研究背景:作為最常見的口腔疾病之一,齲病的病因?qū)W與防治一直是重要研究領(lǐng)域。隨著社會人口的老齡化,老年人群中齲病的發(fā)病率逐年上升,老年人齲病的病因?qū)W研究、風(fēng)險因素評估及預(yù)防越來越多地受到關(guān)注�？谇粌�(nèi)含有大量微生物,并與齲病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),而目前關(guān)于老年人齲病的微生物組學(xué)研究相對較少且尚存爭議。目的:通過研究老年人不同齲病狀態(tài)下口腔微生物多樣性及群落結(jié)構(gòu)變化,了解包括細(xì)菌和真菌在內(nèi)的老年人齲病的相關(guān)致病微生物,進(jìn)一步探究冠齲與根齲在病程進(jìn)展過程中的微生物結(jié)構(gòu)變化差異,為老年人齲病的病因探究以及預(yù)警和防治提供依據(jù)。方法:在重慶市老年人群中選取符合納入標(biāo)準(zhǔn)的研究對象,包括冠齲患者、根齲患者和無齲者各25人。采集齦上菌斑和齲損組織,將樣本分別標(biāo)記為H組（健康組）、CH組（冠齲健康牙面組）、CC組（冠齲齲損組）、RH組（根齲健康牙面組）、RC組（根齲齲損組）五組,提取各樣本總DNA后分別針對細(xì)菌和真菌設(shè)計引物并進(jìn)行PCR擴(kuò)增,運(yùn)用Illumina MiSeq高通量測序技術(shù)測序,利用QIIME、Mothur、PICRUSt、SPSS等軟件進(jìn)行微生物群落結(jié)構(gòu)及多樣性分析。結(jié)果:1、細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)分析... 

【文章來源】：重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市

【文章頁數(shù)】：59 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

稀釋曲線Figure1Shannoncurves

.1.3 細(xì)菌種類及相對豐度所有樣本門水平和屬水平上的細(xì)菌種類及其相對豐度如圖 2，橫坐標(biāo)為組坐標(biāo)為物種在該樣本中所占的比例，不同顏色的柱狀體代表不同的物種分類長短代表該物種在總體中所占比例的大小。從圖中可以看出各組樣本的細(xì)菌基本類似，但相對豐度有所不同。優(yōu)勢菌門包括厚壁菌門（Firmicutes，27%）、放線菌門（Actinobacteria，24%）桿菌門（Bacteroidetes，17%）、變形菌門（Proteobacteria，15%）、梭桿菌Fusobacteria，12%）和 TM7 菌門（Saccharibacteria，5%），這些優(yōu)勢菌門占測出的細(xì)菌總量的 98.4%。優(yōu)勢菌屬主要有放線菌（Actinomyces，11%）、鏈球菌（Streptococcus，11%）毛菌（Leptotrichia，9%）、奈瑟菌（Neisseria，8%）、普氏菌（Prevotella_7%）、韋榮球菌（Veillonella，6%），約占細(xì)菌總量的 50%。

圖 2-2 屬水平的細(xì)菌群落組成Figure 2-2 Community composition at genus level用 Kruskal-Wallis H 檢驗進(jìn)行組間顯著性差異檢驗，結(jié)果如圖 3，縱軸表示某 分類水平下的物種名，物種對應(yīng)的柱形長度表示該物種在各樣本組中的平均相對豐度，不同顏色代表不同分組。最右邊的數(shù)值為 P 值，0.01 < P ≤ 0.05 標(biāo)記*，0.001 < P ≤ 0.01 標(biāo)記**，P ≤ 0.001 標(biāo)記***。在門水平上，比較 H、CH、C三組，可見隨著冠齲的發(fā)展，放線菌門的豐度增加，而擬桿菌門豐度降低。對 H、RH、RC 三組進(jìn)行比較，結(jié)果顯示隨著根齲發(fā)展，放線菌門和厚壁菌門豐度增加，而梭桿菌門、變形菌門和擬桿菌門的豐度均降低。同樣地，在屬水平上進(jìn)行比較，可以發(fā)現(xiàn)冠齲發(fā)展過程中放線菌、棒狀桿菌、丙酸桿菌的豐度增加，梭桿菌、普氏菌的豐度降低。而根齲發(fā)展過程中，放線菌、鏈球菌、丙酸桿菌豐度增加，纖毛菌、奈瑟菌、梭桿菌和二氧化碳噬纖維菌豐度降低。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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