年
5 李巖;河北省致手足口病病原譜及病原基因特征分析[D];河北醫(yī)科大學;2010年
6 朱貞;2003~2007年中國大陸風疹病毒分子流行病學研究[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學;2008年
7 王金鳳;河北省2007-2011年豬繁殖與呼吸綜合征病毒的分子流行病學調查[D];河北農業(yè)大學;2011年
8 李師師;規(guī)模養(yǎng)殖場新城疫病原監(jiān)測及病毒進化分析[D];湖南農業(yè)大學;2012年
9 李佳;我國新分離乙型腦炎病毒基因組cDNA克隆的研究[D];山西大學;2012年
10 張譯元;水貂α,β-干擾素基因的克隆、表達與遺傳進化分析[D];山東農業(yè)大學;2012年
本文關鍵詞:2009-2011年甘肅省和陜西省流行的人副流感病毒1、2、3型基因特征分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
,本文編號:178807
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