發(fā)布時(shí)間：2018-11-07 20:09

【摘要】：目的:通過對實(shí)驗(yàn)組前期口腔鱗癌組織與癌旁正常對照組織基因芯片檢測數(shù)據(jù)和前期蛋白組學(xué)實(shí)驗(yàn)篩選的52種差異蛋白進(jìn)行綜合分析,篩選出差異基因,通過熒光定量RT-PCR實(shí)驗(yàn)去驗(yàn)證這些差異基因在口腔鱗癌組織和癌旁正常對照組織中的表達(dá)。方法:(1)在前期實(shí)驗(yàn)組經(jīng)典蛋白組學(xué)實(shí)驗(yàn)篩選出的52種差異蛋白中,我們綜合口腔鱗癌的表達(dá)譜芯片檢測結(jié)果,選擇變化趨勢相同且差異相對較大的基因。(2)收集廣東省口腔醫(yī)院等手術(shù)切除的口腔鱗癌及癌旁正常組織各32份,通過熒光定量RT-PCR進(jìn)行較大樣本的驗(yàn)證并分析這些差異基因的相互作用關(guān)系。結(jié)果:經(jīng)過熒光定量RT-PCR驗(yàn)證后,GNB2L1、ARHGDIB、STMN1、LGALS7、EIF5A、TAGLN表達(dá)上調(diào),差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.001);S100A7、S100A8、S100A9、ANXA1、ANXA2、ANXA5、CSTB、CRYAB、SERPINB3表達(dá)下調(diào),差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.001)。在STRING構(gòu)建的作用網(wǎng)絡(luò)中RACK1蛋白與其他差異基因發(fā)生關(guān)系最多。結(jié)論:熒光定量RT-PCR驗(yàn)證差異基因的變化趨勢與基因表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)結(jié)果具有很好的一致性。RACK1蛋白是口腔鱗癌的一個(gè)關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)蛋白。
[Abstract]:Objective: to analyze the microarray data of oral squamous cell carcinoma (OSCC) and adjacent normal control group and 52 differentially expressed proteins screened by Prophase Proteomics experiment, and to screen out the differentially expressed genes. The expression of these differentially expressed genes in oral squamous cell carcinoma (OSCC) and adjacent normal control tissue was examined by fluorescence quantitative RT-PCR assay. Methods: (1) among the 52 differentially expressed proteins in the experimental group, we synthesized the expression microarray of oral squamous cell carcinoma (OSCC). (2) 32 cases of oral squamous cell carcinoma (OSCC) and 32 samples of adjacent normal tissues were collected from Guangdong Provincial Stomatological Hospital. Fluorescence quantitative RT-PCR was used to verify the large samples and to analyze the interaction of these differentially expressed genes. Results: the expression of GNB2L1,ARHGDIB,STMN1,LGALS7,EIF5A,TAGLN was up-regulated by fluorescence quantitative RT-PCR (P0. 001). The expression of S100A7, S100A8, S100A9, ANXA1, ANXA2 and ANXA5 was down-regulated, and the difference was statistically significant (P0.001). The RACK1 protein has the most relationship with other differentially expressed genes in the action network constructed by STRING. Conclusion: fluorescence quantitative RT-PCR verifies that the variation trend of differentially expressed genes is in good agreement with the results of gene expression microarray data. RACK1 protein is a key node protein in oral squamous cell carcinoma.
【作者單位】： 南方醫(yī)科大學(xué)附屬廣東省口腔醫(yī)院;四川大學(xué)華西公共衛(wèi)生學(xué)院健康與社會行為學(xué)系;廣東省深圳牙科醫(yī)療中心;
【基金】：廣東省醫(yī)學(xué)科學(xué)研究基金資助項(xiàng)目(編號:A2011092) 國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(編號:81271159/H1405)
【分類號】：R739.8

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