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齲源性牙髓炎的可疑致病微生物16S rDNA測序分析

發(fā)布時間:2018-06-24 12:58

  本文選題:16SrDNA + 牙髓感覺測試; 參考:《天津醫(yī)科大學(xué)》2017年碩士論文


【摘要】:目的通過獲取齲源性可復(fù)性牙髓炎的齲齒腐質(zhì)進行16SrDNA檢測,探索性研究因齲齒引起牙髓炎的細(xì)菌種類和數(shù)量特征與不同牙髓炎癥狀態(tài)的相關(guān)性,以期是否能找到一種簡便快捷的牙髓狀況判定方法。對象和方法取自天津醫(yī)科大學(xué)口腔醫(yī)院牙體牙髓科的可復(fù)性牙髓炎病例,通過牙髓活力問卷調(diào)查表,獲取牙髓活力判斷的臨床檢查指標(biāo),按照美國牙髓病學(xué)協(xié)會(American Association of Endodontists,AAE)的診斷標(biāo)準(zhǔn),明確診斷。共收集35例病例,其中齲源性可復(fù)性牙髓炎22例、齲源性不可復(fù)性牙髓炎8例和無癥狀深齲5例。再進一步細(xì)分為4組,分別是無熱刺激痛的可復(fù)性牙髓炎組(A1組)15例,有熱刺激痛的可復(fù)性牙髓炎組(A2組)7例,有癥狀不可復(fù)性牙髓炎組(B4組)8例,正常牙髓深齲對照組(B3組)5例。上橡皮障,收集齲齒窩洞腐質(zhì)樣本,送檢。采用MiSeq測序儀,對4組共35例樣本的齲齒腐質(zhì)內(nèi)細(xì)菌進行16S rDNA高變區(qū)測序,首先進行可操作分類單元(Operational Taxonomic Units,OTUs)聚類分析,研究具體OTUs及細(xì)菌的菌體種類,然后進行6種α多樣性分析,分析菌群物種的豐度,這6種指數(shù)分別為豐富度稀疏指數(shù)(Observed-species),香農(nóng)-威納指數(shù)(Shannon-Wiener Index),辛普森菌群多樣性指數(shù)(Simpson’s diversity Index),Chao1菌種豐富度指數(shù),ACE指數(shù),測序深度指數(shù)(Good-coverage)。然后進行β多樣性分析,研究4組組間和35例樣本間菌群分布的差異性,包括3個指標(biāo):主坐標(biāo)分析(Principal Co-ordinates Analysis,PCoA分析)、非度量多維尺度分析(non-metric multi-dimensional scaling,NMDS)和LEfSe分析(Linear Discriminant Analysis Effect Size)。然后,將樣本的OTUs檢測分析數(shù)據(jù)與已知明確的致齲菌、牙髓病細(xì)菌種屬進行比對,即首先將樣本測序數(shù)據(jù)與臨床檢查指標(biāo)數(shù)據(jù)行去趨勢分析(Detrended Correspondence Analysis,DCA分析),得到4個序列長軸的梯度值。參考第一序列長軸的梯度范圍,最大值為2.52,小于3,因此進一步做冗余分析(Redundancy Analysis,RDA分析)。結(jié)果35例患牙的齲齒腐質(zhì)分析,得到OTUs聚類6881種,共同優(yōu)勢菌屬為乳桿菌屬、放線菌屬、擬桿菌屬等。α多樣性分析見B4組分別與B3、A1、A2組比較無統(tǒng)計學(xué)差異(P0.05)。β多樣性分析可見與B3組比較,各組分別有多種細(xì)菌的含量較高,有統(tǒng)計學(xué)差異(P0.05)。A1組主要為放線菌和乳桿菌,A2組主要為β變形菌,B4組為加氏乳桿菌(L.gasseri)、發(fā)酵乳桿菌(L.fermentum)、干酪乳桿菌(L.casei)。鏈球菌屬(Streptococcus)、奈瑟氏菌屬(Neisseria)細(xì)菌數(shù)量與冷刺激痛強度、熱刺激痛強度呈正相關(guān)關(guān)系;放線菌屬(Actinomyces)細(xì)菌含量與熱刺激痛強度呈正相關(guān)關(guān)系;嗜冷桿菌屬(Psycnnlyobacter)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、氣單胞菌屬(Aeromonas)、擬桿菌屬(Bacteroides)的含量與牙髓電活力測試數(shù)值呈正相關(guān)關(guān)系;乳桿菌屬細(xì)菌的數(shù)量與冷刺激痛時間(CST)、熱刺激痛時間(HST)、自發(fā)痛強度(Sp)及患牙、對照牙間電活力數(shù)值差(CT)呈正相關(guān)關(guān)系。結(jié)論1.從正常牙髓深齲到無熱刺激痛的可復(fù)性牙髓炎,有熱刺激痛的可復(fù)性牙髓炎,再到有癥狀不可復(fù)性牙髓炎,這一動態(tài)病變進展過程中微生物多樣性具有一定的差異,細(xì)菌數(shù)量和豐度不同;正常牙髓、可復(fù)性牙髓炎的細(xì)菌菌群多樣性差別不大,而不可復(fù)性牙髓炎的細(xì)菌菌群多樣性降低。無熱刺激痛的可復(fù)性牙髓炎菌群分布與正常牙髓深齲類似,而同時有冷熱刺激痛的可復(fù)性牙髓炎菌群分布與有癥狀不可復(fù)性牙髓炎相似。2.乳桿菌屬與自發(fā)痛及冷熱刺激痛持續(xù)時間長短相關(guān),鏈球菌屬與冷熱刺激痛強度相關(guān);奈瑟菌屬、韋榮氏菌屬、弓形桿菌屬、嗜冷菌屬、假單胞菌屬、氣單胞菌屬、擬桿菌屬等與牙髓電活力測試數(shù)值正相關(guān)。乳桿菌屬可能與深齲逐漸發(fā)展為不可復(fù)性牙髓炎密切相關(guān)。鏈球菌屬、奈瑟菌屬、韋榮氏菌屬、弓形桿菌屬、嗜冷菌屬、假單胞菌屬、氣單胞菌屬、擬桿菌屬與牙髓的炎癥繼續(xù)發(fā)展從可復(fù)性牙髓炎轉(zhuǎn)變?yōu)椴豢蓮?fù)性牙髓炎有一定關(guān)系,而放線菌可能與牙髓炎與這一病變進展過程無直接關(guān)系。
[Abstract]:In order to find a simple and convenient method to determine the bacterial species and quantity of dental pulpitis , there were 5 cases with chronic dental pulpitis ( group A1 ) , 8 cases with chronic dental pulpitis and 5 cases of asymptomatic deep caries . The results showed that there were 22 cases of pulpitis , 8 cases with chronic dental pulpitis and 5 cases of asymptomatic deep caries . NMDS)鍜孡EfSe鍒嗘瀽(Linear Discriminant Analysis Effect Size). Then , comparing the OTUs detection and analysis data of the samples with known definite cariogenic bacteria and dental pulp bacteria species , the sample sequencing data and the clinical examination index data line de - trend analysis ( DCA analysis ) were first carried out to obtain the gradient values of the long axis of the four sequences . The gradient range of the long axis of the first sequence was referenced , the maximum value was 2.52 , and the maximum value was 2.52 , which was less than 3 , thus further redundant analysis ( RDA analysis ) was further done . Results The results showed that there were no statistically significant differences in the quantity of bacteria and the intensity of cold - stimulating pain ( P0.05 ) . The results showed that there were no statistically significant differences in the quantity of bacteria and the intensity of cold - stimulating pain ( P0.05 ) . The inflammation of the genus Aeromonas , the pseudobacterium and the pulp continued to develop from the allergic pulpitis to the irreversible pulpitis , and the actinomyces may have no direct relationship with the progression of the lesion .
【學(xué)位授予單位】:天津醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:R781.31

【參考文獻】

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本文編號:2061603

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