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云南省2011-2014年急性弛緩性麻痹病例非脊髓灰質(zhì)炎腸道病毒分子流行病學特征

發(fā)布時間:2018-04-22 05:17

  本文選題:急性弛緩性麻痹 + 非脊髓灰質(zhì)炎腸道病毒; 參考:《中國疫苗和免疫》2017年06期


【摘要】:目的了解非脊髓灰質(zhì)炎(脊灰)腸道病毒(Non-polio enterovirus,NPEV)的型別分布及分子進化特征。方法對2011-2014年從云南省急性弛緩性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例中分離到的148株NPEV進行VP1完整編碼區(qū)核苷酸的擴增與序列測定。所獲得的云南地方株基因序列與各基因型原型株進行核苷酸與氨基酸同源性比較,并與Gen Bank中選取的代表株構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。結(jié)果在148株NPEV分離株中,腸道病毒(Enterovirus,EV)A組(EV-A)、EV-B、EV-C分別占31.1%(46株,8個血清型)、64.9%(96株,27個血清型)、4.1%(6株,3個血清型);基因進化樹顯示,各種血清型病毒株與對應(yīng)原型株及代表株聚集;除?刹《10型(E-10)和EV-C96型外,云南地方株與原型株位于不同分支。在4年的流行過程中,同一個型別的分離株之間的遺傳變異程度最高的是EV-C96、E-18和E-5,分別達到21.5%、21.3%和20.4%。結(jié)論云南省存在EV多個型別的循環(huán),需持續(xù)性監(jiān)測和探索EV分子流行病學和進化規(guī)律。
[Abstract]:Objective to investigate the type distribution and molecular evolution of non polioenterovirusNPEV (Non-polio enterovirusNPEV). Methods 148 strains of NPEV isolated from acute flaccid paralysis in Yunnan province from 2011 to 2014 were amplified and sequenced in the complete coding region of VP1. The nucleotide and amino acid homology of Yunnan native strain was compared with that of each genotypic prototype strain, and the phylogenetic tree was constructed with the representative strain selected in Gen Bank. Results among the 148 NPEV isolates, the Enterovirus-EVV EV-C group accounted for 31.1%, 8 serotypes 64.9%, 27 serotypes 6 strains and 3 serotypes, and the phylogenetic tree showed that all serotypes, their corresponding prototypes and their representative strains were clustered. With the exception of Eco virus type 10 (E-10) and EV-C96, Yunnan native strain and prototype strain are located in different branches. During the 4 years of epidemic, the highest degree of genetic variation among isolates of the same type was EV-C96 E-18 and E-5, which reached 21.521.3% and 20.4g, respectively. Conclusion there are several types of EV cycles in Yunnan Province, and it is necessary to continuously monitor and explore the molecular epidemiology and evolution of EV.
【作者單位】: 云南省疾病預防控制中心云南省腸道病毒研究中心;
【基金】:國家自然科學基金云南省腸道病毒分子生物學特征及監(jiān)測研究(編號:81160198)
【分類號】:R181.3;R512.4

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