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東北地區(qū)蜱傳病原多樣性調查以及檢測方法的建立

發(fā)布時間:2017-10-25 13:03

  本文關鍵詞:東北地區(qū)蜱傳病原多樣性調查以及檢測方法的建立


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【摘要】:蜱是一種媒介生物,可以攜帶一些病原進行傳播。 本實驗采用聚合酶鏈式反應(PCR)通過對2009年以及2010年從黑龍江的綏芬河,密山,東寧,虎林,遜克,黑河等地以及內蒙古草原和遼寧朝陽地區(qū)采集的蜱蟲攜帶的多種病原體進行檢測,發(fā)現(xiàn)立克次體、伯氏疏螺旋體、Q熱立克次體和巴通體的存在,通過測序分型,伯氏疏螺旋體基因型為B.g,立克次體為斑點熱立克次體和斑點傷寒立克次體。 09年的黑龍江共96份樣本,全溝硬蜱中檢測出伯氏疏螺旋體4例陽性,陽性百分比為4.17%; Q熱立克次體18例陽性,陽性百分比的18.75%;立克次體34例陽性,陽性百分比為35.42%,其中斑點熱立克次體17例包括西伯利亞立克次體檢測到的8例陽性,斑疹傷寒立克次體也檢測到17例,全溝硬蜱和森林革蜱都有發(fā)現(xiàn),地區(qū)除了東寧外都發(fā)現(xiàn)其攜帶;2010年的黑龍江共全溝硬蜱81只,森林革蜱52只和20只血蜱。PCR檢測發(fā)現(xiàn)攜帶3例伯氏疏螺旋體,陽性百分比為1.96%;15例Q熱立克次體,陽性百分比為9.8%;23例立克次體,陽性百分比為15.03%,其中斑點熱立克次體19例,斑疹傷寒立克次體4例;1例巴通體陽性,百分比為0.65%;內蒙古60份亞東璃眼蜱,經(jīng)檢測,發(fā)現(xiàn)5例伯氏疏螺旋體,陽性百分比為8.33%;16例Q熱立克次體以及2例西伯利亞立克次體,陽性百分比分別為26.67%和3.33%;遼寧朝陽98個樣本,發(fā)現(xiàn)了2例伯氏疏螺旋體和9例Q熱立克次體,陽性百分比分別為2.04%,9.18%;伯氏疏螺旋體及立克次體類攜帶比較廣泛,10年的蜱種發(fā)現(xiàn)了巴通體,雖然只有一例,但是巴通體在我國發(fā)現(xiàn)感染的不多,更應該加強貿(mào)易往來間的安檢,以防從國外傳來新的病原物種。Q熱立克次體在東北地區(qū)首次發(fā)現(xiàn)大規(guī)模的感染情況,因此要盡可能的排除假陽性的出現(xiàn),對陽性結果進行southern雜交驗證。Southern雜交結果表明蜱蟲攜帶大量Q熱立克次體,又一次拉響了警報。 建立的熒光定量PCR方法具有良好的靈敏性,較高的特異性,靈敏度為37拷貝/μL,特異性驗證的r值為0.997,因此具備實用性。 本實驗通過對病原多樣性的監(jiān)測調查以及方法的建立,為我國邊境地區(qū)公共衛(wèi)生安全做出貢獻,掌握病原的多樣性,可以為預防做準備,對于保護人類生命財產(chǎn)安全具備重要的意義。
【關鍵詞】:多樣性 southern雜交 熒光定量PCR
【學位授予單位】:吉林農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2012
【分類號】:R181.3;R446.5
【目錄】:
  • 摘要4-5
  • Abstract5-9
  • 第一章 前言9-13
  • 1.1 東北及內蒙邊境地區(qū)環(huán)境的多樣性9-10
  • 1.2 蜱以及攜帶病原體的多樣性及研究現(xiàn)狀及檢測方法10-12
  • 1.3 病原體生態(tài)多樣性調查的意義以及必要性12-13
  • 第二章 2009年黑龍江,遼寧朝陽以及內蒙古地區(qū)蜱傳病原體調查檢測13-23
  • 2.1 試驗材料13-14
  • 2.1.1 2009年各地區(qū)不同種類蜱蟲采集情況13-14
  • 2.1.2 儀器和試劑14
  • 2.2 試驗方法14-19
  • 2.2.1 DNA,RNA的提取14-15
  • 2.2.2 引物的合成15-17
  • 2.2.3 各地區(qū)樣本的檢測反應17-18
  • 2.2.4 伯氏疏螺旋體以及立克次體PCR產(chǎn)物純化18
  • 2.2.5 連接已經(jīng)純化好的PCR產(chǎn)物和載體18
  • 2.2.6 感受態(tài)細胞的制備以及質粒的重組18-19
  • 2.2.7 PCR產(chǎn)物測序19
  • 2.3 結果與分析19-22
  • 2.3.1 黑龍江2009年采集的蜱蟲檢測結果19-21
  • 2.3.2 內蒙古及遼寧朝陽地區(qū)蜱蟲樣本檢測結果21-22
  • 2.4 討論22-23
  • 第三章 2010年黑龍江蜱蟲樣本病原體調查檢測23-29
  • 3.1 試驗材料23-24
  • 3.1.1 2010年黑龍江各地區(qū)蜱蟲樣本的采集情況23
  • 3.1.2 儀器和試劑23-24
  • 3.2 試驗方法24-26
  • 3.2.1 DNA,RNA的提取24
  • 3.2.2 引物的合成24
  • 3.2.3 樣本DNA以及RNA的PCR檢測24-25
  • 3.2.4 伯氏疏螺旋體以及立克次體PCR產(chǎn)物純化25
  • 3.2.5 連接純化好的PCR產(chǎn)物和T載體25
  • 3.2.6 感受態(tài)細胞的制備以及質粒的重組25-26
  • 3.2.7 PCR產(chǎn)物測序26
  • 3.3 結果與分析26-27
  • 3.4 討論27-29
  • 第四章 Q熱立克次體SOUTHERN BLOT29-33
  • 4.1 試驗材料29
  • 4.2 試驗方法29-31
  • 4.3 結果與分析31-32
  • 4.4 討論32-33
  • 第五章 裂谷熱病原熒光定量PCR方法的建立33-40
  • 5.1 試驗材料33
  • 5.2 試驗方法33-36
  • 5.3 結果與分析36-38
  • 5.3.1 引物、探針的濃度以及退火溫度的優(yōu)化36-37
  • 5.3.2 最佳閾值37
  • 5.3.3 靈敏度的檢測37-38
  • 5.3.4 特異性檢驗38
  • 5.4 討論38-40
  • 第六章 結論40-41
  • 參考文獻41-46
  • 附錄46-47
  • 致謝47
  • 作者簡介47-49
  • 附件49

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