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口腔鱗狀細(xì)胞癌外泌體差異表達(dá)mRNA生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-06-22 05:44
  目的利用轉(zhuǎn)錄組分析口腔鱗狀細(xì)胞癌細(xì)胞(Oral squamous cell cancer cells,OSCC)外泌體與正?谇簧掀ぜ(xì)胞(Human immortalized oral epithelial cell,HOEC)外泌體mRNA之間的表達(dá)差異,為解析口腔鱗狀細(xì)胞癌的發(fā)生和發(fā)展機(jī)制奠定基礎(chǔ)。方法利用高通量測(cè)序技術(shù)檢測(cè)CAL-27和HOEC外泌體mRNA表達(dá)譜,篩選出差異mRNA,對(duì)差異mRNA進(jìn)行GO(Gene Ontoloty)注釋和KEGG富集。結(jié)果在CAL-27細(xì)胞外泌體中鑒定到44699個(gè)mRNA,在HOEC細(xì)胞外泌體中鑒定到44761個(gè)mRNA,其中,差異表達(dá)的mRNA共471條(234個(gè)上調(diào),237個(gè)下調(diào))。生物信息學(xué)分析表明上述差異表達(dá)的mRNA參與了口腔癌的生物學(xué)調(diào)節(jié)功能和通路。結(jié)論口腔鱗癌細(xì)胞及口腔上皮細(xì)胞均能產(chǎn)生豐富的外泌體;口腔鱗狀細(xì)胞癌細(xì)胞外泌體與正常口腔上皮細(xì)胞外泌體間mRNA表達(dá)譜存在較大差異,差異表達(dá)的mRNA在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展及轉(zhuǎn)移過程中可能有重要作用。 

【文章來源】:蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:44 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

口腔鱗狀細(xì)胞癌外泌體差異表達(dá)mRNA生物信息學(xué)分析


外泌體電鏡圖(30000)

特異性,細(xì)胞外,體表,電鏡


圖 2-2 外泌體電鏡圖( 30000)Fig 2-2 The graph of electron microscopyern blot 測(cè)定外泌體表面特異性分子標(biāo)志實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,CAL-27 細(xì)胞和 HOEC 細(xì)胞外泌體表達(dá)如圖 2-3 所示),進(jìn)一步證明提取的物質(zhì)為外泌體。

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蘭州大學(xué)碩士研究生論文 口腔鱗狀細(xì)胞癌外泌體差異表達(dá) mRNA 生物信息學(xué)分析mRNA(|Log2FoldChange|>2.0),但其中 SERPINS、RHOD 和 RHOB 在文獻(xiàn)中提及與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展有關(guān),所以特別列出。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[7]根管治療診間疼痛的原因分析[J]. 許海軍,潘冬梅.  口腔醫(yī)學(xué). 2011(12)
[8]從微生物學(xué)角度思考感染根管的治療[J]. 劉正.  上?谇会t(yī)學(xué). 2007(05)
[9]口腔頜面部惡性腫瘤根治術(shù)后腭護(hù)板修復(fù)——附60例分析[J]. 羅玉俠,史惠華.  北京口腔醫(yī)學(xué). 1997(03)



本文編號(hào):3242245

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