變形鏈球菌（Streptococcusmutans）是革蘭氏陽性的兼性厭氧菌，是口腔主要的致齲細(xì)菌之一。變形鏈球菌通過在牙表面粘附，利用口腔中的食物殘渣產(chǎn)酸，導(dǎo)致牙表面脫礦，而變形鏈球菌本身可以適應(yīng)這種酸性環(huán)境。變形鏈球菌利用食物中的葡萄糖產(chǎn)酸，利用蔗糖合成胞外多糖進(jìn)行粘附。對于變形鏈球菌的環(huán)境適應(yīng)及毒力相關(guān)基因有大量研究，但是調(diào)控機制并不完全清楚。細(xì)菌非編碼RNA（smallnon-codingRNA，sRNA）是近年來的研究熱點，目前對細(xì)菌的sRNA研究主要采用生物信息學(xué)預(yù)測與實驗學(xué)方法驗證相結(jié)合的手段。在細(xì)菌中，sRNA可以隨著生長和環(huán)境的改變，如不同的氧氣、溫度、滲透壓、pH值等發(fā)生變化。sRNA也與細(xì)菌的毒力表達(dá)密切相關(guān)，如細(xì)菌的致病性、耐藥性等。sRNA還有廣泛的應(yīng)用前景，如用sRNA作為致病微生物的診斷標(biāo)志物；用改性肽核酸（PNAS）--sRNA的反義試劑，作為微生物感染的替代療法等。本研究的第一部分通過4種生物信息學(xué)預(yù)測的方法，對變形鏈球菌UA159基因組進(jìn)行系統(tǒng)分析，預(yù)測得到變形鏈球菌中的sRNA共334條，其中40條至少由兩種方法預(yù)測得到。針對這40條序列，采用RT... 

【文章來源】：中國人民解放軍醫(yī)學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】：79 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
縮略語表
中文摘要
Abstract
前言
第一部分 變形鏈球菌非編碼 RNA 生物信息學(xué)預(yù)測及初步篩選
    1 材料與方法
    2 實驗結(jié)果
    3 討論
    4 結(jié)論
第二部分 變形鏈球菌非編碼 RNA--L10-Leader 的鑒定及檢測
    實驗一 變形鏈球菌 UA159 非編碼 RNA--L10-Leader 的鑒定
        1 材料與方法
        2 實驗結(jié)果
        3 討論
    實驗二 變形鏈球菌不同臨床分離株非編碼 RNA--L10-Leader 的表達(dá)
        1 材料與方法
        2 實驗結(jié)果
        3 討論
    實驗三 不同生長條件下變形鏈球菌非編碼 RNA--L10-Leader 的表達(dá)
        1 材料與方法
        2 實驗結(jié)果
        3 討論
    實驗四 變形鏈球菌非編碼 RNA--L10-Leader靶mRNA 的生物信息學(xué)預(yù)測及檢測
        1 材料與方法
        2 實驗結(jié)果
        3 討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
文獻(xiàn)綜述
    參考文獻(xiàn)
致謝
個人簡歷


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于轉(zhuǎn)錄終點序列特征預(yù)測大腸桿菌sRNA[J]. 劉倩,應(yīng)曉敏,吳佳瑤,查磊,李伍舉.  生物物理學(xué)報. 2011(03)
[2]非編碼小RNA（sraB）調(diào)控腸炎型沙門菌的抗蛋清抑菌作用[J]. 蔣惠源,曹鳴輝,曹學(xué)松,顧宏偉,曾科.  微生物學(xué)報. 2010(11)
[3]變異鏈球菌luxS基因?qū)ρ谰呱锬ば纬傻挠绊懷芯縖J]. 童忠春,倪龍興,馬麗芳,周琳,侯波,趙秀.  華西口腔醫(yī)學(xué)雜志. 2009(04)
[4]LuxS基因缺失的變形鏈球菌突變株的構(gòu)建及鑒定[J]. 于丹妮,韓福勝,韓玉植,陳杰.  中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2008 (03)



本文編號：3056401