【目的】NOTCH基因在進化過程中高度保守并在機體發(fā)育過程中發(fā)揮著重要的作用。NOTCH在腫瘤中的作用較為復雜,既可發(fā)揮癌基因的作用也可發(fā)揮抑癌基因的功能。在頭頸癌中,NOTCH的功能仍不清楚。最近有文獻報道了NOTCH在頭頸癌中突變率僅次于TP53,高達到15-20%,同時推測NOTCH在頭頸癌中可能以抑癌基因的形式存在。這與急性淋巴細胞白血病中NOTCH的突變類型截然不同。考慮到NOTCH在白種人頭頸癌中較高的突變率,以及不同人種基因型可能存在的差異,本實驗首次以頭頸癌中較為常見的口腔黏膜鱗狀細胞癌（口腔鱗癌）為研究對象研究中國人群口腔鱗癌中NOTCH1基因的突變情況,以了解中西方不同種族口腔鱗癌中NOTCH1基因突變的差異。另外,由于文獻報道NOTCH信號通路的重要調控蛋白PRESENILIN1（PS1）可以負調控表皮生長因子受體（EGFR）,因此有必要研究PS1在口腔鱗癌中的表達及其與EGFR之間的關系�！痉椒ā�1:從51例口腔鱗狀細胞癌及其中46例匹配的正常組織的石蠟包埋組織中獲取基因組DNA,應用Ion-Torrent平臺行NOTCH1及TP53基因的全外顯子測序。2:分析... 

【文章來源】：上海交通大學上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

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【學位級別】：博士

【部分圖文】：

人NOTCH1結構示意圖

圖 2. NOTCH 信號通路33NOTCH signaling pathway331.3 NOTCH 通路的信號轉導過程現(xiàn)有研究認為，經(jīng)典的 NOTCH 信號途徑的活化主要包括三步蛋白裂解過程（2）。無活性的 NOTCH 前體蛋白在核糖體中合成后，在向胞膜轉運的過程中，在 位點被 FURIN 樣變構酶切割成兩個部分34：一個 180 kD 含絕大多數(shù)胞外部分的片段和一個 120 kD 含跨膜區(qū)和胞內部分的片段。兩部分通過非共價鍵連接為異二聚體，表達在胞膜上。與相鄰細胞表面的配體結合后，異二聚體在 S2 位點被金屬蛋酶ADAM切割35，胞外部分被胞吞作用產生的機械力拖動到表達配體的鄰近細胞中剩余部分進一步在跨膜區(qū) S3 位點被以早老素（PRESENILIN）依賴的 γ-分泌酶(γ-secretase) 切割，釋放 NICD 進入核內26, 36。經(jīng)典的 NOTCH 信號通路又稱為RBP-Jκ 依賴途徑。在沒有 NICD 存在的時候，RBP-Jκ 本身是一個轉錄抑制因子，能夠特異性地與某些 DNA 序列相結合37, 38，結合后募集一些蛋白如 HDAC 和 SMR

ent 個人化操作基因組測序儀 (PGM )-Life Tech (appigure 3. Ion Torrent (PGM )-Life Tech (applied biosyste(http://www.instrument.com.cn/netshow/C129942.htm)NA 聚合酶將一個核苷酸加入到 DNA 分子中時被檢測的 pH 值的變化。每個 Ion-Torrent 半導個 DNA 分子的拷貝。Ion-PGM 測序儀按照一序。在一個特定的微孔中，如果模板 DNA 分微孔就會釋放出一個氫離子。然后溶液的 pH上可以直接將該化學信號轉變?yōu)閿?shù)字信號。如可以檢測到雙倍的電壓，芯片上會相應地記錄個核苷酸與微芯片流的核苷酸不匹配，則檢測因該法是直接檢測 DNA 的 合成，不需要掃描


本文編號：3251122