16SrRNA克隆文庫法分析裕固族齲病和牙周病口腔微生物
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【摘要】:研究背景; 齲病和牙周病是多種微生物引起的口腔內(nèi)軟硬組織的慢性破壞性疾病?谇晃⑸锉粡V泛認為在牙周病和齲病的發(fā)病機制中起到重要作用,但復(fù)雜的微生物群落結(jié)構(gòu)和生態(tài)的確切作用仍有待完全建立。流行病學調(diào)查表明甘肅特有少數(shù)民族裕固族齲病和牙周病患病率高于其他少數(shù)民族。 目的; 使用16SrRNA基因克隆文庫鑒別及分析裕固族牙周病和齲病微生物多樣性。 方法; 裕固族齲病和牙周病患者含漱法采取唾液樣本被用于建立16SrRNA基因克隆獲取唾液中微生物總DNA,用16SrRNA通用引物擴增、回收、連接、轉(zhuǎn)化、建立16SrRNA克隆文庫及篩選,NCBI BLAST數(shù)據(jù)庫序列對比找出已知相似性序列。用CExpress, Blast, Clustal, Treeview, seaview, Mega, Bioedit, mothur等軟件進行系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建。 結(jié)果; 克隆文庫序列在NCBI BLAST數(shù)據(jù)庫序列對比齲病20個克隆牙周病80個克隆序列。mothur軟件對齲病克隆文庫序列分析分為4個OTU。文庫coverage值為90%,shanon-winner指數(shù)多樣性指數(shù)1.56。通過mothur軟件對牙周病克隆文庫80個克隆子進行序列分析分為18個OTU,文庫coverage值為76%,shanon-winner指數(shù)多樣性指數(shù)2.42。 結(jié)論; 使用16SrRNA基因克隆文庫分析裕固族牙周病和齲病微生物多樣性。通過建立系統(tǒng)發(fā)育樹親緣關(guān)系擬分析出來齲病19種牙周病24種菌株及種屬。本研究只做疾病樣本微生物的分析沒有對照健康和疾病之間的區(qū)別,需要用更多的樣品探索齲病和牙周病微生物群落的多樣性。
【關(guān)鍵詞】:齲病 牙周病 口腔微生物 16srRNA基因克隆文庫
【學位授予單位】:蘭州大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R781.1;R781.4
【目錄】:
- 中文摘要3-5
- Abstract5-8
- 前言8-12
- 第一部分 利用16srRNA基因克隆文庫分析裕固族齲病相關(guān)的微生物12-22
- 1.1 主要材料和試驗器材12-14
- 1.2 臨床檢查14-15
- 1.3 樣本采集及處理15
- 1.4 試驗方法15-19
- 1.5 結(jié)果與小結(jié)19-22
- 第二部分 利用16srRNA基因克隆文庫分析裕固族牙周病相關(guān)的微生物22-30
- 2.1 樣本采集及處理22
- 2.2 試驗方法22-26
- 2.3 結(jié)果和小結(jié)26-30
- 討論30-32
- 結(jié)論32
- 展望32-33
- 參考文獻33-36
- 在學期間的研究成果36-37
- 致謝37-38
- 綜述38-48
- 參考文獻44-48
- 病例匯報48-53
【共引文獻】
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本文關(guān)鍵詞:16SrRNA克隆文庫法分析裕固族齲病和牙周病口腔微生物,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
,本文編號:271464
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