目的:通過宏基因組方法結(jié)合高通量測序技術(shù)探究牙周炎患者口腔微生物菌群的組成和功能,及其與牙周炎發(fā)生發(fā)展的相關(guān)性。方法:分別采集10名牙周炎患者的唾液和齦下菌斑樣本,并提取各樣本中微生物總DNA,構(gòu)建宏基因組文庫,進(jìn)行MGISEQ-2000測序,分別使用Metaphlan2軟件、Humann2軟件進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果:微生物組成分析結(jié)果顯示,在屬水平上,卟啉單胞菌屬在唾液及齦下樣本組中的平均相對豐度無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（P>0.05）;普雷沃氏菌屬、噬二氧化碳細(xì)胞菌屬等的相對豐度在兩樣本組中具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（P<0.05）。在種水平上,副流感嗜血桿菌、淺黃奈瑟球菌等在兩樣本組中相對豐度差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P<0.05）。功能分析結(jié)果顯示,唾液和齦下菌斑樣本中貢獻(xiàn)菌和序列的相對豐度具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（P<0.05）。結(jié)論:齦下微生物樣本對于牙周炎致病菌方面的研究可能更具代表性,利用宏基因組學(xué)研究與牙周炎疾病相關(guān)的代謝通路值得進(jìn)一步發(fā)展。 

【文章來源】：口腔生物醫(yī)學(xué). 2020,11(04)

【文章頁數(shù)】：4 頁

【部分圖文】：

牙周炎患者唾液及齦下菌斑微生物組成物種豐度熱圖

對比通路豐度數(shù)據(jù)庫得出豐度較高的為輔A代謝通路(coenzyme A pathway,COA-PWY)。根據(jù)牙周炎患者口腔微生物樣本測得的數(shù)據(jù)，在微生物菌種及序列水平上進(jìn)行微生物功能分析，基于觀察COA-PWY繪制基因豐度柱狀圖，樣本中各貢獻(xiàn)菌或序列的相對豐度情況見圖2。T.forsythia、聚核梭桿菌(Fusobacterium nucleatum,F.nucleatum)、中間普雷沃氏菌(Prevotella intermedia,P.intermedia)、丙酸桿菌(Propionibacterium propionicum,P.propionicum)為COA-PWY的主要貢獻(xiàn)菌種。其中，T.forsythia是紅色復(fù)合體的重要成員，其相對豐度最高。唾液及齦下菌斑中貢獻(xiàn)菌和序列的相對豐度具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P<0.05)。3 討論

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]抑郁癥患者腸道菌群豐度和種類及基因功能通路的病例對照研究[J]. 榮晗,徐丹,劉鐵榜,王明幫,趙杰,劉泱慧,楊海晨,張建.  中華精神科雜志. 2017 (03)
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本文編號：3441164