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中國(guó)Treacher Collins綜合征病例表型分析和遺傳學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2021-03-02 02:07
  背景:Treacher Collins綜合征是一種先天性顱面部畸形,患者間表型變異大,表型-遺傳性之間的關(guān)系尚不明確。目前普遍認(rèn)為本病與成熟核糖體生成不足、氧化應(yīng)激、p53激活等使神經(jīng)嵴細(xì)胞數(shù)目減少有關(guān)。至今共發(fā)現(xiàn)TCOF1、POLR1D、POLR1C三個(gè)致病基因,但仍有部分患者無法明確致病性基因,且針對(duì)中國(guó)患者表型特點(diǎn)及分子遺傳學(xué)機(jī)制的探索較少。目的:通過分析8例TCS患者及其2位正常家庭成員共10人的臨床資料、利用全外顯子測(cè)序技術(shù)進(jìn)行致病基因鑒定并總結(jié)基因型-表型之間的關(guān)系,了解中國(guó)TCS患者特點(diǎn),豐富中國(guó)TCS表型譜和致病基因突變庫(kù),并嘗試尋找基因型-表型之間的關(guān)系,為進(jìn)一步探索TCS致病機(jī)制提供思路。方法:1.表型分析:2017年11月至2018年3月,收集于我院就診的3個(gè)TCS家系,2個(gè)散發(fā)病例共 10 人,分別為:T3720160105、T3720160105-1、T3720160105-2,T3720170113、T3720170113-1、T3720170113-2,T1020180330、T1020180330-2,T2220150810及T1020160503,與所... 

【文章來源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】:60 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

中國(guó)Treacher Collins綜合征病例表型分析和遺傳學(xué)研究


圖1.三個(gè)家系TCS患者的面部畸形正面圖

建庫(kù)流程,外顯子,測(cè)序,文庫(kù)


圖5.全外顯子測(cè)序建庫(kù)流程。(圖片來自北京諾禾OCOOC?O?????????OOOOC?OOG#n?ooooc?0jswih?\JMniShtwON?A?ff?gmtntt?ptir?ptat?oil—siD?to?2Bd?bptftds??Bi*int?eodt^?frf?m?nu?w>th?S*?photphorylated?.od丨??Add?IU?fH>vir??nd?dATP??-ZEEi^iaL.-CXXXX5二r—_?轉(zhuǎn)Aitotrtof?—??rHh?WAMPwi??XP?bt*tf?purtficatifrftR#rr>〇v?l?of?unl^galed?adaptors?^^^OCCC'—.■一_?.卿>-->?〇〇〇W?oopcnAftkSw.s^wctPi-w?〇〇000???n4?Sur?S?Wcl?Pf??capUirt?**>.'.?c????j?.??fUwrM?PCR?prwiMrt?^***^二2)捕獲、富集:帶有特異index的文庫(kù)pooling后

測(cè)序,覆蓋度,堿基比,樣本


表2顯示了?8例患者樣本測(cè)序深度及覆蓋度結(jié)果,可見所有檢測(cè)結(jié)果的測(cè)序??深度和覆蓋度都符合分析要求。??圖10.T1020160503樣本的測(cè)序深度(圖A和圖B)、覆蓋度分布(圖C)。??000%?*????????■■■■■■??〇%?*?*?,-????0?too?X0?100?400?M0????o?*〇〇*??〇??*〇〇■???■蜃篇囂?_■蓽??_[??t?2?3?4?S?拿???雖???’0?11?1}??J?(4?li?U?tt?1????t?27?X?v??I?I??-21-??


本文編號(hào):3058403

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