【摘要】：目的:非綜合征型唇腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)是我國最常見的先天畸形之一,發(fā)病率高達(dá)1/700,已躍居我國出生缺陷前列。其發(fā)病機(jī)制是遺傳、環(huán)境及二者間的相互作用的結(jié)果。根據(jù)首次對中國人群非綜合征型唇腭裂進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)研究的成果,一個新的關(guān)鍵位點rs8049367(該位點位于染色體區(qū)域16p13.3),以及四個位于1q32.2、10q25.3、17p13.1和20q12染色體區(qū)域的已知位點與中國人NSCL/P發(fā)病有密切關(guān)系。但是這些結(jié)果尚未得到驗證,由于非綜合征型唇腭裂具有遺傳異質(zhì)性,存在人種和地域的差異,不同地區(qū)及不同表型的患者,候選基因均可能存在差異。本研究即選取這5個易感區(qū)域中的代表性單核苷酸多態(tài)位點1q32.2(rs2235371),10q25.3(rs7078160),16p13.3(rs8049367),17p13.1(rs4791774)和20q12(rs13041247),在黔北漢族人群中進(jìn)行驗證,同時初步檢測黔北漢族人群NSCL/P遺傳背景的獨特性。方法:本研究共收集了完整的病例組核心家系(包括患兒及父母雙親)共100例,包括75例CL/P患兒和25例CPO患兒,總計300份樣本;同時收集了對照組核心家系(包括患兒及父母雙親)共60例,總計180份樣本。對樣本提取DNA,采用PCR擴(kuò)增,二代測序方法對易感位點進(jìn)行測序,采用Chromas序列讀取軟件和MEGA X序列分析軟件進(jìn)行基因分型。進(jìn)行病例對照分析,Hardy-Weinberg平衡檢驗,并對病例組核心家系進(jìn)行傳遞不平衡檢驗(transmission disequilibrium test,TDT)和單體型相對危險度(haplotype-based haplotype relative risk,HHRR)分析。結(jié)果:1.染色體1q32.2區(qū)域的rs2235371位點基因型與等位基因頻率與對照組子代比較無統(tǒng)計學(xué)差異(P=0.34,P=0.48;P=0.50,P=0.28;P=0.66,P=0.88),母親(CT+TT)基因型相對于CC基因型的OR值及95%CI值是(OR=0.48,95%CI:0.24~0.97),說明母親攜帶T基因可降低子代NSCL/P患病風(fēng)險。2.染色體10q25.3區(qū)域的rs7078160位點在本研究人群的CL/P組中基因型與等位基因頻率與對照組子代比較存在統(tǒng)計學(xué)差異(P=0.04,P=0.03)。CPO組與對照組子代比較均無統(tǒng)計學(xué)差異(P=0.60,P=0.43)。3.染色體16p13.3區(qū)域的rs8049367位點病例組子代基因型頻率與對照組子代比較存在統(tǒng)計學(xué)差異(P=0.04)。CL/P組、CPO組基因型頻率與對照組子代比較不存在統(tǒng)計學(xué)差異(P=0.06,P=0.11)。4.染色體17p13.1區(qū)域的rs4791774位點基因型與等位基因頻率與對照組子代比較無統(tǒng)計學(xué)差異(P=0.86,P=0.62;P=0.45,P=0.94;P=0.28,P=0.67)。5.染色體20q12區(qū)域的rs13041247位點基因型與等位基因頻率與對照組子代比較無統(tǒng)計學(xué)差異(P=0.24,P=0.72;P=0.68,P=0.59;P=0.52,P=0.93),病例組母親與對照組母親的基因型頻率存在統(tǒng)計學(xué)差異(P=0.03),其等位基因頻率與對照組相比無統(tǒng)計學(xué)差異(P=0.07)。結(jié)論:1.本研究顯示染色體10q25.3區(qū)域的rs7078160位點和16p13.3區(qū)域的rs8049367位點的多態(tài)性與黔北漢族人群NSCL/P的發(fā)生有關(guān)聯(lián)。2.染色體1q32.2區(qū)域的rs2235371位點、17p13.1區(qū)域的rs4791774位點和20q12區(qū)域的rs13041247位點,在黔北漢族人群NSCL/P中并未檢測到顯著關(guān)聯(lián)性。此外,rs2235371位點多態(tài)性可能不是黔北地區(qū)NSCL/P患者的發(fā)病因素,且母親在該位點的多態(tài)性可能是子代患病的保護(hù)因素。
【圖文】：

圖 1 目的片段 PCR 產(chǎn)物電泳圖注：泳道 M 為 DL 2000bp Marker，泳道 1、2 為 rs2235371 位點擴(kuò)增產(chǎn)物，440bp；泳道 3、 為 rs7078160 擴(kuò)增產(chǎn)物，550bp；泳道 5、6 為 rs8049367 位點擴(kuò)增產(chǎn)物，600bp；泳道 7、8 rs4791774 擴(kuò)增產(chǎn)物，600bp；泳道 9、10 為 rs13041247 擴(kuò)增產(chǎn)物，412bp）.2 5 個 SNP 位點的測序峰圖.2.1 rs2235371 位點測序峰圖結(jié)果rs2235371 位點在所有樣本中的測序結(jié)果共有三種基因型組成，分別是 CC生型（圖 2A）； CT 雜合突變型（圖 2B）； TT 純合突變型（圖 2C）。

圖 2 rs2235371 位點測序峰圖結(jié)果2.2.2 rs7078160 位點測序峰圖結(jié)果rs7078160 位點在所有樣本中的測序結(jié)果共有三種基因型組成，分別是 AA野生型（圖 3A）； AG 雜合突變型（圖 3B）； GG 純合突變型（圖 3C）。圖 3 rs7078160 位點測序峰圖結(jié)果
【學(xué)位授予單位】：遵義醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2019
【分類號】：R782.2

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