本文關(guān)鍵詞：2009-2011年甘肅省和陜西省流行的人副流感病毒1、2、3型基因特征分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

《蘭州大學(xué)》 2013年

2009-2011年甘肅省和陜西省流行的人副流感病毒1、2、3型基因特征分析

張鵬  

【摘要】：目的：研究我國甘肅省、陜西省流行的人副流感病毒(Human Parainfluenza viruse, HPIVs)的基因特征和流行規(guī)律,為中國大陸人副流感病毒分子流行病學(xué)研究累積數(shù)據(jù)。 方法：2009年1月至2011年12月共采集甘肅省和陜西省因急性呼吸道感染的住院患者的咽拭子標(biāo)本719份,采用多重反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(Multiplex reverse transcription polymerase chain reaction,多重RT-PCR)方法對常見呼吸道病毒性病原體進(jìn)行篩查。多重RT-PCR篩查HPIVs陽性的標(biāo)本用巢式PCR (nested polymerase chain reaction， nested PCR)擴(kuò)增其血凝素-神經(jīng)氨酸酶蛋白(Hemagglutinin-neuraminidase, HN)基因,擴(kuò)增產(chǎn)物采用全自動核酸分析儀進(jìn)行分析,HN陽性樣本進(jìn)行序列測定和基因分析。根據(jù)序列測定結(jié)果進(jìn)行核苷酸和氨基酸(Amino acid, AA)同源性分析,應(yīng)用比鄰法(Neighbor-Joining Tree)建立HPIVHN基因系統(tǒng)進(jìn)化樹。 結(jié)果：經(jīng)多重PCR篩選出67份感染HPIVs的樣本,其中39份為HPIVs與其它呼吸道病毒混合感染的樣本。巢式PCR和序列測定分析共得到HPIVs HN蛋白基因全長序列17條,其中HPIV-12條、HPIV-22條和HPIV-313條。2株HPIV-1均屬于B群,其核甘酸和氨基酸的同源性分別為99.2%和100%；與17株日本代表毒株的核苷酸和氨基酸同源性分別為96.3%-98.8%和96.5-99.7%,其中分別與AB641251/Yamagata/07/2072、AB641301/Yamagata/2145/09的核苷酸同源性最大,分別為98.8%、98.8%、98.7%,和98.7%,但是氨基酸同源性皆為100%。2株HPIV-2(?)中g(shù)ansu11-62110396屬A群、gansu11-s191屬于B群,2株HPIV-2的HN全基因序列的核苷脧和氨基酸同源性分別為92.5%和94.3%；與18株HPIV-2代表毒株的核苷酸和氨基酸同源性分別為91.7%-98.4%和94.2%-98.4%。Gansul1-62110396與Oklahoma/94/USA/09的核苷酸和氦基酸同源性最大,分別為97.6%和98.4%,而gansu11-s191則與日本分離株4-80/04的核苷酸同源性最大,為98.4%,但氨基酸同源性儀為97.7%。13株HPIV-3均屬C3亞群,其核苷酸和氦基酸同源性分別為97.8%-99.8%和98.9%-100%；與美國、加拿大和澳大利亞的HPIV-3的HN基因序列之間的核苷酸和氨基酸同源性較小,最小分別為94.0%和96.6%。Shaanxi09-2與shaanxi10-H0091、shaanxi10-H0091與gansu11-62110372以及shaanxi09-2與BJ/291/09之間的核苷酸同源性分別為99.4%、99.3%和99.4%,但是其氨基酸同源性均為100%。 結(jié)論：2009-2011年甘肅省和陜西省的HPIVs流行毒株以HPIV-3株為主,均屬C3亞群,提示甘肅和陜西兩省不同年份間存在HPIV-3的持續(xù)循環(huán)傳播；并且和日本的HPIVs毒株的核苷酸和氨基酸同源性比較高,提示HPIVs的流行毒株存在一定的地域局限性。HPIV-1株和HPIV-2株僅在甘肅省散在發(fā)病。

【關(guān)鍵詞】：
【學(xué)位授予單位】：蘭州大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2013
【分類號】：R181.3;R373.13
【目錄】：

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