本文關(guān)鍵詞：基于數(shù)據(jù)整合策略挖掘阿爾茨海默病易感基因

  更多相關(guān)文章： 阿爾茨海默病 數(shù)據(jù)庫(kù)資源 易感基因 基因預(yù)測(cè)工具

【摘要】：目的闡明阿爾茨海默病(AD)已知致病基因的作用與新發(fā)現(xiàn)的相關(guān)基因,對(duì)研究阿爾茨海默病的發(fā)病機(jī)理有非常重要的作用,為臨床預(yù)防、診斷和治療提供靶點(diǎn)。方法從網(wǎng)站數(shù)據(jù)庫(kù)(OMIM、Alz Gene)搜集有關(guān)阿爾茨海默病的基因數(shù)據(jù)信息;運(yùn)用多種致病基因預(yù)測(cè)工具(Endeavour、Gene Prospector、GLAD4U、Proph Net)進(jìn)行生物分析,從而預(yù)測(cè)致病基因,并通過(guò)GENE、Pub Med數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行結(jié)果驗(yàn)證。結(jié)果從兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中直接獲取阿爾茨海默病致病基因,利用4種工具軟件獲取阿爾茨海默病相關(guān)基因(篩選出基因出現(xiàn)次數(shù)≥3的基因),將數(shù)據(jù)信息進(jìn)行整合,得到一個(gè)含有25個(gè)基因的列表,這些基因包括CALHM1、ABCA7、A2M、CLU、SORL1、HFE、CD2AP、APP、ACE、PICALM、APOE、NOS3、MS4A6A、PLD3、CR1、ADAM10、MS4A4E、BLMH、PSEN1、CD33、PSEN2、MPO、APBB2、BIN1和PLAU。結(jié)論 CALHM1、ABCA7、A2M、CLU等基因與阿爾茨海默病有一定的相關(guān)性,為阿爾茨海默病基因?qū)W的進(jìn)一步研究和臨床治療方面的應(yīng)用提供理論依據(jù)。
【作者單位】： 首都醫(yī)科大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院生物信息學(xué)系;北京腦重大疾病研究院阿爾茨海默病研究所;
【關(guān)鍵詞】： 阿爾茨海默病 數(shù)據(jù)庫(kù)資源 易感基因 基因預(yù)測(cè)工具
【基金】：科技部“973”項(xiàng)目(No.2014CB744604) 北京市教委科技計(jì)劃面上項(xiàng)目(No.KM201010025004;No.KM201410025013) 北京市腦重大疾病研究院基金項(xiàng)目(No.BIBDPXM2014_014226_000016)
【分類(lèi)號(hào)】：R749.16
【正文快照】： [本文著錄格式]王美琴,楊鎧冰,冀燃,等.基于數(shù)據(jù)整合策略挖掘阿爾茨海默病易感基因[J].中國(guó)康復(fù)理論與實(shí)踐,2015,21(10):1117-1123.CITED AS:Wang MQ,Yang KB,Ji R,et al.Mining Alzheimer's disease susceptible genes based on data integration strategy[J].Zhongguo Kangf

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：940568