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金黃地鼠頰癌差異表達(dá)基因譜的構(gòu)建及相關(guān)生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2020-05-12 02:11
【摘要】: 口腔頜面部癌在全身惡性腫瘤中排名第6位,且有逐年上升趨勢(shì),在口腔頜面部癌中90%為口腔鱗狀細(xì)胞癌(Oral squamous cell carcinoma,OSCC),雖然目前人們對(duì)OSCC的診療有了長(zhǎng)足的進(jìn)步,但由于對(duì)病變發(fā)生發(fā)展過程中的機(jī)制仍未充分認(rèn)識(shí),使得臨床治療效果仍未取得明顯改變。目前公認(rèn):癌癥的發(fā)生發(fā)展是一個(gè)多基因改變和多步驟變化的連續(xù)動(dòng)態(tài)過程。目前人們通過臨床和相關(guān)研究已證實(shí):口腔粘膜癌變初步過程是由正?谇徽衬ど掀ぁ衬ど掀ぎ惓T錾谇击[癌的連續(xù)動(dòng)態(tài)變化過程,在這癌變過程中涉及多基因和多通路的改變,但目前還未查見從全基因組水平對(duì)口腔粘膜癌變相關(guān)重要致病基因和信號(hào)通路異常的篩選的研究報(bào)道。 本研究用DMBA誘導(dǎo)敘利亞金黃地鼠頰囊粘膜癌變建立金黃地鼠頰囊粘膜癌變模型,然后用包含41000條基因/ESTs的Agilent全基因表達(dá)譜芯片分析金黃地鼠頰囊粘膜癌變的差異表達(dá)基因,發(fā)現(xiàn)在兩組間差異表達(dá)基因共有1943條,結(jié)合GO功能分類分析發(fā)現(xiàn)這些差異表達(dá)基因涉及到凋亡和腫瘤相關(guān)基因、結(jié)構(gòu)分子相關(guān)基因、代謝相關(guān)基因、信號(hào)傳導(dǎo)相關(guān)基因等10類相關(guān)基因。pathway通路分析發(fā)現(xiàn)共得到27條有顯著性改變的通路,以上1943條差異表達(dá)基因中只有136條基因在這27條通路上富集,我們認(rèn)為這136條差異表達(dá)基因的改變是最終導(dǎo)致口腔頰粘膜癌變的重要候選基因。在這136條重要候選基因中有13條基因富集在3條以上改變的通路上。 因此我們認(rèn)為以上13條基因是金黃地鼠頰粘膜癌變的重要基因,針對(duì)以上重要基因的深入研究,將為揭示口腔粘膜癌變的分子機(jī)制和靶向治療提供有效的方法。
【圖文】:

頰囊,肉眼,改圖


圖 1 DMBA 涂擦頰囊 1-2 周時(shí)的肉眼改變 圖 2 DMBA 涂擦頰囊 3-4 周時(shí)的肉眼改圖 3 DMBA 涂擦頰囊 5-6 周時(shí)的肉眼改變 圖 4 DMBA 涂擦頰囊 7-8 周時(shí)的肉眼改

頰囊,肉眼,改圖


圖 1 DMBA 涂擦頰囊 1-2 周時(shí)的肉眼改變 圖 2 DMBA 涂擦頰囊 3-4 周時(shí)的肉眼改圖 3 DMBA 涂擦頰囊 5-6 周時(shí)的肉眼改變 圖 4 DMBA 涂擦頰囊 7-8 周時(shí)的肉眼改
【學(xué)位授予單位】:重慶醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2010
【分類號(hào)】:R739.8

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前3條

1 肖靜;王學(xué)楓;徐辰武;;基于DNA微陣列數(shù)據(jù)的基因聚類方法[J];生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)雜志;2008年03期

2 彭亦良;梁后杰;;癌細(xì)胞運(yùn)動(dòng)與遷移的分子機(jī)制[J];中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào);2006年10期

3 ;Gene expression profiles of hepatoma cell line HLE[J];World Journal of Gastroenterology;2003年04期

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本文編號(hào):2659458

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