目的通過生物信息學(xué)篩選并建立與口腔鱗狀細(xì)胞癌（OSCC）患者預(yù)后相關(guān)的微小RNA（miRNA）預(yù)后模型,以期對OSCC患者進(jìn)行精準(zhǔn)的分組,提高治療的針對性。方法通過癌癥基因組圖譜（TCGA）數(shù)據(jù)庫下載OSCC患者的miRNA、mRNA表達(dá)譜和臨床數(shù)據(jù)。采用單因素和多因素Cox風(fēng)險(xiǎn)回歸分析篩選和建立miRNA預(yù)后模型。受試者工作特征曲線（ROC）和曲線下面積（AUC）檢驗(yàn)預(yù)后模型的性能。預(yù)測6-miRNAs靶基因,與差異mRNA取交集后行基因本體論（GO）、京都基因與基因組百科全書（KEGG）信號通路富集分析。構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò)（PPI）篩選中樞基因。結(jié)果通過單因素和多因素Cox回歸分析得到基于6個(gè)miRNA的預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)模型。train組、test組和所有樣品組中預(yù)測5年生存率的ROC曲線下AUC值分別為0.757、0.673、0.724。單因素和多因素Cox回歸分析顯示,6-miRNAs預(yù)后模型可以作為一個(gè)獨(dú)立的預(yù)后因素（P<0.001）。靶基因構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)中前10個(gè)中樞基因?yàn)镃CNB1、EGF、KIF23、MCM10、ITGAV、MELK、PLK4、ADCY2、CENPF、TRI... 

【文章來源】：華西口腔醫(yī)學(xué)雜志. 2020,38(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

生存曲線

對348個(gè)靶基因進(jìn)行GO注釋。與生物學(xué)過程（bio-logical process,BP）、細(xì)胞組分（cellular component,CC）和分子功能（molecular function,MF）相關(guān)的前15個(gè)注釋結(jié)果繪成圖。富集結(jié)果中BP主要包括跨突觸信號調(diào)節(jié)、化學(xué)突觸傳遞調(diào)節(jié)和突觸組織，CC主要包括突觸膜、突觸前膜和谷氨酸能突觸，MF主要包括細(xì)胞外基質(zhì)結(jié)構(gòu)組成、DNA結(jié)合轉(zhuǎn)錄激活活性和特異性RNA聚合酶Ⅱ、生長因子活性。KEGG通路富集集中在致心律失常性右室心肌�。╝rrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy,ARVC）和細(xì)胞黏附分子（cell adhesion molecule,CAM）上（P<0.05,q<0.05）。圖3 高低風(fēng)險(xiǎn)組患者生存狀態(tài)

高低風(fēng)險(xiǎn)組患者生存狀態(tài)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Linc00460通過下調(diào)miR-654-3p在食管癌中發(fā)揮促癌作用[J]. 楊振威,趙倩,莊坤,韓坤,和水祥,劉亞萍.  西安交通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2019(06)
[2]The recurrence and survival of oral squamous cell carcinoma: a report of 275 cases[J]. Bo Wang,Shu Zhang,Kai Yue,Xu-Dong Wang.  Chinese Journal of Cancer. 2013(11)

博士論文
[1]microRNA-379-5p在膀胱癌中的表達(dá)、功能及其相關(guān)機(jī)制的研究[D]. 吳德堯.南京醫(yī)科大學(xué) 2017



本文編號：3239737