本文關(guān)鍵詞：對DNA微陣列數(shù)據(jù)的聚類以識別阿爾茨海默病的相關(guān)基因

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【摘要】：阿爾茨海默病簡稱AD病是一種較為嚴(yán)重的癡呆癥,目前為止全世界AD病的患者數(shù)量正持續(xù)不斷增加,而從醫(yī)學(xué)的角度還尚未能明確其致病機(jī)理。本文核心思想是建立新的算法模型,挖掘出基因數(shù)據(jù)表達(dá)特征,列出可能與AD病相關(guān)的基因。聚類分析(Cluster Analysis)又稱聚類,是將對象或觀測劃分成子集的過程。每一個(gè)子集是一個(gè)簇,使得簇中的對象相似度較高,但與其他簇中的數(shù)據(jù)對象卻極為不相似,它可能將引發(fā)基因數(shù)據(jù)內(nèi)事先未知的群組的發(fā)現(xiàn)。本文在設(shè)計(jì)新算法前加上了聚類的思想以篩選出可能與AD病相關(guān)的基因。在本文中,首先引入聚類的思想,將一個(gè)簇視為在相同的實(shí)驗(yàn)環(huán)境下產(chǎn)生的,標(biāo)記為同一類,因此,不同的簇之間看作為不同的實(shí)驗(yàn)條件,這里標(biāo)記為不同類。再次,將一個(gè)類心組中的一致表達(dá)(即一致上升或一致下降)的基因篩選出來。若篩選出的基因在每一個(gè)類心組中都顯示著同樣的特征,則該基因亦被篩選出來,在本文中視為可能與AD病相關(guān)的基因。本文共篩選出144個(gè)可能與AD病相關(guān)的基因,附錄2中標(biāo)記的8個(gè)基因已經(jīng)被某些權(quán)威文獻(xiàn)總結(jié)出與AD病有關(guān)。對這里基因進(jìn)行基于位置和功能的檢索,推測出將可能導(dǎo)致AD病的相關(guān)結(jié)論：(1)位于膜上的基因由信號傳導(dǎo)異常而可能引發(fā)AD病(2)阿爾茲海默病很可能是由神經(jīng)細(xì)胞增值過程紊亂造成的。(3)AD病很可能和與鋅離子結(jié)合的基因有關(guān).并且這些基因參與的信號通路異常：文章總結(jié)了11個(gè)與AD病相關(guān)的基因,將每個(gè)基因的passway匯總后形成較為完整的AD病致病機(jī)理passways。
【關(guān)鍵詞】：阿爾茨海默氏病(AD) 基因 DNA微陣列 通路圖
【學(xué)位授予單位】：四川師范大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R749.16
【目錄】：

• 摘要4-5
• Abstract5-7
• 1 緒論7-11
• 1.1 AD病的研究簡介7-9
• 1.2 基因芯片技術(shù)及其應(yīng)用9-10
• 1.3 本文的主要工作10-11
• 2 預(yù)備知識11-14
• 2.1 基因芯片對應(yīng)于AD病的基因數(shù)據(jù)的組織結(jié)構(gòu)11
• 2.2 本文算法思想的引入11-12
• 2.3 本章小結(jié)12-14
• 3 算法設(shè)計(jì)及實(shí)現(xiàn)結(jié)果14-18
• 3.1 模型建立的主要思想14
• 3.2 數(shù)學(xué)模型14-15
• 3.3 算法的程序結(jié)構(gòu)示意圖15
• 3.4 算法的實(shí)現(xiàn)步驟15-16
• 3.5 算法實(shí)現(xiàn)結(jié)果16-17
• 3.6 本章小結(jié)17-18
• 4 AD候選基因分析18-27
• 4.1 基于位置和功能對候選基因進(jìn)行分析18-21
• 4.2 與金屬離子結(jié)合的相關(guān)基因探究21-25
• 4.3 相關(guān)基因潛藏的病源25-26
• 4.4 本章小結(jié)26-27
• 5 結(jié)論27-29
• 參考文獻(xiàn)29-33
• 附錄33-43
• 致謝43

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前4條

1 裘敏燕,李瑤,謝毅,毛裕民;基因芯片技術(shù)及其應(yīng)用[J];第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào);2001年06期

2 梁忠英,龐朝陽;針對向量量化的一種新的計(jì)算機(jī)體系結(jié)構(gòu)[J];四川師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2003年06期

3 林樹無;;簡述阿爾茨海默病[J];沈陽醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2013年01期

4 李強(qiáng);曹明溶;劉志龍;蔣建偉;;去氫駱駝蓬堿誘導(dǎo)HepG2細(xì)胞凋亡并增強(qiáng)其對5-氟尿嘧啶和順鉑的敏感性[J];中國病理生理雜志;2013年02期

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本文編號：829569