目的:了解深齲微生物碳水化合物活性酶特征。方法:收集第一恒磨牙深齲淺層和深層樣本共16份,提取DNA后基因組高通量測序。測序結(jié)果比對NCBI nr及CAZy數(shù)據(jù)庫,分析深齲微生物組成及碳水化合物活性酶特點。結(jié)果:深齲微生物在CAZy庫中注釋的酶家族主要為糖苷水解酶（47.28%）,其次為糖基轉(zhuǎn)移酶（35.37%）,輔助氧化還原酶最少（0.38%）。相對豐度前10的活性酶主要集中在GH13和GH1家族。擬桿菌門包含相對比例最多的活性酶基因,且深齲淺層和深層微生物碳水化合物活性酶模式無明顯差異（P>0.05）。結(jié)論:深齲淺層及深層微生物碳水化合物活性酶特征相似,基因組的酶譜分布提示其代謝蔗糖和淀粉類植物源性碳水化合物有遺傳優(yōu)勢。擬桿菌門具有更廣泛的碳水化合物底物。 

【文章來源】：臨床口腔醫(yī)學(xué)雜志. 2020,36(07)

【文章頁數(shù)】：4 頁

【部分圖文】：

深齲微生物基因組比對CAZy庫注釋不同活性酶家族結(jié)果

在門水平分類層級上,深齲樣本注釋相對豐度位于前10的微生物種類,分別是放線菌(Actinobacteria)(35.85±21.05)%,厚壁菌(Firmicutes)(31.20±25.00)%,擬桿菌(Bacteroidetes)(13.58±13.06)%,變形菌(Proteobacteria)(3.58±3.83)%,梭桿菌(Fusobacteria)(2.54±3.83)%,螺旋體(Spirochaetes)(1.32±1.18)%,互養(yǎng)菌(Synergistetes)(1.02±2.37)%,暫定糖化菌(Candidatus Saccharibacteria)(1.01±1.41)%,子囊菌(Ascomycota)(0.09±0.23)%,衣原體(Chlamydiae)(0.05±0.04)%(圖3)。排名前5的微生物種類包含CAZymes基因的比例分別為:放線菌25.18%;厚壁菌28.17%;擬桿菌30.15%;變形菌5.58%及梭桿菌3.78%。結(jié)果提示,擬桿菌門的細(xì)菌基因組檢測出相對較多的CAZymes基因。圖3 深齲微生物基因組于門分類水平前10位物種的注釋結(jié)果

深齲微生物基因組于門分類水平前10位物種的注釋結(jié)果

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于高通量測序技術(shù)研究兒童齲病口腔微生物群落結(jié)構(gòu)[J]. 隋文,朱宏,高文麗,洪詠龍.  臨床口腔醫(yī)學(xué)雜志. 2019(12)



本文編號：3564648