口腔鱗癌線粒體DNAD環(huán)區(qū)HVR Ⅰ突變的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-17 23:03
目的:研究口腔頜面部鱗狀細(xì)胞癌的線粒體DNA(mitochonDria DNA, mtDNA)復(fù)制控制區(qū)(D-Loop,D環(huán)區(qū))的高變Ⅰ區(qū)(hypervariable region I, HVRI)的突變情況。方法:7例口腔鱗狀細(xì)胞癌患者,取癌組織、癌旁組織及正常口腔粘膜的新鮮標(biāo)本,投入液氮中保存,所有標(biāo)本均經(jīng)HE染色病理學(xué)診斷證實(shí)。應(yīng)用GENMED組織/細(xì)胞線粒體DNA萃取試劑提取各標(biāo)本的線粒體DNA (mtDNA),應(yīng)用巢式PCR對(duì)D環(huán)區(qū)HVRⅠ進(jìn)行擴(kuò)增,對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序分析,尋找突變位點(diǎn)。與GENBANK人類同源線粒體序列對(duì)比,當(dāng)腫瘤組織、癌旁組織與正常組織序列不同時(shí)定義為突變,當(dāng)腫瘤組織、癌旁組織、正常組織基因序列相同而與GENBANK中的序列不同時(shí)定義為基因的多態(tài)性。結(jié)果:經(jīng)過基因測(cè)序、比對(duì),7例口腔鱗癌組織標(biāo)本中3例出現(xiàn)mtDNA D環(huán)區(qū)HVRⅠ的突變,突變率為43%,共70個(gè)突變位點(diǎn),大多位于16024-16383區(qū)域內(nèi)。A/G或C/T為13個(gè),A、G轉(zhuǎn)換為C、T為39個(gè);堿基缺失12個(gè),插入突變?yōu)?個(gè)。以點(diǎn)突變?yōu)橹?約占突變形式的74%,插入突變和堿基缺失發(fā)生率在26...
【文章來源】:青島大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
第2例癌旁組織HVRI區(qū)測(cè)序波形圖
青島大學(xué)碩士學(xué)位論文第2例正常組織HVRI基因序列GCTAGCAGGCAI…TAGGC『l’rl’『l’l,GGCCTGAAGTAGGAACCAGATGTCGG川叭CAGTTCACTTI’AGCTACCCCCAAGTGTTATGGGCCCGGAGCGAGGAGAGTAGCACTCTTGTGCGGGATATTGATTTCACGGAGGATGGTGGTCAAGGGACCCC1’A1,CTGAGGGGGGTCATCCAI,GGGGGCGAGAAGGGAI,TTGACTGTAATGTGCTATGTACGGTAA戶LTGGTTTTAJ,GTACTATGI’ACTGTTAAGGGTGGGTAGGTTTGTTGGT幻,CCTAGTGGGTGAGGGGTGGCTTTGGAGTTGCAGTTGATGTGTG川陜GTTGAAGGTTGGTTGCTGTACTTGCTTGTAAGCATGGGGGGGGGGTTTTGAl’『l’『l’TGG戶江,TGGGTTTTTATGTACCACAGGTGGTCAAGI’Al”l‘『1‘『l’『l,GGGACCCTACAA刀汀TCAI,GGGGGCTGGGA川rA產(chǎn)TGrl’ACAAAAAAC川rAACGGTTGTTGAI,GGGGGA戶L1,CAAAACTTGGGGGGGACCCAA產(chǎn)JTTGCTTCCCCTGAAAAAAAAAAA叨C陽(yáng)CS0‘0BD和G
青島大學(xué)碩士學(xué)位論文第3例舌癌癌組織IIVRI基因序列TCIT’IAGGCATCAGGC’ffl“fGGCCTGAAGTAGGAACCAGATGTCGGATACAGTTCAC‘l‘1JlAGCTACCCCCAAGTAGTTATGGGCCCGGAGCGAGGAGAGTAGCACTCTTGTGCGGGATATTGATTTCACGGAGGATGGTGGTCAAGGGACCCCTATCTGAGGGGGGTCATCCATGGGGACGAGAAGGGAI’l‘『l’GACTGTAATGTGCTATGTACGGTAAATGGC’l”l一1’ATGTACTATGTACTGTTAAGGGTGGGTAGGTTTGTTGGTATCCTAGTGGCTGAGGGGTGGCI一l’l,GGAGTTGCAGTTGATGTGTGATAGTTGAGGGTTGATTGCTGTACTTGCTTGTAAGCATGGGGGGGGGGGGTTGATAGGGGAA’l’1注,GGflffl一ffGCAACCACCGGGGGCCAAGGfffl一fl’GGGACCCGAACAAATTTCTGGGGGGCGGGGATTATGTTCCAAATTCCTTACCG’l一l一l’GTTGAGGGGGGAATAAAACCrFTGGGGGGCCCCCAAATTTGCTCTCCCCCAAAAAAAAAA90盯406080
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]乳腺癌中線粒體基因組D環(huán)區(qū)基因突變的研究[J]. 焦飛,常峰,馬穎,劉長(zhǎng)福,謝書陽(yáng). 濱州醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 2008(04)
[2]喉癌線粒體DNAD-loop高變區(qū)突變與臨床病理的相關(guān)性[J]. 楊登化,黃志剛,杜小燕,陳曉紅,許洪波,范爾鐘,李穎,楊征. 中國(guó)耳鼻咽喉頭頸外科. 2008(05)
[3]抑癌基因PTEN在線粒體上的定位促進(jìn)A431細(xì)胞的凋亡[J]. 岳曉婧,宋衛(wèi)東,姜學(xué)軍. 微生物學(xué)報(bào). 2007(06)
[4]急性粒細(xì)胞白血病線粒體基因組D-Loop區(qū)突變的研究[J]. 陸小軍,賈永前,范紅,賈勁,張磊. 中國(guó)實(shí)驗(yàn)診斷學(xué). 2007(06)
[5]肺癌細(xì)胞系線粒體DNA非編碼區(qū)序列變異研究[J]. 孫恒文,胡義德. 中國(guó)肺癌雜志. 2007(02)
[6]鼻咽癌患者組織及血液中線粒體DNAD-loop區(qū)突變[J]. 張楠,黃桂球,馬永忠,陳美珍. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2006(10)
[7]甲狀腺乳頭狀癌細(xì)胞線粒體DNAD環(huán)區(qū)的突變[J]. 孫團(tuán)起,吳毅,嵇慶海,邊建超,王卓穎. 中華耳鼻咽喉頭頸外科雜志. 2006(10)
[8]乳腺癌線粒體基因組控制區(qū)突變的研究[J]. 周云麗,牛瑞芳,史玉榮. 中華腫瘤防治雜志. 2006(14)
[9]合并慢性胰腺炎的胰腺癌癌旁增生性胰管上皮細(xì)胞線粒體DNA突變的意義[J]. 母德清,高麗杰,彭淑牖,李江濤,王國(guó)鳳. 中華腫瘤雜志. 2006(06)
[10]喉鱗狀細(xì)胞癌組織中線粒體基因4977bp缺失突變的檢測(cè)[J]. 韓月臣,孔維佳,張松,王彥君,王瑩,陳雄. 癌癥. 2004(11)
本文編號(hào):3501795
【文章來源】:青島大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
第2例癌旁組織HVRI區(qū)測(cè)序波形圖
青島大學(xué)碩士學(xué)位論文第2例正常組織HVRI基因序列GCTAGCAGGCAI…TAGGC『l’rl’『l’l,GGCCTGAAGTAGGAACCAGATGTCGG川叭CAGTTCACTTI’AGCTACCCCCAAGTGTTATGGGCCCGGAGCGAGGAGAGTAGCACTCTTGTGCGGGATATTGATTTCACGGAGGATGGTGGTCAAGGGACCCC1’A1,CTGAGGGGGGTCATCCAI,GGGGGCGAGAAGGGAI,TTGACTGTAATGTGCTATGTACGGTAA戶LTGGTTTTAJ,GTACTATGI’ACTGTTAAGGGTGGGTAGGTTTGTTGGT幻,CCTAGTGGGTGAGGGGTGGCTTTGGAGTTGCAGTTGATGTGTG川陜GTTGAAGGTTGGTTGCTGTACTTGCTTGTAAGCATGGGGGGGGGGTTTTGAl’『l’『l’TGG戶江,TGGGTTTTTATGTACCACAGGTGGTCAAGI’Al”l‘『1‘『l’『l,GGGACCCTACAA刀汀TCAI,GGGGGCTGGGA川rA產(chǎn)TGrl’ACAAAAAAC川rAACGGTTGTTGAI,GGGGGA戶L1,CAAAACTTGGGGGGGACCCAA產(chǎn)JTTGCTTCCCCTGAAAAAAAAAAA叨C陽(yáng)CS0‘0BD和G
青島大學(xué)碩士學(xué)位論文第3例舌癌癌組織IIVRI基因序列TCIT’IAGGCATCAGGC’ffl“fGGCCTGAAGTAGGAACCAGATGTCGGATACAGTTCAC‘l‘1JlAGCTACCCCCAAGTAGTTATGGGCCCGGAGCGAGGAGAGTAGCACTCTTGTGCGGGATATTGATTTCACGGAGGATGGTGGTCAAGGGACCCCTATCTGAGGGGGGTCATCCATGGGGACGAGAAGGGAI’l‘『l’GACTGTAATGTGCTATGTACGGTAAATGGC’l”l一1’ATGTACTATGTACTGTTAAGGGTGGGTAGGTTTGTTGGTATCCTAGTGGCTGAGGGGTGGCI一l’l,GGAGTTGCAGTTGATGTGTGATAGTTGAGGGTTGATTGCTGTACTTGCTTGTAAGCATGGGGGGGGGGGGTTGATAGGGGAA’l’1注,GGflffl一ffGCAACCACCGGGGGCCAAGGfffl一fl’GGGACCCGAACAAATTTCTGGGGGGCGGGGATTATGTTCCAAATTCCTTACCG’l一l一l’GTTGAGGGGGGAATAAAACCrFTGGGGGGCCCCCAAATTTGCTCTCCCCCAAAAAAAAAA90盯406080
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]乳腺癌中線粒體基因組D環(huán)區(qū)基因突變的研究[J]. 焦飛,常峰,馬穎,劉長(zhǎng)福,謝書陽(yáng). 濱州醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 2008(04)
[2]喉癌線粒體DNAD-loop高變區(qū)突變與臨床病理的相關(guān)性[J]. 楊登化,黃志剛,杜小燕,陳曉紅,許洪波,范爾鐘,李穎,楊征. 中國(guó)耳鼻咽喉頭頸外科. 2008(05)
[3]抑癌基因PTEN在線粒體上的定位促進(jìn)A431細(xì)胞的凋亡[J]. 岳曉婧,宋衛(wèi)東,姜學(xué)軍. 微生物學(xué)報(bào). 2007(06)
[4]急性粒細(xì)胞白血病線粒體基因組D-Loop區(qū)突變的研究[J]. 陸小軍,賈永前,范紅,賈勁,張磊. 中國(guó)實(shí)驗(yàn)診斷學(xué). 2007(06)
[5]肺癌細(xì)胞系線粒體DNA非編碼區(qū)序列變異研究[J]. 孫恒文,胡義德. 中國(guó)肺癌雜志. 2007(02)
[6]鼻咽癌患者組織及血液中線粒體DNAD-loop區(qū)突變[J]. 張楠,黃桂球,馬永忠,陳美珍. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2006(10)
[7]甲狀腺乳頭狀癌細(xì)胞線粒體DNAD環(huán)區(qū)的突變[J]. 孫團(tuán)起,吳毅,嵇慶海,邊建超,王卓穎. 中華耳鼻咽喉頭頸外科雜志. 2006(10)
[8]乳腺癌線粒體基因組控制區(qū)突變的研究[J]. 周云麗,牛瑞芳,史玉榮. 中華腫瘤防治雜志. 2006(14)
[9]合并慢性胰腺炎的胰腺癌癌旁增生性胰管上皮細(xì)胞線粒體DNA突變的意義[J]. 母德清,高麗杰,彭淑牖,李江濤,王國(guó)鳳. 中華腫瘤雜志. 2006(06)
[10]喉鱗狀細(xì)胞癌組織中線粒體基因4977bp缺失突變的檢測(cè)[J]. 韓月臣,孔維佳,張松,王彥君,王瑩,陳雄. 癌癥. 2004(11)
本文編號(hào):3501795
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